本文關(guān)鍵詞：牦牛卵巢小RNA高通量測序及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：本研究旨在利用高通量測序技術(shù)描繪牦牛卵巢sRNA圖譜,為探析牦牛繁殖性能提供基礎(chǔ)。以牦牛卵巢組織作為研究對象,構(gòu)建牦牛sRNA文庫,進(jìn)行高通量測序和生物信息學(xué)分析,最后利用RT-qPCR技術(shù)驗證miRNA在牦牛卵巢組織中的表達(dá)。經(jīng)測序后得到包含12 126 208條clean reads,其中特異序列為212 757條;比對分析顯示,只有7 383 536(60.89%)條總序列及80 981(38.06%)條特異序列能與牦牛基因組匹配。與黃牛相比,牦牛sRNA中有56個表達(dá)量上調(diào),其中miR-135a表達(dá)上調(diào)最顯著;有33個表達(dá)下調(diào),其中miR-2316表達(dá)下調(diào)最顯著。RT-qPCR驗證6個miRNA在牦牛卵巢組織中的表達(dá)情況,定量結(jié)果和測序結(jié)果基本一致。與牦牛EST序列信息比對后共預(yù)測出5個新miRNA。本研究成功繪制牦牛卵巢sRNA圖譜,同時證實RNA-Seq高通量測序技術(shù)在完善sRNA信息及挖掘新miRNA方面的優(yōu)勢,對研究sRNA在牦牛遺傳育種以及以牦牛為重要高原動物模型來進(jìn)行高原適應(yīng)性和抗逆性等相關(guān)領(lǐng)域的研究具有重要意義。
【作者單位】： 西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;西南民族大學(xué)青藏高原研究院;
【關(guān)鍵詞】： 牦牛 卵巢 高通量測序 小RNA 生物信息學(xué)
【基金】：四川省科技支撐計劃(2014NZ0114) 西南民族大學(xué)牦牛創(chuàng)新團(tuán)隊(13CXTD01)
【分類號】：S823.85
【正文快照】： 牦牛被稱作高原之舟,主要分布在中國青藏高原及其毗鄰的高山、亞高山地區(qū)。在長期的自然選擇和人工選擇的共同作用下,牦牛對高海拔、低溫、低氧牧區(qū)具有良好適應(yīng)性,能充分利用高寒草場資源。牦牛是當(dāng)?shù)啬撩褓囈陨婧桶l(fā)展的生產(chǎn)、生活資料,也是牧區(qū)經(jīng)濟(jì)的支柱產(chǎn)業(yè)和牧民經(jīng)濟(jì)收

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6 王s，

本文編號：884291