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LAMP與PCR技術(shù)在兒童肺炎支原體檢測(cè)中的應(yīng)用及昆明地區(qū)肺炎支原體流行病學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-10-21 18:02

  本文關(guān)鍵詞:LAMP與PCR技術(shù)在兒童肺炎支原體檢測(cè)中的應(yīng)用及昆明地區(qū)肺炎支原體流行病學(xué)分析


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【摘要】:目的:肺炎支原體是引起兒童支原體肺炎的主要病原體,也是兒童呼吸道感染的常見病原體之一。臨床上常用血清學(xué)檢測(cè)方法與其他常見呼吸道病原體嗜肺軍團(tuán)菌(Legionella Pneumophila, LP)、Q熱立克次體(Coxiella burnetii, CB)、肺炎衣原體(Chlamydia pneumoniae, CP)、腺病毒(Adenoviridae, ADV)、呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus, RSV)、甲型流感病毒(Influenza A virus)、乙型流感病毒(Influenza B virus)和副流感病毒(HPIVs)共同檢測(cè)。肺炎支原體感染常見于兒童,成人中也可感染。臨床上肺炎支原體可通過(guò)紅霉素,四環(huán)素與氯霉素等大環(huán)內(nèi)酯類抗生素進(jìn)行控制與治療。是否能夠準(zhǔn)確的檢測(cè)出致病病原,從而采取有效措施進(jìn)行疾病防控,這一直是目前的研究重點(diǎn)。分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)已經(jīng)廣泛用于臨床診斷,其中PCR技術(shù)目前已經(jīng)研究得十分成熟。相比之下環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)屬于近20年來(lái)新發(fā)展的分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)。本試驗(yàn)建立LAMP檢測(cè)肺炎支原體的方法,與PCR技術(shù)對(duì)比,討論兩種方法的特點(diǎn)以及特異性及敏感度。方法:通過(guò)LAMP引物專業(yè)軟件設(shè)計(jì)4條引物,建立起LAMP檢測(cè)肺炎支原體的方法;讓檢測(cè)樣本與常見的呼吸道病原體嗜肺軍團(tuán)菌與腺病毒同時(shí)進(jìn)行LAMP反應(yīng),驗(yàn)證所設(shè)計(jì)LAMP檢測(cè)方法的特異性。對(duì)標(biāo)準(zhǔn)量的MP-DNA以加倍稀釋的方法同時(shí)進(jìn)行LAMP及PCR反應(yīng),對(duì)比兩種方法的敏感度。結(jié)論:結(jié)果顯示LAMP特異性強(qiáng),在嗜肺軍團(tuán)菌與腺病毒共同進(jìn)行LAMP反應(yīng)中無(wú)擴(kuò)增;LAMP在檢測(cè)肺炎支原體的實(shí)驗(yàn)中敏感度高于PCR,LAMP技術(shù)可檢測(cè)稀釋10-4的樣本,而PCR可檢測(cè)出稀釋10-2的樣本,LAMP技術(shù)在檢測(cè)肺炎支原體上的敏感度高于PCR。目的:肺炎支原體(mycoplasma pneumoniae, MP)是兒童社區(qū)獲得性肺炎的常見病原體,全年均可發(fā)病。其最常見的臨床表現(xiàn)為呼吸道癥狀,如發(fā)熱,咳嗽,氣喘等,還可引起多種肺外并發(fā)癥,如腦炎,心肌炎,皮膚傷害,泌尿系統(tǒng)及消化道受累等癥狀,少數(shù)患兒可同時(shí)發(fā)生多種并發(fā)癥,若不及時(shí)干預(yù),嚴(yán)重者可危及生命。本次對(duì)我院2014年度因肺炎住院的患兒的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,旨在為臨床早期合理診斷與治療提供科學(xué)依據(jù)。方法:選取2014年1月-2014年12月被診斷為肺炎的住院患兒,收集到3256例患兒的血清,運(yùn)用間接免疫熒光技術(shù)(Indirect immunofluorescence assay.IIFA)檢測(cè)MP特異性抗體MP-IgM。結(jié)果:在3256例小兒血清中春季陽(yáng)性率為10.6%,夏季為14.2%,秋季為25.8%,冬季為35.1%。平均發(fā)病率為21.4%,通過(guò)SPSS 17.0分析數(shù)據(jù)可以得知四季發(fā)病率間有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),其中秋冬季檢出率明顯高于其他兩季,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。1歲的陽(yáng)性率為8%;1-3歲陽(yáng)性病例為108例,陽(yáng)性率為13%;3-6歲陽(yáng)性率為21%;6歲陽(yáng)性率為22%。我們通過(guò)SPSS17.0(P0.05)分析可得不同年齡間的數(shù)據(jù)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,其中3-6歲以上的兒童的發(fā)病率明顯高于其他的年齡組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論:昆華醫(yī)院入院的肺炎支原體肺炎(mycoplasma pneumoniae pneumonia, MPP)患兒中,秋冬季為高發(fā)期,.其中3-6歲的患兒為易感人群。
【關(guān)鍵詞】:肺炎支原體 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增 聚合酶鏈反應(yīng) 肺炎 兒童 肺炎支原體 肺炎支原體肺炎 年齡 季節(jié)
