陜西部分地區(qū)山羊畢氏腸微孢子蟲感染情況及其基因型研究
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【摘要】:羊是重要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物,在我國(guó)畜牧業(yè)發(fā)展中占據(jù)重要位置。陜西省的陜北白絨山羊、薩能奶山羊、陜北黑山羊是我國(guó)重要的山羊品種,也是陜西主要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物。隨著羊產(chǎn)業(yè)規(guī)模的不斷擴(kuò)大,羊群疾病逐漸成為阻礙產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要因素。其中,微孢子蟲病不僅危害羊群健康,某些種類還能導(dǎo)致人類疾病。畢氏腸微孢子蟲是動(dòng)物及人微孢子蟲病的主要病原體,它能使免疫機(jī)能正常的宿主出現(xiàn)自限性腹瀉,對(duì)于免疫力低下或有免疫缺陷的宿主可能會(huì)造成嚴(yán)重腹瀉,甚至威脅生命。鑒于畢氏腸微孢子蟲不僅影響動(dòng)物的生產(chǎn)性能及價(jià)值,還有一定的人獸共患風(fēng)險(xiǎn),威脅人類健康,本研究對(duì)陜西省部分地區(qū)不同生產(chǎn)用途山羊畢氏腸微孢子蟲的感染情況及其基因型進(jìn)行研究,為防控人和動(dòng)物微孢子蟲病提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本研究首先利用基于ITS基因位點(diǎn)的巢式PCR技術(shù),弄清陜西部分地區(qū)山羊畢氏腸微孢子蟲的感染情況及其基因型,再采用基于微衛(wèi)星和小衛(wèi)星位點(diǎn)的多位點(diǎn)序列分型技術(shù)對(duì)獲得的分離株進(jìn)行群體遺傳分析,進(jìn)而評(píng)估不同用途山羊畢氏腸微孢子蟲的遺傳多樣性和人獸共患風(fēng)險(xiǎn)。本研究結(jié)果顯示,三種不同生產(chǎn)用途的山羊中,薩能奶山羊的感染率(32.9%)顯著高于絨山羊(15.9%,P0.05)和肉山羊(15.0%,P0.05);3~6月齡羔羊畢氏腸微孢子蟲感染率最高,為33.3%,其次為0~2月齡羔羊(24.4%)和7~12月齡山羊(17.4%),而12月齡的成年羊感染率最低,為15.1%。本研究共獲得122份陽(yáng)性畢氏腸微孢子蟲分離株,獲得4種不同的基因型,包括3種已知基因型BEB6、CHG1、CHG2和1種新基因型SX1。基于微衛(wèi)星位點(diǎn)(MS1、MS3、MS7)和小衛(wèi)星位點(diǎn)(MS4)進(jìn)行擴(kuò)增發(fā)現(xiàn),在MS1、MS4和MS7位點(diǎn)的擴(kuò)增效率依次為28.7%(35/122)、18.0%(22/122)、50.8%(62/122),而在MS3位點(diǎn)所有樣品均未獲得有效擴(kuò)增。核苷酸序列分析表明,所有樣品的MS1、MS4和MS7位點(diǎn)分別具有16、9和18個(gè)基因型,共形成了14個(gè)MLGs。其中,50份絨山羊陽(yáng)性樣品三個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增效率分別為10.0%(5/50)、14.0%(7/50)和90.0%(45/50),分別具有3、3和10個(gè)基因型,共形成了5個(gè)MLGs;56份奶山羊陽(yáng)性樣品三個(gè)位點(diǎn)的擴(kuò)增效率依次為28.6%(16/56)、19.6%(11/56)和8.9%(5/56),分別組成4、4、1個(gè)基因型,共組成7個(gè)不同的MLGs;16份黑山羊陽(yáng)性樣品在三個(gè)位點(diǎn)的擴(kuò)增效率依次為為81.3%(13/16)、25.0%(4/16)、75.0%(12/16),分別具有9、2、7個(gè)基因型,構(gòu)成2個(gè)MLGs。綜上所述,本研究明確了陜西部分地區(qū)不同生產(chǎn)用途山羊存在畢氏腸微孢子蟲感染,發(fā)現(xiàn)了奶山羊樣品中存在能感染人的畢氏腸微孢子蟲基因型,遺傳進(jìn)化分析顯示,新發(fā)現(xiàn)的基因型SX1具有宿主特異性。此外,本研究發(fā)現(xiàn)陜西省山羊的畢氏腸微孢子蟲存在遺傳多樣性,具有14個(gè)MLGs。這些研究結(jié)果表明,需要制定綜合性的防控措施控制該省的畢氏腸微孢子蟲感染,并采取有效手段防止其對(duì)人類的傳播。
【關(guān)鍵詞】:山羊 畢氏腸微孢子蟲 感染率 基因型
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S858.27
【目錄】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-11
- 文獻(xiàn)綜述11-21
- 第一章 微孢子蟲與微孢子蟲病研究進(jìn)展11-21
- 1.1 概述11-13
- 1.2 分類13
- 1.3 形態(tài)13-14
- 1.4 生活史14
- 1.5 流行病學(xué)14-16
- 1.6 臨床癥狀16
- 1.7 診斷16-19
- 1.7.1 顯微鏡檢測(cè)16-17
- 1.7.2 血清學(xué)方法17
- 1.7.3 分子生物學(xué)檢測(cè)17
- 1.7.4 基因型及分型工具17-19
- 1.8 治療19-20
- 1.9 預(yù)防20
- 1.10 本研究的目的與意義20-21
- 試驗(yàn)研究21-36
- 第二章 陜西部分地區(qū)山羊畢氏腸微孢子蟲感染情況及其基因型研究21-36
- 2.1 材料與方法21-26
- 2.1.1 材料21-23
- 2.1.1.1 糞便樣品21-22
- 2.1.1.2 主要試劑22-23
- 2.1.1.3 主要溶液及其配制方法23
- 2.1.1.4 主要儀器與設(shè)備23
- 2.1.2 方法23-26
- 2.1.2.1 糞便樣品基因組DNA的提取23-24
- 2.1.2.2 畢氏腸微孢子蟲ITS基因擴(kuò)增24-26
- 2.1.2.3 PCR陽(yáng)性產(chǎn)物測(cè)序26
- 2.1.2.4 序列比對(duì)及種系發(fā)育分析26
- 2.1.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析26
- 2.2 結(jié)果26-32
- 2.2.1 畢氏腸微孢子蟲感染狀況26-28
- 2.2.2 基于ITS基因的基因分型及種系發(fā)育分析28-31
- 2.2.3 基于小衛(wèi)星、微衛(wèi)星位點(diǎn)巢式PCR擴(kuò)增與MLST分型結(jié)果31-32
- 2.3 討論32-36
- 2.3.1 品種、年齡對(duì)畢氏腸微孢子蟲感染的影響33-34
- 2.3.2 山羊感染畢氏腸微孢子蟲不同基因型分析34
- 2.3.3 多位點(diǎn)序列分型分析34-35
- 2.3.4 防制措施35-36
- 結(jié)論36-37
- 參考文獻(xiàn)37-43
- 致謝43-44
- 作者簡(jiǎn)介44
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