牛支原體TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的研究
本文關(guān)鍵詞:牛支原體TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的研究
更多相關(guān)文章: 牛支原體 OPPD/F基因 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
【摘要】:牛支原體病是由牛支原體引起的一種可導(dǎo)致多種病癥的傳染病。為了快速準(zhǔn)確的診斷該病,本研究在參考國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上,選取OPPD /F作為特異性基因,設(shè)計(jì)合成引物和探針,建立了牛支原體1aqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法。目的:本研究旨在建立一種快速檢測(cè)牛支原體的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法。方法:根據(jù)GenBan k中收錄的牛支原體OPPD/F基因序列(登錄號(hào):AF130119),利用Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)特異性引物與TaqMan探針,以重組質(zhì)粒作為絕對(duì)定量的模板,構(gòu)建檢測(cè)牛支原體的TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法。結(jié)果:所構(gòu)建的TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法線性關(guān)系良好,標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)系數(shù)R2=0.994,擴(kuò)增效率E=1.28。熒光定量PCR法檢測(cè)的敏感性是常規(guī)PCR的10倍;特異性良好,檢測(cè)9種相關(guān)細(xì)菌和病毒均為陰性;重復(fù)性好,組內(nèi)及組間樣本檢測(cè)Ct值均小于2%。結(jié)論:牛支原體TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法較之于常規(guī)PCR方法有快速、特異性強(qiáng)、敏感性高、穩(wěn)定性好的優(yōu)點(diǎn)。
【關(guān)鍵詞】:牛支原體 OPPD/F基因 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S852.62
【目錄】:
- 摘要4-5
- Abstract5-10
- 1 引言10-21
- 1.1 牛支原體病簡(jiǎn)介10-11
- 1.2 牛支原體的病原學(xué)特性11-12
- 1.2.1 牛支原體的形態(tài)特征11
- 1.2.2 牛支原體的基因組學(xué)11
- 1.2.3 牛支原體的生長(zhǎng)及繁殖特性11-12
- 1.2.4 牛支原體的理化特性12
- 1.3 牛支原體病的流行病學(xué)12-13
- 1.4 牛支原體病的臨床癥狀13-14
- 1.4.1 最急性13-14
- 1.4.2 急性14
- 1.4.3 慢性14
- 1.5 牛支原體病的病理變化14
- 1.6 牛支原體病的致病機(jī)理14-15
- 1.7 牛支原體病的免疫機(jī)理15
- 1.8 牛支原體病的診斷15-17
- 1.8.1 病原的分離培養(yǎng)15-16
- 1.8.2 血清學(xué)診斷16
- 1.8.3 分子生物學(xué)診斷方法16-17
- 1.9 牛支原體病的治療17
- 1.10 牛支原體病的防控措施17-18
- 1.10.1 加強(qiáng)飼養(yǎng)管理17-18
- 1.10.2 加強(qiáng)消毒工作18
- 1.10.3 加強(qiáng)檢疫監(jiān)管18
- 1.11 牛支原體病疫苗研究進(jìn)展18-19
- 1.12 實(shí)時(shí)熒光定量PCR19-20
- 1.12.1 實(shí)時(shí)熒光定量PCR簡(jiǎn)介19
- 1.12.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR的類別19-20
- 1.13 本研究的目的及意義20-21
- 2 材料與方法21-27
- 2.1 材料21
- 2.1.1 菌株、病毒株及病原核酸21
- 2.1.2 牛支原體病病牛鼻拭子臨床樣本21
- 2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器21
- 2.1.4 主要實(shí)驗(yàn)試劑21
- 2.1.5 引物和探針21
- 2.2 方法21-27
- 2.2.1 牛支原體基因組DNA的提取22
- 2.2.2 牛支原體種屬特異性片段(OPPD/F)的擴(kuò)增22
- 2.2.3 目的片段的回收22-23
- 2.2.4 目的片段與克隆載體的連接及轉(zhuǎn)化感受態(tài)trans5α23
- 2.2.5 重組質(zhì)粒提取及鑒定23-24
- 2.2.6 重組陽(yáng)性質(zhì)粒拷貝數(shù)測(cè)定24
- 2.2.7 熒光定量PCR反應(yīng)體系及條件的優(yōu)化24-25
- 2.2.8 實(shí)時(shí)熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立25
- 2.2.9 實(shí)時(shí)熒光定量PCR的敏感性試驗(yàn)25
- 2.2.10 熒光定量PCR的特異性試驗(yàn)25-26
- 2.2.11 熒光定量PCR的重復(fù)性試驗(yàn)26
- 2.2.12 實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法臨床樣品檢測(cè)26-27
- 3 結(jié)果27-33
- 3.1 重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的制備及鑒定結(jié)果27-28
