本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)與奶牛乳產(chǎn)量和乳質(zhì)量調(diào)控相關(guān)的miRNA

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【摘要】：本實(shí)驗(yàn)將中國(guó)荷斯坦牛泌乳期高乳品質(zhì)奶牛(H)和泌乳期低乳品質(zhì)奶牛(L)乳腺組織作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,利用高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行了miRNA測(cè)序,與miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),獲得已知miRNA,整合miREvo和mir Deep2這兩個(gè)miRNA預(yù)測(cè)軟件,進(jìn)行新miRNA分析,通過差異表達(dá)分析篩選組間差異miRNAs,獲得56個(gè)差異表達(dá)miRNA(P0.05,FDRq0.05)并對(duì)差異表達(dá)miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè);利用DAVID對(duì)靶基因進(jìn)行GO(Gene Ontology)和信號(hào)通路富集分析。經(jīng)過對(duì)靶基因篩選,發(fā)現(xiàn)了4個(gè)已報(bào)道與乳蛋白、乳脂緊密相關(guān)的功能基因:CSN3、SCD、LALBA和DGAT2。靶基因聚集的生物學(xué)功能多數(shù)參與了蛋白質(zhì)和脂肪代謝,乳腺發(fā)育和分化,以及免疫功能。靶基因主要富集在MAPK信號(hào)通路、甘油磷酸脂質(zhì)代謝、缺氧誘導(dǎo)因子1和磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。結(jié)果顯示,靶基因主要富集在糖類代謝、脂肪代謝、蛋白質(zhì)代謝、細(xì)胞凋亡以及免疫相關(guān)通路。
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品科學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 中國(guó)荷斯坦牛 乳成分 small RNA-seq
【基金】：國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃,No.2011CB100804)~~
【分類號(hào)】：S823
【正文快照】： 國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃,No.2011CB100804)*聯(lián)系人Tel:0451-55191416;E-mail:wangcm-1@163.com,qzli@neau.edu.cnReceived:January 22,2016;Accepted:March 23,2016Supported by National Basic Research and Development Program of China(973 Program,No.2011CB10

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本文編號(hào)：719787