發(fā)布時(shí)間：2017-08-08 19:26

  本文關(guān)鍵詞：2014-2015年我國(guó)部分地區(qū)候鳥(niǎo)禽流感病毒的鑒定及序列分析

  更多相關(guān)文章： 禽流感病毒 候鳥(niǎo) 遺傳進(jìn)化 序列分析

【摘要】：禽流感病毒屬于正黏病毒科,流感病毒屬,為單股、負(fù)鏈、分節(jié)段RNA病毒。作為A型禽流感病毒的自然宿主,候鳥(niǎo)通過(guò)遷徙為病毒的傳播、感染以及變異重排提供有利條件。因此,開(kāi)展候鳥(niǎo)禽流感監(jiān)測(cè),不僅對(duì)闡明禽流感病毒在其自然宿主中的流行病學(xué)情況具有重要意義,還能為家禽和人禽流感的監(jiān)測(cè)與預(yù)警工作提供重要參考依據(jù)。為了解禽流感病毒(AIV)的遺傳進(jìn)化關(guān)系和相關(guān)生物學(xué)特性,本研究室自2014年起,先后從我國(guó)吉林省、河南省、河北省、湖南省、青海省、內(nèi)蒙古等中國(guó)部分地區(qū)采集多種候鳥(niǎo)的拭子、糞便等7447份樣品中分離出H4N6、H5N1、H5N6、H5N8、H6N5、H9N2、H9N7、H13N6、H13N8亞型流感病毒37株,本研究選擇其中公共衛(wèi)生意義重大的H5N1亞型4株、H5N6亞型2株、H10N7亞型1株并對(duì)分離到的這7株AIVs進(jìn)行了一系列分析研究,包括全基因組序列測(cè)定、遺傳進(jìn)化分析以及重排與變異分析。4株H5N1亞型AIVs遺傳進(jìn)化分析表明,均屬于2.3.2.1C譜系,形成獨(dú)立的分支且彼此具有很高親緣關(guān)系。序列分析表明,4株AIVs的HA蛋白的裂解位點(diǎn)(R-R-R-K/-/R-G)符合高致病性禽流感的分子生物學(xué)特征;HA蛋白大部分受體結(jié)合位點(diǎn)均比較保守,但個(gè)別位點(diǎn)發(fā)生了變異,可能會(huì)導(dǎo)致AIVs分離株的宿主感染譜進(jìn)一步增大。4株AIVs NA蛋白具有3個(gè)潛在的糖基化位點(diǎn)且莖部均缺失20個(gè)氨基酸。4株H5N1亞型AIVs分離株均發(fā)生了NA基因I314V、M2基因V27A的突變,因此從分子水平推測(cè)這些毒株可能會(huì)對(duì)神經(jīng)氨酸酶抑制劑和M2離子通道抑制劑產(chǎn)生一定的耐藥性。NS氨基酸序列第80-84位缺失5個(gè)氨基酸,提示病毒具有抗干擾素活性。H5N6亞型AIVs分離株遺傳進(jìn)化分析表明該毒株為近年來(lái)新變異的2.3.4.4譜系。其中,H5N6亞型AIV長(zhǎng)沙分離株(A/Peacock/Hunan/HN-1/2015)為H5N8和H5N6重排毒株。2株H5N6亞型AIVs分離株HA蛋白的裂解位點(diǎn)(R-R-R-K/-/R-G)符合高致病性禽流感病毒特征;長(zhǎng)沙株病毒HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)發(fā)生了K205N、Q208K變異,且該毒株HA蛋白糖基化位點(diǎn)在209(NPT)發(fā)生了缺失。2株AIVs NA氨基酸序列在13-19位多7個(gè)氨基酸,NA氨基酸莖部56-74位缺失19個(gè)氨基酸。常德分離株NS氨基酸序列于79-84位發(fā)生6個(gè)氨基酸的缺失變異,而長(zhǎng)沙分離株未發(fā)生缺失變異。在耐藥性方面,兩株病毒的NA基因均發(fā)生了V116A、I117V、I314V變異,提示病毒對(duì)神經(jīng)氨酸酶抑制劑均產(chǎn)生了一定耐藥性。2株AIVs M2相關(guān)位點(diǎn)均未發(fā)生相關(guān)變異,表明M2離子通道抑制劑仍然對(duì)該亞型產(chǎn)生有效的抑制作用。H10N7亞型AIV分離株遺傳進(jìn)化分析表明該分離株屬于歐亞譜系,且與多種亞型流感病毒株相應(yīng)基因節(jié)段相似性很高,表明該分離株可能為一株多源重組流感病毒。序列分析表明其HA蛋白裂解位點(diǎn)(NVPEL-QGR/G)符合低致病禽流感病毒株的特征,且具有226Q、228G位點(diǎn)表明其更容易結(jié)合a-2,3受體,具有禽樣受體結(jié)合特性。存在6個(gè)潛在的糖基化位點(diǎn),沒(méi)有發(fā)生缺失或突變。本研究表明,候鳥(niǎo)中發(fā)現(xiàn)的H5N1、H5N6和H10N7表現(xiàn)出明顯重排與變異,提示加強(qiáng)候鳥(niǎo)禽流感的監(jiān)測(cè)對(duì)禽流感綜合防控具有重要意義。
【關(guān)鍵詞】：禽流感病毒 候鳥(niǎo) 遺傳進(jìn)化 序列分析
【學(xué)位授予單位】：吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S852.65
【目錄】：

