本文選題：手足口病　切入點(diǎn)：流行趨勢(shì)　出處：《復(fù)旦大學(xué)》2012年碩士論文

【摘要】：本次課題通過收集2005年-2010年靜安區(qū)手足口病常規(guī)報(bào)表、監(jiān)測(cè)資料等分析手足口病的流行趨勢(shì)。應(yīng)用RT-PCR、細(xì)胞培養(yǎng)等實(shí)驗(yàn)技術(shù)對(duì)2009年-2010年監(jiān)測(cè)點(diǎn)手足口病病例標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),分析引起手足口病的病毒病原型別分布和腸道病毒EV71的VP1基因特征,以了解靜安區(qū)手足口病的流行規(guī)律和分子流行病學(xué)特征。通過實(shí)驗(yàn)研究不同濃度含氯消毒劑對(duì)腸道病毒71型的滅活效果,從而為指導(dǎo)本區(qū)手足口病防控措施的制定提供依據(jù)。本課題研究?jī)?nèi)容包括以下幾個(gè)內(nèi)容：1.上海市靜安區(qū)2005-2010年手足口病流行特征分析 2005年發(fā)病率為20.44/10萬(wàn),2006年為18.72/10萬(wàn),2006年較2005年有所下降。2007年發(fā)病率為31.32/10萬(wàn),2008年為24.84/10萬(wàn),較2007年有所下降。2009、2010年手足口病的發(fā)病率均較2008年有所上升,但2005-2010年靜安區(qū)本市人口手足口病年發(fā)病率以2007年最高。發(fā)病高峰集中在每年的5-7月份,2009年11月還出現(xiàn)第二個(gè)發(fā)病高峰。手足口病的年發(fā)病率以位于靜安區(qū)西北部的曹家渡和江寧街道較高,其他街道總體發(fā)病率較低。男女性別比約為1.4：1,5歲以下兒童比例達(dá)到83.80%。以幼托機(jī)構(gòu)兒童比例最多。2.上海市靜安區(qū)2009-2011年手足口病病原監(jiān)測(cè)結(jié)果分析 2009-2011年分別收集監(jiān)測(cè)點(diǎn)上海市兒童醫(yī)院臨床診斷手足口病例咽拭、肛拭標(biāo)本90份、180份和242份,采用Real-time RT-PCR方法進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示,2009-2011年間,監(jiān)測(cè)點(diǎn)兒童手足口病例中柯薩奇病毒A16型(CA16)陽(yáng)性率逐年下降,而腸道病毒71型(EV71)和腸道病毒屬其他病毒(EV)陽(yáng)性率呈上升趨勢(shì)。 對(duì)2010年7月至2011年12月監(jiān)測(cè)點(diǎn)臨床診斷手足口病例175例分別采集咽拭和肛拭標(biāo)本,分別用Real-time RT-PCR方法進(jìn)行EV71、CA16、EV檢測(cè)。用McNemar檢驗(yàn)比較兩種標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果的差異,EV71和EV在咽拭子和肛拭子兩種標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果有差異,P值均0.05,CA16在兩種標(biāo)本中的檢測(cè)結(jié)果無顯著差異。應(yīng)用Kappa檢驗(yàn),Kappa值均0.4,顯示咽拭子和肛拭子的檢測(cè)結(jié)果基本一致。根據(jù)本次實(shí)驗(yàn)配對(duì)標(biāo)本檢測(cè)EV71、CA16、EV結(jié)果不一致與標(biāo)本采集時(shí)間進(jìn)行分析,推斷腸道病毒可能在發(fā)病2天內(nèi)在咽部大量繁殖擴(kuò)增,此時(shí)通過呼吸道傳播的可能性較大。 將2010年7月至2011年12月監(jiān)測(cè)點(diǎn)臨床診斷手足口病例采集的175對(duì)咽拭和肛拭標(biāo)本Real-time RT-PCR檢測(cè)結(jié)果按照標(biāo)本采集時(shí)間進(jìn)行分析,對(duì)于EV71來說,咽拭標(biāo)本在發(fā)病后3天、4-11天均可檢出陽(yáng)性,而CA16、EV在發(fā)病3天后都無法檢出陽(yáng)性,說明EV71在呼吸道帶毒持續(xù)時(shí)間長(zhǎng)于CA16和腸道病毒屬病毒。 3.上海市靜安區(qū)人腸道病毒71型基因進(jìn)化研究 隨機(jī)選擇2010年不同月份19份PCR陽(yáng)性的標(biāo)本進(jìn)行Vero細(xì)胞培養(yǎng),其中1例為重癥培養(yǎng)物、18份為非重癥培養(yǎng)物,對(duì)EV71病毒PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列(VPl基因1200bp)系統(tǒng)發(fā)生分析,所有19株EV71病毒與2007年山東及2008年安徽阜陽(yáng)EV71分離株同屬C基因型中的C4a亞型。 將本次研究的19株EV71分離株的VPl基因與從GenBank中檢索到EV71各基因型和亞型的代表株序列,包括A、B、Cl、C2、C3、C4和C5亞型進(jìn)行氨基酸和核苷酸同源性分析,其中C4亞型選擇的是2008年安徽省阜陽(yáng)市流行株。分析發(fā)現(xiàn),19株EV71分離株的VP1基因與C基因型代表株核苷酸同源性在84.3%-97.1%,氨基酸同源性在88.6%-98.3%；與C4基因亞型最為相近,其核苷酸同源性在95.0%-97.1%,氨基酸同源性在95.1%-98.3%。 我國(guó)自1998年從廣東省分離鑒定出C4b亞型EV71分離株后,至2003年國(guó)內(nèi)EV71亞型一直為C4b。2003-2004年,EV71的C4a和C4b兩個(gè)亞型在我國(guó)共存,如浙江、廣東、臺(tái)灣。從2005年至今,上海、河南、云南、北京、山東、安徽、浙江等地分離到的EV71均為C4a亞型,重癥和散發(fā)病例基因型相同無差異。而美國(guó)、澳大利亞、馬來西亞、新加坡、日本等國(guó)在不同時(shí)間段內(nèi)都曾出現(xiàn)過不同的EV71基因亞型。 