重慶地區(qū)人鼻病毒和腸道病毒D68在呼吸道感染住院患兒中的分子流行病學(xué)研究
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【摘要】:第一部分 人鼻病毒亞型及其病毒載量與兒童重癥呼吸道感染的關(guān)系研究背景及目的:人鼻病毒(Human rhinovirus, HRV)不僅引起普通感冒,還與支氣管炎、毛細(xì)支氣管炎、肺炎和哮喘急性發(fā)作有關(guān)。HRV感染導(dǎo)致嚴(yán)重急性呼吸道感染(Acute respiratory tract infection, ARTI)與病毒亞型和載量有關(guān),但HRV各亞型及其病毒載量與嚴(yán)重ARTI之間的關(guān)系尚未徹底闡明。本研究目的在于探討重慶地區(qū)ARTI住院兒童中HRV不同亞型的臨床特點(diǎn),尤其在導(dǎo)致重癥呼吸道感染方面的差異,另一方面探討HRV不同亞型的病毒載量與重癥呼吸道感染之間的關(guān)系。方法:收集2012年1月到2014年11月在重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院呼吸中心ARTI住院患兒的鼻咽抽吸物(Nasopharyngeal aspirate, NPA)標(biāo)本,采用多種PCR方法對(duì)常見呼吸道病毒進(jìn)行檢測(cè)。通過測(cè)定VP4/VP2區(qū)域序列鑒別HRV亞型,HRV陽(yáng)性標(biāo)本采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法進(jìn)行病毒載量測(cè)定。結(jié)果:1876份NPA標(biāo)本中檢出HRV 473份(25.2%),VP4/VP2序列分析結(jié)果顯示HRV-A 254份(53.7%)、HRV-B 28份(5.9%),HRV-C122份(25.8%),未分型69份(14.6%)。HRV-C與HRV-A比較發(fā)現(xiàn)除HRV-C檢出患兒更易出現(xiàn)喘息癥狀外(66.2% vs.45.4%,P=0.007),其他臨床特點(diǎn)均無差異,包括在致重癥肺炎和重癥哮喘發(fā)作方面。Logistic回歸分析表明HRV各亞型在引起重癥病例(包括重癥肺炎和重癥哮喘發(fā)作)方面無差異。以106copies/mL來劃分病毒高載量和低載量,HRV單一檢出時(shí),HRV-A高載量組更易出現(xiàn)重癥肺炎(36.4% vs.12.7%,P=0.023);但HRV-C高低載量組間在致重癥肺炎方面無差異(25.0% vs.25.0%,P=0.559)。年齡2歲患兒,重癥肺炎組HRV-A病毒載量較非重癥肺炎組高(4.7×105 copies/mL vs.8.1×104 copies/mL, P=0.042);重癥肺炎組HRV-C與非重癥肺炎組間病毒載量無差異(7.9×103 copies/mL vs.1×104 copies/mL, P=0.589)。結(jié)論:重慶地區(qū)HRV是引起急性呼吸道感染住院患兒的重要病原體,HRV-C較HRV-A更易引起患兒喘息,但在致重癥肺炎和重癥哮喘發(fā)作方面具有相同毒力;2歲以下兒童中,HRV-A感染引起重癥肺炎可能與病毒高載量有關(guān)。第二部2012-2014年重慶地區(qū)腸道病毒D68在呼吸道感染住院患兒中的分子流行病學(xué)研究背景及目的:人腸道病毒D68 (Human enterovirus-D68, HEV-D68)屬于腸道病毒D組,是罕見病毒,偶可引起呼吸系統(tǒng)感染。2014年8月HEV-D68在美國(guó)和加拿大爆發(fā)流行,導(dǎo)致嚴(yán)重的呼吸道疾病。重慶地區(qū)呼吸道感染病毒監(jiān)測(cè)平臺(tái)發(fā)現(xiàn)HEV-D68在2014年9月和10月較以往明顯升高,這一升高趨勢(shì)與北美洲的爆發(fā)相一致。本研究對(duì)重慶地區(qū)HEV-D68分離株的臨床特征和基因特點(diǎn)進(jìn)行分析。方法:收集2012年1月到2014年11月在重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院呼吸中心呼吸道感染住院患兒的鼻咽抽吸物(nasopharyngeal aspirate, NPA)標(biāo)本,采用多種PCR方法對(duì)常見呼吸道病毒進(jìn)行檢測(cè),HEV-D68陽(yáng)性的標(biāo)本經(jīng)PCR方法擴(kuò)增全基因組序列,與GenBank中收錄的HEV-D68基因序列進(jìn)行進(jìn)化樹分析。結(jié)果:1876份NPA標(biāo)本中檢出HEV 26份(1.4%),其中HEV-D6819份(1.0%,19/1876),2014年9月和10月,IEV-D68 陽(yáng)性率為9.8%(13/132)。VPl基因系統(tǒng)發(fā)育樹分析表明19例HEV-D68屬于A和B兩個(gè)亞型,且2014年9月和10月的13株分離株均屬于B亞型。全基因組系統(tǒng)發(fā)育樹分析表明本研究HEV-D68分離株與2014年美國(guó)爆發(fā)的主要流行株高度同源。5’UTR序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)B亞型存在2個(gè)堿基片段缺失,為681-703和717-728。19例HEV-D68檢出患兒,13例(68.4%)患兒既往有反復(fù)喘息病史,13例(68.4%)患兒診斷為哮喘,其中11例為哮喘急性發(fā)作(重度:5例,中度:6例)。HEV-D68單獨(dú)檢出有8例,單獨(dú)檢出組診斷為哮喘的患兒較混合檢出組多(100%vs.45.5%,P=0.018)。與2012年和2013年的9月和10月比較發(fā)現(xiàn),2014年9月和10月HEV-D68為哮喘急性發(fā)作住院患兒的主要病原體。結(jié)論:重慶地區(qū)流行的HEV-D68主要為A和B亞型,在2014年9月和10月,B亞型出現(xiàn)升高流行;既往反復(fù)喘息病史是兒童感染HEV-D68的危險(xiǎn)因素,誘發(fā)哮喘急性發(fā)作是HEV-D68的一個(gè)臨床特點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R725.6
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