本文關(guān)鍵詞：蛋雞蛋品質(zhì)性狀候選基因的DNA分子標記研究

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【摘要】：目的:蛋品質(zhì)性狀是重要的生產(chǎn)性狀,如何提高蛋品質(zhì)性狀已成為當(dāng)前重要的研究熱點。本研究在DNA分子水平上尋找與蛋品質(zhì)性狀密切相關(guān)的分子標記,找到調(diào)控蛋品質(zhì)性狀的優(yōu)勢基因型,在此研究基礎(chǔ)上,進一步在商品代中驗證。方法:本研究采用PCR-SSCP技術(shù),檢測海蘭褐蛋雞蛋品質(zhì)性狀相關(guān)的基因(TRPV6、Cabp-D28k、CA、OC116、OCX32、OCX36和OVA)的單核苷酸多態(tài)性,對其遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性進行了分析,并將檢測到的SNP位點與所選群體進行了關(guān)聯(lián)分析,以檢測七個基因的SNP位點對蛋品質(zhì)性狀的遺傳效應(yīng),初步找到調(diào)控蛋品質(zhì)性狀的有利基因型,并進一步在商品代中驗證,鑒定優(yōu)勢基因型。結(jié)果:(1)采用PCR-SSCP方法對蛋雞進行TRPV6、Cabp-D28k、CA、OC116、OCX32、OCX36和OVA多態(tài)性分析,在TRPV6第14外顯子、Cabp-D28k第3外顯子、CA第5內(nèi)含子、OC116第1、5外顯子、第2內(nèi)含子,OCX32第2、4、6外顯子,OCX36第3、4、5、6、7外顯子,第4、7、8、12內(nèi)含子,OVA第4內(nèi)含子、第5外顯子上發(fā)現(xiàn)了多態(tài)性位點。(2)鈣離子轉(zhuǎn)運基因多態(tài)位點與蛋品質(zhì)性狀進行關(guān)聯(lián)分析得到,TRPV6第14外顯子G27314A突變位點AA型的蛋黃顏色與AG和GG型相比差異極顯著(P0.01);Cabp-D28k第3外顯子A5115G突變位點AG型的蛋殼強度極顯著高于AA和GG型(P0.01);CA第5內(nèi)含子G14306A突變位點AA型的蛋黃顏色較AG型差異極顯著;(3)基質(zhì)蛋白基因多態(tài)位點與蛋品質(zhì)性狀進行關(guān)聯(lián)分析得到,OC116第1外顯子G132G和G208A突變位點形成的AA型的蛋殼厚度、蛋殼強度與AB和AC型比較差異極顯著(P0.01);第5外顯子G2456G和G2512G突變位點形成的AA型蛋殼強度極顯著高于AB和BB型(P0.01);OCX32第2外顯子G4259T和G4276C突變位點形成的各基因型之間蛋殼強度差異極顯著(P0.01);第4外顯子G6049G和G6051A突變位點形成的BD型蛋重極顯著高于其他基因型(P0.01);第6外顯子G7018A和G7116G突變位點形成的各基因型之間蛋黃重比較差異極顯著(P0.01);OCX36第3外顯子G992A和G1075T突變位點形成的AA型的蛋殼厚度極顯著高于AB、BB型(P0.01);第4外顯子G1267C和G1276C突變位點形成的各基因型的哈氏單位相比差異極顯著(P0.01);第5外顯子G2472A突變位點形成的各基因型之間蛋重、蛋白重、蛋黃重、蛋殼重比較分析,結(jié)果差異均為極顯著(P0.01);第6外顯子G2843A和G2893G突變位點形成的BB型的蛋黃顏色極顯著高于其他三種基因型(P0.01);第7外顯子G3287G和G3339G形成突變位點的AA型哈氏單位、蛋白高度與其他基因型相比差異極顯著(P0.01);第12內(nèi)含子G5118C突變位點CC型哈氏單位、蛋白高度和其它基因型比較均差異極顯著(P0.01);OVA第5外顯子G4296C和G4323AA形成的AA型的哈氏單位、蛋白高度與BC和BB型比較,差異達到極顯著(P0.01)。(4)CABP-D28K和OCX32基因標記輔助選擇效應(yīng)分析得到,海蘭褐父母代CABP-D28K AA型公雞個體具有較好的遺傳加性效應(yīng);OCX32 AA型公雞個體遺傳效應(yīng)值可以穩(wěn)定遺傳。結(jié)論:TRPV6、Cabp-D28k、CA、OC-116、OCX32、OCX-36、OVA七個基因均找到有望作為調(diào)控蛋品質(zhì)性狀的分子標記。在商品代中進一步驗證了父母代CABP-D28K AG型公雞個體遺傳效應(yīng)和OCX32 AA型公雞個體遺傳效應(yīng)。為今后利用分子標記輔助選擇技術(shù)來進一步提高蛋雞蛋品質(zhì)性狀提供參考依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】：蛋雞 候選基因 多態(tài)性 蛋品質(zhì)性狀
【學(xué)位授予單位】：石河子大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S831
【目錄】：