【學(xué)位授予單位】:昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R725.6
【目錄】:
  • 第一部分 摘要6-7
  • Part Ⅰ Abstract7-8
  • 第二部分 摘要8-9
  • Part Ⅱ Abstract9-13
  • 縮略詞13-15
  • 第一部分 LAMP與PCR技術(shù)在兒童肺炎支原體檢測(cè)中的應(yīng)用15-41
  • 第一章 緒論15-28
  • 1.1 病原學(xué)15-16
  • 1.2 肺炎支原體常見的保守序列16-17
  • 1.2.1 P1基因16
  • 1.2.2 P30基因16
  • 1.2.3 P116基因16-17
  • 1.3 診斷方法的研究進(jìn)展17-20
  • 1.3.1 分離培養(yǎng)法17
  • 1.3.2 血清學(xué)檢測(cè)方法17-19
  • 1.3.3 分子基因檢測(cè)方法19-20
  • 1.4 恒等溫?cái)U(kuò)增方法簡(jiǎn)介20-26
  • 1.4.1 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)21
  • 1.4.2 核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)21-23
  • 1.4.3 環(huán)節(jié)導(dǎo)恒等溫?cái)U(kuò)展技術(shù)原理23-25
  • 1.4.4 環(huán)節(jié)導(dǎo)恒等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的特點(diǎn)25-26
  • 1.4.5 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的應(yīng)用26
  • 1.5 研究目的及意義26-28
  • 第二章 材料與方法28-35
  • 2.1 材料與儀器28-29
  • 2.1.1 主要試劑28
  • 2.1.2 試劑的配制28-29
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)儀器29-30
  • 2.3 實(shí)驗(yàn)方法30-31
  • 2.3.1 標(biāo)本來(lái)源30-31
  • 2.3.2 PCR引物的設(shè)計(jì)31
  • 2.4 樣本采集與DNA的提取31-32
  • 2.5 反應(yīng)體系優(yōu)化32-33
  • 2.5.1 PCR反應(yīng)體系32
  • 2.5.2 LAMP反應(yīng)體系32-33
  • 2.6 特異性檢測(cè)33
  • 2.7 敏感度檢測(cè)33-35
  • 2.7.1 LAMP反應(yīng)的敏感度檢測(cè)33-34
  • 2.7.2 PCR反應(yīng)的敏感度檢測(cè)34-35
  • 第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析35-38
  • 3.1 PCR反應(yīng)的構(gòu)建35
  • 3.2 LAMP反應(yīng)的構(gòu)建35-36
  • 3.3 LAMP特異性的研究36
  • 3.4 PCR反應(yīng)的敏感度36-37
  • 3.5 PCR反應(yīng)的敏感度37-38
  • 第四章 討論38-40
  • 第五章 結(jié)論與展望40-41
  • 5.1 結(jié)論40
  • 5.2 展望40-41
  • 第二部分 昆華醫(yī)院肺炎支原體發(fā)病情況的分析41-59
  • 第一章 緒論41-50
  • 1.1 流行病學(xué)41
  • 1.2 MP傳播途徑及臨床表現(xiàn)41-44
  • 1.2.1 MP傳播途徑41-42
  • 1.2.2 MP臨床表現(xiàn)42-44
  • 1.3 致病機(jī)理的研究44-46
  • 1.4 肺炎支原體的防控46-47
  • 1.5 其他地區(qū)肺炎支原體流行病學(xué)調(diào)查47-48
  • 1.6 研究目的及意義48-50
  • 第二章 材料與方法50-52
  • 2.1 材料50
  • 2.1.1 血清的采集50
  • 2.2 臨床血清學(xué)檢測(cè)方法50-51
  • 2.3 實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)結(jié)果判定51
  • 2.3.1 陽(yáng)性結(jié)果判定51
  • 2.3.2 陰性結(jié)果判定51
  • 2.4 臨床資料的收集51
  • 2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析51-52
  • 第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析52-56
  • 3.1 肺炎支原體肺炎診斷標(biāo)準(zhǔn)52
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)結(jié)果的判定52-53
  • 3.3 不同季節(jié)的感染情況53-54
  • 3.4 不同年齡段的感染情況54-56
  • 第四章 討論56-58
  • 第五章 結(jié)論與展望58-59
  • 5.1 結(jié)論58
  • 5.2 展望58-59
  • 參考文獻(xiàn)59-68
  • 致謝68-70
  • 文獻(xiàn)綜述70-74
  • 參考文獻(xiàn)72-74
  • 附錄A 論文發(fā)表74-75
  • 附錄B 其他需要說(shuō)明內(nèi)容75

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本文編號(hào):1074602


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