- 3.1.1 常規(guī)PCR的擴(kuò)增結(jié)果27
- 3.1.2 重組質(zhì)粒鑒定結(jié)果27-28
- 3.1.3 目的片段測(cè)序鑒定結(jié)果28
- 3.1.4 質(zhì)?截悢(shù)計(jì)算結(jié)果28
- 3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系的建立結(jié)果28-33
- 3.2.1 TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)參數(shù)的優(yōu)化結(jié)果28-29
- 3.2.2 TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制結(jié)果29
- 3.2.3 TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR敏感性試驗(yàn)結(jié)果29-30
- 3.2.4 TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR特異性試驗(yàn)結(jié)果30
- 3.2.5 TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR重復(fù)性試驗(yàn)結(jié)果30-32
- 3.2.6 臨床樣品檢測(cè)結(jié)果32-33
- 4 討論33-35
- 5 結(jié)論35-36
- 致謝36-37
- 參考文獻(xiàn)37-42
- 作者簡(jiǎn)介42
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 霍紅;李業(yè)南;薛遙;郭立平;王曉磊;步志高;華榮虹;;豬流行性乙型腦炎病毒TaqMan熒光定量PCR方法的建立[J];中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2014年07期
2 季新成;史茜;郭春娟;王科珂;冉多良;;牛病毒性腹瀉病毒內(nèi)標(biāo)雙重TaqMan熒光RT-PCR方法的建立及初步應(yīng)用[J];中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2014年08期
3 鄭衛(wèi)東,鄭懷競(jìng),楊澤,從冠寧;通用TaqMan探針技術(shù)在apoE基因3937T/C單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)中的應(yīng)用[J];臨床檢驗(yàn)雜志;2004年03期
4 崔銀秋;張全超;謝承志;周慧;;新型TaqMan-MB熒光探針測(cè)定古DNA模板含量[J];吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2007年01期
5 周倫江;王隆柏;方桂友;魏宏;車勇良;陳如敬;莊向生;;變異型豬繁殖與呼吸綜合征病毒TaqMan熒光定量RT-PCR方法的建立與初步應(yīng)用[J];中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào);2010年08期
6 劉毅;吳志明;閆若潛;趙明軍;王東方;趙雪麗;劉梅芬;程俊貞;薛曉;李寧;;犬細(xì)小病毒TaqMan MGB熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2014年06期
7 栗冬梅;宋秀平;王君;劉起勇;;TaqMan-MGB探針檢測(cè)文森巴爾通體博格霍夫亞種實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法的建立及應(yīng)用[J];微生物學(xué)報(bào);2013年09期
8 萬(wàn)春和;程龍飛;邵周伍林;劉思國(guó);黃瑜;張?jiān)?;鴨疫里默氏桿菌TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J];中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2014年06期
9 曹偉偉;郭抗抗;許信剛;寧蓬勃;劉偉;程敏;董玲娟;徐磊;高婉俊;任敏;;豬圓環(huán)病毒Ⅱ型TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2013年01期
10 翟新驗(yàn),盧勝明,劉鈞;實(shí)時(shí)TaqMan PCR技術(shù)在獸醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J];實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué)與管理;2002年02期
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 弋英;陳繼明;王志亮;;TaqMan檢測(cè)技術(shù)——未來(lái)的病毒病常規(guī)檢測(cè)手段[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜傳染病學(xué)分會(huì)成立20周年慶典暨第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(上)[C];2003年
2 Yachun Su;Shanshan Wang;Jinlong Guo;Bantong Xue;Liping Xu;Youxiong Que;;A TaqMan real-time PCR assay for detection and quantification of Sporisorium scitamineum in sugarcane[A];中國(guó)作物學(xué)會(huì)2013年學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2013年
