血液提取總RNA方法的優(yōu)化及其在支氣管肺發(fā)育不良患兒血液內(nèi)TLK1表達(dá)的應(yīng)用
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更多相關(guān)文章: TRIZOL法 全血RNA 支氣管肺發(fā)育不良 TLK1 Real-Time PCR
【摘要】:研究背景 在臨床上,已有多種針對疾病的輔助檢查,其中通過血液的檢查占多數(shù),血液檢查具有操作簡便、標(biāo)本易取及對被檢查者創(chuàng)傷相對較小的優(yōu)點(diǎn),但也存在一些缺點(diǎn),如操作頻繁易引起感染、取血量過多可導(dǎo)致貧血等。對于早產(chǎn)兒而言,各臟器功能發(fā)育不成熟,生理功能發(fā)育不完善,骨髓造血功能薄弱,過早地停止了胎內(nèi)的骨髓外造血因而不能適應(yīng)生后機(jī)體快速生長發(fā)育,體內(nèi)鐵儲存少等,導(dǎo)致早產(chǎn)兒貧血非常常見;并且由于早產(chǎn)兒針對感染、黃疸、電解質(zhì)紊亂等疾病,血液檢查多,抽血頻繁,大量的采血可進(jìn)一步導(dǎo)致貧血。嚴(yán)重的貧血可導(dǎo)致呼吸暫停、生長障礙、營養(yǎng)缺乏,易并發(fā)感染等。通過血液樣本做的檢查方法包括生化、培養(yǎng)及致病基因的檢測等,而基因檢測則需要通過提取血液中的RNA得出檢驗(yàn)結(jié)果。血液RNA的提取方法多種多樣,包括試劑盒法、傳統(tǒng)TRIZOL法及SDS法等。這些方法各有利弊,臨床上通過何種方法提取血液RNA效果最好,目前尚無明確定論,值得我們開展研究,用于篩選臨床血液提取RNA的最佳方法。 支氣管肺發(fā)育不良(bronchopulmonary dysplasias,BPD),以往又稱為新生兒慢性肺病(chronic lung disease,CLD),是早產(chǎn)兒、特別是小早產(chǎn)兒呼吸系統(tǒng)常見疾病,是嬰兒期慢性呼吸系統(tǒng)疾病的主要原因。近年來,隨著早產(chǎn)兒救治技術(shù)的不斷增高,BPD的發(fā)生率也隨之增加,嚴(yán)重影響著早產(chǎn)兒的存活率及生長發(fā)育狀態(tài)。目前支氣管肺發(fā)育不良已越來越被重視,現(xiàn)已成為新生兒學(xué)科熱門的學(xué)術(shù)研究。絲氨酸/蘇氨酸蛋白擾動樣激酶1(Tousled-like Kinase1,TLK1),又稱PKU-beta,是蛋白激酶家族和絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族的核心蛋白,首先被發(fā)現(xiàn)于花和葉子的組織中,之后也被廣泛發(fā)現(xiàn)于人體的各個組織內(nèi)。在細(xì)胞周期S期的調(diào)節(jié)激酶中,TLK1作用最大。TLK1具有參與染色體分離、調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄、蛋白氨基酸磷酸化及應(yīng)答DNA損傷修復(fù)的功能,TLK1也參與多種信號通路,在機(jī)體的各種反應(yīng)中起著重大的作用。據(jù)研究,在乳腺癌、前列腺癌、膽管癌及肺鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)TLK1存在高度表達(dá)。研究目的 1.本課題旨在研究改進(jìn)提取血液RNA的方法,通過本研究在確保RNA的完整性的情況下,達(dá)到降低臨床患兒的取血量的目的,更有利于保護(hù)患兒、保證臨床實(shí)驗(yàn)的完成。 2.鑒于TLK1具有應(yīng)答損傷修復(fù)功能,而支氣管肺發(fā)育不良患兒長期受機(jī)械通氣及吸氧的損傷及修復(fù),肺組織及血液內(nèi)TLK1的表達(dá)可能不同于其他無長時間損傷修復(fù)的患兒。本課題擬采用實(shí)時定量熒光PCR(Real-Time PCR)技術(shù)定量檢測支氣管肺發(fā)育不良患兒血液標(biāo)本內(nèi)TLK1的含量,旨在初步探討支氣管肺發(fā)育不良患兒體內(nèi)TLK1表達(dá)的情況。研究方法 1.以TRIZOL法為基本研究方法,通過分別提取等量全血、血漿及血清的總RNA,選擇總RNA提取量最多的一種血液標(biāo)本;隨后,對不同血液量所提取的總RNA進(jìn)行比較,得出最佳的實(shí)驗(yàn)取血量。 2.