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PRRSV廣西分離株GXYL-1403全基因克隆與序列分析

發(fā)布時間:2017-08-15 17:04

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【摘要】:對本實驗室所分離的1株豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)毒株GXYL-1403進行全基因組克隆和序列分析。參考已發(fā)表的擴增全長PRRSV序列的13對特異性引物,用RT-PCR方法對病毒基因組進行分段擴增。將擴增得到的PCR片段克隆到pMD18-T載體上,獲得的重組質(zhì)粒經(jīng)PCR鑒定后進行序列測定。通過軟件對所擴增序列進行拼接,獲得GXYL-1403的全長序列,并對GXYL-1403進行比較和遺傳進化分析。結(jié)果表明GXYL1403株基因序列全長為15 018bp,與國內(nèi)外多株P(guān)RRSV毒株進行同源性比較發(fā)現(xiàn),與VR-2332的相似性為89.1%,與TJ、JXA1、HEB1、HUB1、HUB2、TP株同源性達到了97.9%~98.1%。另外,GXYL-1403分離株nsp2蛋白含有高致病性PRRSV特異的1+29個氨基酸的缺失。特別重要的是,在缺失29個氨基酸區(qū)域的上游,含有連續(xù)20個氨基酸缺失,在下游出現(xiàn)了連續(xù)74個氨基酸的缺失。遺傳進化分析發(fā)現(xiàn)美洲型PRRSV主要分為3個亞群,GXYL-1403跟高致病性PRRSV毒株屬于同一分支,證實了GXYL-1403株為美洲型PRRSV毒株。
【作者單位】: 廣西大學動物科學技術(shù)學院動物傳染病研究室;
【關(guān)鍵詞】豬繁殖與呼吸綜合征病毒 克隆 序列分析 遺傳進化分析
【基金】:國家自然科學基金項目(31372444) 廣西大學科研基金項目(XGZ130959)
【分類號】:S852.65
【正文快照】: 豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproduc-tive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是豬繁殖與呼吸綜合征(Porcine reproductive and re-spiratory syndrome,PRRS)的病原。不同年齡、品種和性別的豬均可感染,以妊娠母豬和1月齡以內(nèi)的仔豬最易感,主要特征為母豬流產(chǎn)、死胎

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