• 摘要3-5
• Abstract5-7
• 英文縮寫(xiě)詞表7-9
• 前言9-10
• 第一篇 文獻(xiàn)綜述10-16
• 1.1 候鳥(niǎo)遷徙與禽流感病毒傳播的關(guān)系10-11
• 1.2 禽流感的流行情況11-13
• 1.3 禽流感病毒致病力和傳播能力相關(guān)分子基礎(chǔ)13-15
• 1.4 禽流感病毒耐藥性相關(guān)分子基礎(chǔ)15-16
• 第二篇 研究?jī)?nèi)容16-82
• 第一章 H5N1亞型AIV鑒定及基因序列分析16-45
• 1.1 材料與方法16-17
• 1.2 實(shí)驗(yàn)方法17-23
• 1.3 結(jié)果23-42
• 1.4 討論42-45
• 第二章 H5N6亞型AIV鑒定及基因序列分析45-68
• 2.1 材料與方法45
• 2.2 實(shí)驗(yàn)方法45-46
• 2.3 結(jié)果46-66
• 2.4 討論66-68
• 第三章 H10N7亞型AIV鑒定及基因序列分析68-82
• 3.1 材料與方法68
• 3.2 實(shí)驗(yàn)方法68-69
• 3.3 結(jié)果69-80
• 3.4 討論80-82
• 結(jié)論82-83
• 參考文獻(xiàn)83-88
• 作者簡(jiǎn)介88-89
• 致謝89

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 周鴻飛;禽流感病毒真面目[J];光明中醫(yī);2004年01期

2 ;禽流感病毒分布有明顯的地域性相關(guān)[J];山東家禽;2004年03期

3 洪水根;各國(guó)通力合作 圍剿禽流感[J];廈門科技;2004年01期

4 徐瑛;珍愛(ài)生命、關(guān)注社會(huì)、抗擊禽流感——7年級(jí)生物學(xué)課堂實(shí)錄[J];生物學(xué)通報(bào);2004年04期

5 ;低溫下的禽流感病毒能存活更長(zhǎng)時(shí)間[J];飼料與畜牧;2004年06期

6 魏秀儉,李曉鵬;禽流感病毒概述[J];聊城大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年03期

7 ;科學(xué)與禽流感之間的戰(zhàn)爭(zhēng)[J];科技資訊;2004年05期

8 ;我國(guó)禽流感病毒研究新發(fā)現(xiàn)[J];中國(guó)牧業(yè)通訊;2005年19期

9 范宗理;鴨子可擴(kuò)大禽流感病毒傳播的危險(xiǎn)性[J];自然雜志;2005年03期

10 然悠;直面禽流感[J];蘇南科技開(kāi)發(fā);2005年11期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 孫曉林;;禽流感和公共衛(wèi)生[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)病理學(xué)分第12次暨中國(guó)動(dòng)物病理生理學(xué)專業(yè)委員會(huì)第11次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2003年

2 何義林;葉冬青;;禽流感病毒對(duì)人類感染機(jī)制的研究進(jìn)展[A];第二屆全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

3 春陽(yáng);李東;;再論“以科學(xué)發(fā)展觀應(yīng)對(duì)禽流感事件”——評(píng)禽流感病毒變種兩次恐慌論[A];首屆中國(guó)黃羽肉雞行業(yè)發(fā)展大會(huì)會(huì)刊[C];2008年

4 鄧潔麗;段明星;俞初一;江龍;;聚聯(lián)乙炔有序組裝體在識(shí)別禽流感病毒方面的應(yīng)用研究[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第十二屆膠體與界面化學(xué)會(huì)議論文摘要集[C];2009年

5 孫恩澤;謝敏;趙海粟;黃碧海;劉書(shū)琳;張萬(wàn)坡;張志凌;王漢中;龐代文;;量子點(diǎn)標(biāo)記禽流感病毒[A];第六屆全國(guó)化學(xué)生物學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2009年

6 黃志堅(jiān);陳強(qiáng);李清祿;王壽昆;江和基;;不同消毒劑對(duì)禽流感病毒的殺滅試驗(yàn)[A];福建省科協(xié)第八屆學(xué)術(shù)年會(huì)分會(huì)場(chǎng)“轉(zhuǎn)變飼養(yǎng)方式，，促進(jìn)海西畜牧業(yè)和諧發(fā)展”學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2008年

7 周祖華;張敏;程禮明;徐彬;沈彩信;;禽流感流行趨勢(shì)分析[A];全國(guó)人畜共患病學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年

