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鵝細(xì)小病毒HN株的分離鑒定及全基因組序列分析

發(fā)布時間:2017-10-01 21:25

  本文關(guān)鍵詞:鵝細(xì)小病毒HN株的分離鑒定及全基因組序列分析


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【摘要】:為研究鵝細(xì)小病毒(GPV)基因遺傳變異特征,采集海南某養(yǎng)鵝場疑似鵝細(xì)小病毒感染的病料,將其處理后接種番鴨胚成功分離到一株病毒,經(jīng)PCR鑒定為鵝細(xì)小病毒,命名為HN株,并獲得了其全基因組序列,將該序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中登錄的16條鵝和番鴨細(xì)小病毒基因序列進(jìn)行了比對分析。結(jié)果顯示,該株病毒基因組全長為5 106bp,由ITR、NS、VP構(gòu)成,其中ITR為444bp,NS1為1 844bp,VP1為2 199bp;HN株與SHFX1201株的NS1基因和VP1同源性最高,分別達(dá)到99.8%和99.7%,與番鴨細(xì)小病毒株FM的NS1基因同源性最低,為82.7%;與90-0215株VP1同源性最低,為80.1%。HN株的遺傳進(jìn)化樹可以看出,GPV可以分成明顯的2個基因亞群,HN株與鵝細(xì)小病毒匈牙利株(B)、歐洲疫苗株(VG32/1)和臺灣株(82-0321V、82-0321、06-0329)均處在第I亞群,且與安徽分離株Y株以及SHFX1201株同源性最接近,番鴨源匈牙利株FM單獨處于第Ⅱ亞群。本研究豐富了GPV的數(shù)據(jù)資料,為研究GPV分類地位以及遺傳進(jìn)化關(guān)系提供了依據(jù),同時也為研究GPV流行趨勢和疫苗的開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】鵝細(xì)小病毒 分離鑒定 全基因組 IRT NS VP
【基金】:海南省屬科研院所技術(shù)開發(fā)研究專項(KYYS-2015-13) 海南省自然科學(xué)基金項目(20153085) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項資金項目(CARS-43)
【分類號】:S852.65
【正文快照】: 鵝細(xì)小病毒病又稱小鵝瘟(Derzsy′s disease orGosling plaque),是由鵝細(xì)小病毒(Goose parvovirus,GPV)所引起的雛鵝急性或亞急性的敗血性傳染病。臨床上以精神委靡,離群獨偶,鼻孔流出漿液性鼻液,患鵝頻頻搖頭,拉灰黃色或黃綠色稀糞,神經(jīng)紊亂,小腸中后段黏膜壞死脫落與纖維素

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