本文關鍵詞：貴州省豬流行性腹瀉病毒ORF3、M基因克隆及序列分析

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【摘要】：為了解貴州省豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3及M基因的遺傳變異情況,試驗于2014年4月-2015年3月從貴州省5個地區(qū)采集105份腹瀉仔豬的糞便,應用RT-PCR方法進行PEDV檢測,從中選擇8份PEDV陽性樣本,擴增其ORF3及M基因,測序并進行序列比對分析。結果顯示,從采集的105份糞便樣本中可檢出75份PEDV陽性樣本,陽性率為71.43%;8株PEDV貴州株ORF3及M基因序列均無堿基缺失或插入;ORF3基因核苷酸及推導的氨基酸同源性在95.1%~100.0%與95.1%~99.6%之間,M基因核苷酸及推導的氨基酸同源性在98.4%~100.0%與98.7%~100.0%之間;氨基酸系統(tǒng)進化樹分析結果顯示,2014~2015年貴州流行株與近年來中國毒株、韓國毒株及泰國毒株親緣關系較近,與疫苗株Attenuated DR13及CV777株親緣關系較遠。提示目前貴州省仔豬腹瀉病原主要是PEDV,且為PEDV強毒株。
【作者單位】： 貴州大學動物科學學院;貴州省生豬質(zhì)量安全工程技術研究中心;貴州省動物疫病預防控制中心;貴州都勻市黔昌畜牧發(fā)展有限責任公司;花溪區(qū)農(nóng)業(yè)局;
【關鍵詞】： 豬流行性腹瀉病毒 ORF基因 M基因 克隆 序列分析
【基金】：貴州省生豬質(zhì)量安全工程技術研究中心建設項目“生豬健康養(yǎng)殖實驗室建設與技術研發(fā)”(黔科合農(nóng)C字[2011]4022號) 貴州省科學技術廳農(nóng)業(yè)攻關項目“貴州省仔豬腹瀉性疫病風險分析及綜合防控技術研究”(黔科合NY[2015]3009-1號);“貴州省動物疫病防控與獸醫(yī)公共衛(wèi)生保障科技創(chuàng)新人才團隊”(黔科合人才團隊[2015]4016號) 貴州省動物疫病與獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點實驗室培育(黔科合計Z字[2011]4008號) 貴州省農(nóng)業(yè)委員會科技計劃項“貴州省2015年重大動物疫病省級定點監(jiān)測”(2015-01號)
【分類號】：S852.651
【正文快照】： 豬流行性腹瀉(porcine epidemic diarrhea,PED)是由尼多病毒目(Nidovirales)、冠狀病毒科(Coronaviridae)的豬流行性腹瀉病毒(porcine epi-demic diarrhea virus,PEDV)引起的豬腸道傳染病,特征為腹瀉、嘔吐、脫水及仔豬的高致死率。PEDV全長28 033bp,有7個開放閱讀框(ORF)[1],

【相似文獻】

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本文編號：979629