將上述抽取血液RNA的實(shí)驗(yàn)方法應(yīng)用于臨床標(biāo)本檢測,并對此方法進(jìn)行驗(yàn)證:以來源于本院極早產(chǎn)新生兒重癥監(jiān)護(hù)病房(極早產(chǎn)NICU)內(nèi)診斷為BPD的18名患兒抽取的靜脈血為研究對象,根據(jù)病例組病例患兒的基本信息,以10名近胎齡、近似日齡的非BPD患兒抽取的靜脈血為對照,分別采用TRIZOL法提取RNA,并采用反轉(zhuǎn)錄PCR(ReversedTranscript PCR)方法對所抽提的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。運(yùn)用Real-Time PCR方法對BPD患兒血液TLK1產(chǎn)物做定量分析,采用△△Ct法,以GVPDH為內(nèi)參,以非BPD患兒組為對照。結(jié)果 1.計(jì)算并通過比較TRIZOL法,在等量(0.1ml)全血、血漿及血清提取的總RNA的得率和質(zhì)量分別為:全血提取RNA得率為(232.2904±58.42103)、純度為(1.7421±0.6920),血漿提取RNA得率為(142.0728±45.24386)、純度為(1.4765±0.5418),血清提取RNA的率為(198.7496±51.47629)、純度為(1.5833±0.6257),因此,全血提取的總RNA的得率明顯優(yōu)于血清及血漿,總RNA的純度也最高; 2.以不同的全血量通過不同劑量的TRIZOL提取總RNA比較,在0.1-1ml的全血量的范圍內(nèi),以適量的TRIZOL提取的總RNA的量,全血量越多,提取的RNA的得率及純度越高,但是,全血量越多,提取完整總RNA所需TRIZOL量越多,將不利于后期實(shí)驗(yàn)操作,因此選取最佳的全血量進(jìn)行提取血液RNA的實(shí)驗(yàn)對患者及后期實(shí)驗(yàn)研究非常重要。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明以0.3ml的全血量及1mlTRIZOL即可得到完整的總RNA量,且純度也能達(dá)到1.8-2.0這一標(biāo)準(zhǔn)值,臨床取血量相對較少,是最佳的實(shí)驗(yàn)取血量; 3.以上述實(shí)驗(yàn)全血量(0.3ml)及實(shí)驗(yàn)方法對支氣管肺發(fā)育不良組及對照組共28個樣本提取RNA,除1個樣本外,,其余27個樣本提取的總RNA的得率及純度均在標(biāo)準(zhǔn)范圍內(nèi),證明此提取血液RNA的實(shí)驗(yàn)方法有效; 4.對所有樣本中TLK1的含量進(jìn)行Real-Time PCR定量分析,再運(yùn)用t檢驗(yàn)、△△Ct法等統(tǒng)計(jì)學(xué)方法做出分析,結(jié)果表明,支氣管肺發(fā)育不良組TLK1的表達(dá)高于非支氣管肺發(fā)育不良組。結(jié)論 1.等量的全血獲得的總RNA的得率及純度最高,0.3ml全血及1mlTRIZOL即可滿足實(shí) 驗(yàn)需要; 2.BPD患兒靜脈全血內(nèi)TLK1的表達(dá)高于非BPD組。相對于非支氣管發(fā)育不良患兒, 支氣管肺發(fā)育不良患兒體內(nèi)TLK1表達(dá)增高。
【關(guān)鍵詞】:TRIZOL法 全血RNA 支氣管肺發(fā)育不良 TLK1 Real-Time PCR
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R722.6
【目錄】:
- 英文縮略詞表4-5
- 摘要5-7
- Abstract7-10
- 前言10-14
- 參考文獻(xiàn)12-14
- 第一部分 血液提取總 RNA 方法的優(yōu)化14-20
- 材料與方法14-16
- 結(jié)果16-18
- 討論18
- 參考文獻(xiàn)18-20
- 第二部分 血液提取總 RNA 方法改進(jìn)后的臨床應(yīng)用20-33
- 材料與方法20-27
- 結(jié)果27-30
- 討論30-32
- 參考文獻(xiàn)32-33
- 綜述33-38
- 參考文獻(xiàn)35-38
- 作者簡介38-39
- 致謝39
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:1062833
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