3 Songhong Wei;Theo van der Lee;Richard van Hoof;Marga van Gent-Pelzer;Els verstappen;Cees Waalwijk;Zhiheng Liu;;Quantitative detection of Fusarium graminearum and its chemotypes by TaqMan PCR[A];中國(guó)菌物學(xué)會(huì)第六屆會(huì)員代表大會(huì)(2014年學(xué)術(shù)年會(huì))暨貴州省食用菌產(chǎn)業(yè)發(fā)展高峰論壇會(huì)議摘要[C];2014年
4 袁秀芳;劉鄧;徐麗華;王一成;;豬傳染性胃腸炎病毒和豬流行性腹瀉病毒多重TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立及其初步應(yīng)用[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜傳染病學(xué)分會(huì)第七屆全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨第十三次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(下冊(cè))[C];2009年
5 高志強(qiáng);宋立;張鶴曉;寧宜寶;喬彩霞;楊承槐;吳丹;谷強(qiáng);;豬鏈球菌通用及2型TaqMan熒光PCR檢測(cè)技術(shù)建立與應(yīng)用[A];京津冀畜牧獸醫(yī)科技創(chuàng)新交流會(huì)暨新思想、新觀點(diǎn)、新方法論壇論文集[C];2008年
6 李文濤;李文潔;劉淑清;汪洋;楊昆;鄒浩勇;何啟蓋;;豬圓環(huán)病毒2型TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)——第二屆中國(guó)獸醫(yī)臨床大會(huì)論文集(上冊(cè))[C];2010年
7 楊苗;Cheng An-chun;Wang Ming-shu;Xing Hong-yi;;Development and Application of a One-step Real-time TaqMan RT-PCR Assay for Detection of Duck Hepatitis Virus Type 1[A];第五屆中國(guó)畜牧科技論壇論文集[C];2011年
8 拜廷陽(yáng);趙德明;吳志明;閆若潛;趙明軍;劉梅芬;;豬巨細(xì)胞病毒TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜傳染病學(xué)分會(huì)第八屆全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2013年
9 路斌;袁秀芳;徐麗華;李軍星;王一成;;一步法TaqMan~汶探針實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR快速檢測(cè)豬繁殖與呼吸綜合征方法的建立及初步應(yīng)用[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜傳染病學(xué)分會(huì)第八屆全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2013年
10 劉陽(yáng);史子學(xué);魏建超;邵東華;王皓婷;賈園;高小琪;王宗堯;晏文君;張書蕭;劉哲;王水明;王志亮;馬志永;;埃博拉病毒Z/S亞型一步法TaqMan MGB熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會(huì)第三次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2012年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 李建;牛支原體TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
2 王玄珂;豬流行性腹瀉病毒TaqMan熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立及其初步應(yīng)用[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
3 霍紅;流行性乙型腦炎病毒TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2014年
4 肖文;豬傳染性胃腸炎病毒TaqMan熒光定量RT-PCR方法的建立及初步應(yīng)用[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
5 丁維民;TaqMan-MGB探針雙重?zé)晒舛縋CR方法絕對(duì)定量MDV-Ⅰ和HVT[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年
6 李霞;CAEV TaqMan PCR檢測(cè)及重組SU蛋白的真核表達(dá)[D];天津大學(xué);2012年
7 官家明;美洲型及歐洲型PRRSV多重TaqMan熒光定量RT-PCR鑒別檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[D];廣西大學(xué);2014年
8 呂品;狐源CDV H、F、N基因序列分析及其TaqMan熒光定量RT-PCR診斷方法的建立[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年
9 方桂友;TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)PRRSV(FJ06株)在人工感染豬體內(nèi)分布規(guī)律[D];福建農(nóng)林大學(xué);2009年
10 王韜;應(yīng)用TaqMan-MGB探針實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)檢測(cè)豬KIT基因型的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年
,本文編號(hào):732685
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/732685.html