本文關(guān)鍵詞：PRRSV廣西分離株GXYL-1403全基因克隆與序列分析

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【摘要】：對(duì)本實(shí)驗(yàn)室所分離的1株豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)毒株GXYL-1403進(jìn)行全基因組克隆和序列分析。參考已發(fā)表的擴(kuò)增全長PRRSV序列的13對(duì)特異性引物,用RT-PCR方法對(duì)病毒基因組進(jìn)行分段擴(kuò)增。將擴(kuò)增得到的PCR片段克隆到pMD18-T載體上,獲得的重組質(zhì)粒經(jīng)PCR鑒定后進(jìn)行序列測定。通過軟件對(duì)所擴(kuò)增序列進(jìn)行拼接,獲得GXYL-1403的全長序列,并對(duì)GXYL-1403進(jìn)行比較和遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明GXYL1403株基因序列全長為15 018bp,與國內(nèi)外多株P(guān)RRSV毒株進(jìn)行同源性比較發(fā)現(xiàn),與VR-2332的相似性為89.1%,與TJ、JXA1、HEB1、HUB1、HUB2、TP株同源性達(dá)到了97.9%~98.1%。另外,GXYL-1403分離株nsp2蛋白含有高致病性PRRSV特異的1+29個(gè)氨基酸的缺失。特別重要的是,在缺失29個(gè)氨基酸區(qū)域的上游,含有連續(xù)20個(gè)氨基酸缺失,在下游出現(xiàn)了連續(xù)74個(gè)氨基酸的缺失。遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)美洲型PRRSV主要分為3個(gè)亞群,GXYL-1403跟高致病性PRRSV毒株屬于同一分支,證實(shí)了GXYL-1403株為美洲型PRRSV毒株。
【作者單位】： 廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院動(dòng)物傳染病研究室;
【關(guān)鍵詞】： 豬繁殖與呼吸綜合征病毒 克隆 序列分析 遺傳進(jìn)化分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372444) 廣西大學(xué)科研基金項(xiàng)目(XGZ130959)
【分類號(hào)】：S852.65
【正文快照】： 豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproduc-tive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是豬繁殖與呼吸綜合征(Porcine reproductive and re-spiratory syndrome,PRRS)的病原。不同年齡、品種和性別的豬均可感染,以妊娠母豬和1月齡以內(nèi)的仔豬最易感,主要特征為母豬流產(chǎn)、死胎

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本文編號(hào)：679293