綠殼蛋雞LSm14A基因克隆與組織分布分析
本文關鍵詞:綠殼蛋雞LSm14A基因克隆與組織分布分析
【摘要】:為探明綠殼蛋雞LSm14A分子序列特征與其在綠殼蛋雞體內不同組織中的分布情況。本研究利用RT-PCR方法擴增LSm14A基因編碼區(qū)全長序列并進行克隆測序。利用DNAStar軟件對LSm14A基因與鴨、人、鼠等其他13個物種的LSm14A基因核苷酸、氨基酸序列進行比對分析,并對綠殼蛋雞LSm14A基因所編碼的蛋白進行了二級結構、B細胞表位、保守結構域、跨膜結構域和信號膚預測。同時采用實時熒光定量PCR方法檢測綠殼蛋雞源LSm14A基因在綠殼蛋雞不同組織中的轉錄水平差異。綠殼蛋雞LSm14A基因克隆結果顯示:綠殼蛋雞LSm14A全長CDS為1386 by,編碼461個氨基酸;與原雞源LSm14A相似性達99.6%,與鴨源的LSm14A相似性為94.7%,與人源、猴源、豬源、爪蟾的LSm14A相似性較低;系統(tǒng)進化樹顯示其序列與原雞的親緣關系最近,且處于同一遺傳進化分枝。綠殼蛋雞LSm14A基因編碼蛋白結構預測結果顯示:綠殼蛋雞LSm14A基因編碼蛋白親水性較好,為非分泌蛋白,含有Sm1與Sm2基序和FDF結構域,不存在跨膜結構,熒光定量結果顯示:LSm14A分子在綠殼蛋雞不同組織中均有分布且有不同程度的表達,在免疫器官法氏囊、胸腺中表達較高,而在肝臟中表達最低。本研究結果說明綠殼蛋雞LSm14A分子具有較高的保守性,在綠殼蛋雞不同組織中呈廣泛性表達,在禽類中樞免疫器官中呈高水平表達,將為研究LSm14A分子在天然免疫中的作用機制、防控禽類病毒性疾病奠定基礎。
【作者單位】: 貴州大學動物科學學院;貴州省動物疫病與獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點實驗室;
【關鍵詞】: 綠殼蛋雞 LSmA 組織分布
【基金】:國家自然科學基金(No.31460668) 貴州省科學技術基金(No.(2015)2046) 貴州大學博士基金(No.(2013)12)、貴州大學研究生創(chuàng)新基金(No.研農2015024)、貴州大學“本科教學工程”項目(No.JKSP2013004) 貴州省科技創(chuàng)新人才團隊項目[No.黔科合人才團隊(2015)4016]共同資助
【分類號】:S831
【正文快照】: L Sm 1 4A最先在伊比利亞肋突(Newt Pleurodeleswaltl)與非洲爪蟾(Xenopus laevis)中發(fā)現(xiàn),主要結合在卵母細胞質處理小體(processing bodies,P-bodies)上,在進化上具有保守性(L ieb et al.,1 998)。人類的L Sm l4A位于P-body上,在病毒感染的早期,能夠與多種病毒核酸結合,并能
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,本文編號:856441
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