8 王志宇;張議文;劉桂林;;禽流感病毒的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第十一次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2010年

9 劉迎芳;饒子和;;禽流感病毒(H5N1)RNA聚合酶PA亞基相關(guān)三維晶體結(jié)構(gòu)與功能分析[A];第十一次中國(guó)生物物理學(xué)術(shù)大會(huì)暨第九屆全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)摘要集[C];2009年

10 韋婷;胡杰;蘭彬;陸文俊;蘇凱;覃芳蕓;;廣西暴發(fā)中低毒力禽流感情況報(bào)告[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)禽病學(xué)會(huì)分會(huì)第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2000年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 農(nóng)業(yè)部動(dòng)物疫病診斷與流行病學(xué)中心主任 崔尚金 博士;候鳥(niǎo)發(fā)生禽流感給我們的警示[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2005年

2 莫書(shū)瑩;世衛(wèi)警告：禽流感或大流行全球經(jīng)濟(jì)應(yīng)警惕[N];第一財(cái)經(jīng)日?qǐng)?bào);2005年

3 本報(bào)記者 魏紅欣;禽流感“啄”痛全球經(jīng)濟(jì)[N];國(guó)際金融報(bào);2005年

4 本報(bào)記者　許凱;狙擊禽流感：一場(chǎng)鳥(niǎo)與人的戰(zhàn)爭(zhēng)[N];國(guó)際金融報(bào);2005年

5 新華社記者　楊愛(ài)國(guó);防控禽流感需要加強(qiáng)國(guó)際合作[N];光明日?qǐng)?bào);2005年

6 李楊;禽流感疫情不會(huì)長(zhǎng)期影響農(nóng)產(chǎn)品期價(jià)[N];金融時(shí)報(bào);2005年

7 羅政、夏文輝;香港強(qiáng)化防止禽流感措施[N];人民日?qǐng)?bào)海外版;2004年

8 本報(bào)記者　張向永　趙秀芹;禽流感讓全世界手牽手[N];市場(chǎng)報(bào);2005年

9 ;禽流感病毒能否絕跡？[N];中國(guó)石油報(bào);2004年

10 何源;嚴(yán)防禽流感從境外傳入我國(guó)[N];中國(guó)食品質(zhì)量報(bào);2005年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 鄒鎮(zhèn);H5N1型禽流感病毒和甲型H1N1流感病毒致急性呼吸損傷的機(jī)理研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年

2 趙蔚;基于磁分離和熒光量子點(diǎn)標(biāo)記的高靈敏禽流感病毒檢測(cè)[D];武漢大學(xué);2012年

3 區(qū)嘉賢;H7N9禽流感患者的臨床特征及預(yù)后分析[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

4 劉三紅;禽流感的數(shù)學(xué)建模及數(shù)值模擬[D];華中師范大學(xué);2015年

5 樊兆斌;野鳥(niǎo)源禽流感病毒(AIV)分離株的遺傳進(jìn)化及其致病性研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2014年

6 桑曉宇;H9N2亞型禽流感病毒在豚鼠模型中水平傳播的分子機(jī)制研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

7 楊文濤;靶向樹(shù)突狀細(xì)胞通用型禽流感病毒重組乳酸菌的研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

8 石霖;北方某省主要亞型禽流感現(xiàn)地調(diào)查分析及RT-LAMP檢測(cè)方法研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

9 張曉劍;HA蛋白糖基化修飾對(duì)H5N1亞型禽流感病毒復(fù)制、致病性和抗原性的影響[D];揚(yáng)州大學(xué);2014年

10 朱聞斐;H7N9禽流感病毒致病與傳播機(jī)制研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2015年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 高曉龍;2014年度中國(guó)東部候鳥(niǎo)禽流感病毒分離與鑒定[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

2 徐曉龍;H5和H7亞型禽流感病毒熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

3 韓苗苗;一類人畜共患的禽流感傳染病傳播模型[D];大連理工大學(xué);2015年

4 王秋珍;H9N2禽流感病毒NS1蛋白誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激促進(jìn)DF-1細(xì)胞凋亡[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

5 梁威;5株H9N2亞型AIV血凝素結(jié)構(gòu)分析及感染A549細(xì)胞的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

6 劉媛媛;MDCK細(xì)胞表達(dá)雞ST3GAL I基因?qū)9亞型禽流感病毒增殖情況的影響[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

7 孟芳;H9N2亞型禽流感HA基因演化及其內(nèi)部基因在H5N2亞型流感病毒演化中的作用[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

8 韓雯;山東地區(qū)H9N2禽流感流行病學(xué)調(diào)查及流行毒株分子生物學(xué)檢測(cè)[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

9 查國(guó)飛;昆蟲(chóng)細(xì)胞表達(dá)重組H5亞型禽流感HA蛋白及其免疫原性研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

10 侯群;新疆青格達(dá)湖濕地鳥(niǎo)類中H5、H7亞型AIV和NDV流行病學(xué)監(jiān)測(cè)[D];石河子大學(xué);2015年

本文編號(hào)：641684