4.含氯消毒劑對(duì)腸道病毒71型滅活效果的研究 腸道病毒71型主要通過糞口途徑和密接接觸傳播。目前,上海地區(qū)幼托機(jī)構(gòu)通常使用有效氯濃度為500mg/L的含氯消毒劑對(duì)兒童的玩具、毛巾及課桌、門把手等物體表面進(jìn)行消毒。因此,我們通過試驗(yàn)研究觀察了該濃度含氯消毒劑對(duì)懸液內(nèi)EV71病毒的殺滅效果。由于消毒劑對(duì)細(xì)胞的毒性,本次實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)有效氯濃度為500mg/L的含氯消毒劑作用5min即可對(duì)懸液中的EV71病毒達(dá)到至少99.99%的殺滅率；與有效氯濃度為1000mg/L的含氯消毒劑殺滅率相一致。由于試驗(yàn)采用的為病毒懸液,消毒劑與腸道病毒能夠直接接觸作用,但在日常消毒工作中,含氯消毒劑對(duì)包裹在毛巾、衣物中的病毒的殺滅作用會(huì)受到物品中有機(jī)物、靜電吸附等因素的影響。因此,對(duì)于懷疑有手足口病患兒接觸污染的物品,可通過提高有效氯濃度(1000mg/L或更高)或延長(zhǎng)消毒劑作用時(shí)間進(jìn)行消毒處理,保證病毒滅活效果,預(yù)防手足口病的傳播。
[Abstract]:This topic through the collection of 2005 -2010 Jingan District HFMD routine report, epidemic trend analysis of monitoring data of HFMD. The application of RT-PCR, cell culture techniques were on hand foot mouth disease in 2009 -2010 monitoring points were detected, analyzed VP1 gene distribution type virus and enterovirus EV71 HFMD the cause, in order to understand the epidemiology and molecular epidemiology of HFMD in Jingan District. Through the experimental study of different concentrations of chlorine disinfectant on enterovirus 71 inactivation effect, so as to guide the prevention and control measures in the area of foot and mouth disease to provide basis for the establishment of the research content of the thesis includes the following contents: analysis of Shanghai 1. Jingan District 2005-2010 HFMD epidemic characteristics
In 2005, the incidence rate of 20.44/10 million, 18.72/10 million in 2006 2006, declined in 2005.2007 years the incidence rate of 31.32/10 million, 24.84/10 million in 2008, declined in 2007.20092010 years of HFMD incidence increased compared to 2008, but 2005-2010 years of hand foot mouth disease in Jingan District population of the city the annual incidence rate was highest in 2007. The peak incidence occurred in every 5-7 months, in November 2009 second. The peak incidence of HFMD incidence in the northwest of Jingan District and Jiangning Caojiadu street high street the other overall incidence is relatively low. The proportion of male and female sex ratio for children under the age of 1.4:1,5 years old 83.80%. in preschools of the proportion of children the most.2. of Shanghai city Jingan District 2009-2011 years HFMD pathogen surveillance results
2009-2011 years of monitoring points were collected in Shanghai Children's Hospital clinical diagnosis of HFMD cases of pharyngeal swab, anal swab specimens of 90 copies, 180 copies and 242 copies, using Real-time RT-PCR method. Results showed that 2009-2011 years of monitoring points children HFMD cases in Coxsackie virus type A16 (CA16) positive rate decreased year by year, and enterovirus 71 type (EV71) and other enterovirus virus (EV) positive rate increased.