• 摘要6-8
• Abstract8-13
• 縮略詞表13-14
• 引言14-15
• 第一章 文獻綜述15-26
• 1 蛋殼的構(gòu)成及形成過程15-16
• 2 蛋殼鈣化有關(guān)的鈣轉(zhuǎn)運通路及基質(zhì)蛋白16-21
• 2.1 蛋殼鈣化有關(guān)的鈣轉(zhuǎn)運通路蛋白17-19
• 2.2 基質(zhì)蛋白19-21
• 3 蛋雞蛋品質(zhì)性狀的研究21-22
• 3.1 蛋殼強度、厚度和百分比21
• 3.2 蛋殼顏色21
• 3.3 蛋重及其內(nèi)容物21-22
• 4 SNP檢測的主要研究方法22-25
• 4.1 聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性（PCR-RLFP)23
• 4.2 聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(PCR-SSCP)23
• 4.3 序列特異性引物PCR (SSP-PCR)23-24
• 4.4 微衛(wèi)星標記24
• 4.5 基因芯片法24
• 4.6 隨機擴增多態(tài)性DNA技術(shù)(RAPD)24-25
• 5 研究目的和意義25-26
• 第二章 蛋雞父母代、子代的蛋品質(zhì)性狀測定26-32
• 1 材料與方法26-27
• 1.1 實驗材料26-27
• 1.2 蛋品質(zhì)性狀測定27
• 1.3 數(shù)據(jù)處理與分析27
• 2 結(jié)果與分析27-30
• 2.1 父母代、子代蛋品質(zhì)性狀比較27-28
• 2.2 父母代和子代部分蛋品質(zhì)性狀的變化趨勢分析28-30
• 3 討論30-32
• 3.1 蛋品質(zhì)性狀30
• 3.2 父母代和子代蛋殼強度等性狀的變化趨勢分析30-32
• 第三章 蛋品質(zhì)性狀部分候選基因多態(tài)性檢測32-84
• 1 材料與方法32-44
• 1.1 實驗材料32-40
• 1.2 主要的實驗方法與步驟40-43
• 1.3 數(shù)據(jù)處理及分析43-44
• 2 結(jié)果與分析44-81
• 2.1 基因組DNA提取及檢測44-45
• 2.2 基因外顯子區(qū)PCR產(chǎn)物擴增片段的檢測45-58
• 2.3 TRPV6基因多態(tài)性的檢測58-59
• 2.4 CaBP-D28k基因多態(tài)性的檢測59-61
• 2.5 CA基因多態(tài)性的檢測61-62
• 2.6 OC116基因多態(tài)性的檢測62-66
• 2.7 OCX32基因多態(tài)性的檢測66-70
• 2.8 OCX36基因多態(tài)性的檢測70-79
• 2.9 OVA基因多態(tài)性的檢測79-81
• 3 討論81-84
• 3.1 關(guān)于SSCP分析81
• 3.2 鈣轉(zhuǎn)運通路相關(guān)候選基因多態(tài)性分析81-82
• 3.3 基質(zhì)蛋白候選基因的多態(tài)性分析82-84
• 第四章 候選基因多態(tài)性與蛋雞蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析84-100
• 1 材料與方法84-85
• 1.1 實驗材料84
• 1.2 實驗方法84
• 1.3 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計分析84-85
• 2 結(jié)果與分析85-97
• 2.1 TRPV6多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析85
• 2.2 CABP-D28K多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析85-86
• 2.3 CA多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析86-87
• 2.4 OC116多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析87-89
• 2.5 OCX32多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析89-91
• 2.6 OCX36多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析91-96
• 2.7 OVA多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析96-97
• 3 討論97-100
• 3.1 鈣轉(zhuǎn)運通路相關(guān)候選基因多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析97-98
• 3.2 基質(zhì)蛋白候選基因的多態(tài)性與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析98-100
• 第五章 CABP-D28K和OCX32基因標記輔助選擇效應(yīng)分析100-105
• 1 材料與方法100
• 1.1 實驗材料100
• 1.2 實驗方法100
• 1.3 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計分析100
• 2 結(jié)果與分析100-102
• 3 討論102-103
• 3.1 CABP-D28K標記輔助選擇效應(yīng)分析102-103
• 3.2 OCX32標記輔助選擇效應(yīng)分析103
• 4 結(jié)論103-105
• 全文總結(jié)105-106
• 創(chuàng)新點106-107
• 參考文獻107-117
• 致謝117-118
• 作者簡介118-119
• 附件119

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本文編號：944944