本文關(guān)鍵詞：高通量測序分析20株禽流感病毒全基因

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【摘要】：為探索使用高通量測序測定和分析禽流感病毒全基因的方法,使用Ion Torrent PGM測序儀對(duì)20株自華東地區(qū)分離的禽流感病毒進(jìn)行全基因測序,分析該方法的優(yōu)缺點(diǎn),以及此20株病毒的基因組特性和進(jìn)化特征。結(jié)果顯示,應(yīng)用Ion Torrent PGM測序儀能夠測出全部20株病毒的全基因,確定其均為H9亞型h9.4.2.5分支的低致病性毒株,NA基因均為N2亞型,并分析了其6個(gè)內(nèi)部基因分子演化關(guān)系。說明高通量測序可用于禽流感病毒全基因分析。
【作者單位】： 中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心;
【關(guān)鍵詞】： 高通量測序 禽流感 全基因 分子演化
【基金】：中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心創(chuàng)新基金(2015IF-0004FF)
【分類號(hào)】：S852.65
【正文快照】： 禽流行性感冒病毒(avian influenza virus,AIV)簡稱禽流感病毒,屬于正黏病毒科、甲型流感病毒屬。甲型流感病毒粒子表面有血凝素(hemag-glutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)兩種表面結(jié)構(gòu)蛋白,根據(jù)HA和NA的抗原性差異可分別將其分為18種H亞型(H1~H18)和11種N亞型(N1~N1

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：802013