On July 2010 to December 2011 monitoring of clinical diagnosis of 175 cases of HFMD cases were collected from throat swabs and anal swabs, respectively using Real-time RT-PCR method EV71, CA16, EV detection. Differences with McNemar test comparison of two samples of test results, EV71 and EV in throat swabs and anal swabs of two specimen test results the difference, P value was 0.05, CA16 was detected in two samples showed no significant difference. The application of Kappa test, Kappa value was 0.4, showed that the detection of throat swabs and anal swabs were basically the same. According to the experimental paired samples to detect EV71, CA16, EV, the result is not consistent with the time of sample collection analysis of enteric viruses in the pathogenesis may be inferred within 2 days of pharyngeal multiply amplification, this time through the possibility of the spread of the respiratory tract.
From July 2010 to December 2011 will be monitoring the clinical diagnosis of HFMD cases of 175 throat swabs and anal swabs, Real-time RT-PCR test results according to the specimen collection time were analyzed for EV71, pharynx swabs in 3 days after the onset, 4-11 days can be detected, and CA16, EV in 3 days after the onset are not positive, EV71 in the respiratory tract with poison duration is longer than CA16 and intestinal virus.
Study on the evolution of enterovirus 71 gene in 3. Jingan District people in Shanghai
In 2010 were randomly selected in different months 19 PCR positive specimens were cultured in Vero cells, including 1 cases of severe culture, 18 non severe cultures of EV71 virus PCR amplified sequences (VPl gene 1200bp) phylogenetic analysis, all 19 strains of EV71 virus in Shandong in 2007 and 2008 Anhui Fuyang EV71 isolates belong to the C genotype in C4a subtype.
The study of the 19 strains of VPl gene of EV71 isolates and representatives of retrieved EV71 genotypes and subtypes from strains of GenBank in the series, including A, B, Cl, C2, C3, C4 and C5 subtype analysis of amino acid and nucleotide sequence, which subtype C4 is the choice of Fuyang in 2008 Anhui city epidemic strains. Analysis showed that 19 strains of VP1 genes and C genes of EV71 isolate type strains nucleotide homology in 84.3%-97.1%, amino acid homology in 88.6%-98.3%; and C4 genotype was most similar to that of the nucleotide homology in amino acid homology in 95.1%-98.3%. 95.0%-97.1%.
Our country since 1998 from Guangdong Province, isolation and identification of C4b subtype EV71 isolates, to 2003 domestic EV71 subtype has been C4b.2003-2004, EV71 C4a and C4b two subtypes in China such as Zhejiang, Guangdong, the coexistence of Taiwan. Since 2005, Shanghai, Henan, Yunnan, Beijing, Shandong. Anhui, Zhejiang and other places of the isolated EV71 were C4a subtype, severe and sporadic cases of the same genotype had no difference. And the United States, Australia, Malaysia, Singapore, Japan and other countries in different period had different EV71 subtypes.
The effect of 4. chlorine containing disinfectant on inactivation of enterovirus type 71
Enterovirus 71 is mainly through the fecal oral route and contact transmission. At present, the Shanghai area preschools are usually used for toys available chlorine concentration 500mg/L of chlorine containing disinfectant on children, towels and desks, disinfection door handles and other surfaces. Therefore, we observed the effect of the concentration of chlorine containing disinfectant in killing in suspension EV71 the virus from the test results. Because of the toxicity of disinfectant on cells, this experiment found the effective chlorine concentration 5min chlorine disinfectant effect of 500mg/L can be reached at least 99.99% of the killing rate of suspension of EV71 virus; and the effective chlorine concentration for the killing rate of 1000mg/L chlorine disinfectant is consistent. Because the test used for virus suspension liquid, disinfectant and intestinal virus can directly contact, but in the daily work of disinfection, chlorine disinfectants to wrapped in a towel, clothes in the killing effect by virus Organic items, effects of electrostatic adsorption and other factors. Therefore, for suspected HFMD contact with contaminated items, by increasing the concentration of effective chlorine (1000mg/L or more) or to extend the time of disinfectant disinfection, ensure the virus inactivation effect, prevent the spread of foot and mouth disease.

【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號(hào)】：R725.1;R181.3

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本文編號(hào)：1654240