本文關(guān)鍵詞：牛TRAF6基因的密碼子使用偏好性分析

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【摘要】：為揭示TRAF6基因的密碼子使用特性及選擇合適受體動(dòng)物、最佳外源表達(dá)系統(tǒng),運(yùn)用CUSP、CHIPS和CodonW在線軟件分析牛TRAF6基因的密碼子偏好性,并與模式生物基因組以及其他物種TRAF6基因進(jìn)行比較。結(jié)果表明:牛TRAF6基因大部分偏好使用以G/C結(jié)尾的密碼子,其中偏好性較強(qiáng)的有CTG(RSCU≥2),并發(fā)現(xiàn)大部分物種的TRAF6基因表達(dá)水平較低,牛與家綿羊TRAF6基因密碼子使用相似,牛TRAF6基因與小鼠基因組的密碼子使用頻率差異小于大腸埃希氏菌和酵母菌等2種模式生物基因組,故選擇小鼠作為TRAF6基因的外源表達(dá)宿主。這一研究為TRAF6基因在動(dòng)物遺傳改良中合適受體動(dòng)物、最佳外源表達(dá)系統(tǒng)的選擇以及其表達(dá)水平的提高提供了一定的理論依據(jù)。
【作者單位】： 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 牛 TRAF基因 密碼子偏好性
【基金】：江蘇省高校自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(13KJB230001)
【分類號(hào)】：S823.2
【正文快照】： 腫瘤壞死因子受體6(TRAF6)屬于TRAFs家族基因,是腫瘤壞死因子超家族(TNF)、Toll樣受體家族(TLRs)和白細(xì)胞介素1受體超家族(TIR)信號(hào)通路調(diào)控途徑中關(guān)鍵接頭分子[1]。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),模式生物小鼠及人的TRAF6基因可調(diào)節(jié)不同的信號(hào)傳導(dǎo)途徑,其中包括免疫和炎癥相關(guān)通路,因此在免疫

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本文編號(hào)：846271