發(fā)布時間：2017-08-06 10:05

  本文關(guān)鍵詞：影響飼料轉(zhuǎn)化率的多基因調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析

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【摘要】：雞小腸上皮細胞中一些營養(yǎng)轉(zhuǎn)運基因和生長因子的表達變化會影響腸道對飼料中營養(yǎng)的吸收能力,導(dǎo)致個體間體重、飼料轉(zhuǎn)化率等生產(chǎn)性狀的差異。為了研究營養(yǎng)轉(zhuǎn)運基因及生長因子調(diào)控區(qū)不同的單核苷酸多態(tài)位點導(dǎo)致的基因表達差異及對相關(guān)生產(chǎn)性狀的影響,本試驗對黃羽肉雞群體中10種氨基酸轉(zhuǎn)運蛋白基因(rBAT、B0+AT、EAAT3、 y+LAT1、y+LAT2、B0AT1、CAT1、CAT2、SLC22A3、LAT1)1種糖轉(zhuǎn)運蛋白基因(SGLT1)和1種生長因子基因(FGF1)上游調(diào)控區(qū)1000bp內(nèi)的多態(tài)性位點進行了篩查并與雞飼料利用率性狀進行了關(guān)聯(lián)鑒定。試驗群體來自兩個沒有遺傳關(guān)聯(lián)背景的品系(N202、N301)共724只黃羽肉雞。試驗通過測序在12個基因上游1000bp內(nèi)發(fā)現(xiàn)了108個明顯的SNP位點,利用雙尾檢驗法篩查到可能與飼料轉(zhuǎn)化率相關(guān)的SNP位點共7個,分別是B0AT1上游T-834C、SGLT1上游G-490A、rBAT上游T-761G G-713A T-658C G-568T、FGF1上游T-899C。為進一步研究它們與飼料轉(zhuǎn)化率的關(guān)聯(lián)性,試驗在兩功能類基因中各選取了一個基因(B0AT1、FGF1)作為研究對象在兩個雞群中驗證不同基因型與飼料利用率性狀的關(guān)聯(lián),通過片段分析法對B0AT1上游T-834C、FGF1上游T-899C進行了檢測及分型,最后采用一般線性模型分析不同基因型對兩個品系飼料利用率性狀的影響。結(jié)果表明B0AT1上游T-834C在N301群體中符合Hardy-Weinberg平衡,并且此位點在該群體與FCR存在極顯著相關(guān)(P0.01),TC型個體飼料利用率極顯著高于TT型和CC型(P0.01),顯示出雜種優(yōu)勢,T-834C位點在N202群體中不符合Hardy-Weinberg平衡且與FCR相關(guān)性較低(P0.05),但C基因?qū)w重存在一定的基因效應(yīng);FGF1上游T-899C位點在兩個群體中均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),在N301群體中,此位點與FCR有顯著相關(guān)(P0.05),CC基因型比TC基因型有著更低的FCR(P0.05)。但在N202群體中,此SNP位點與FCR相關(guān)性較低(P0.05)。本次試驗在兩個雞群體中對多個功能基因上游調(diào)控區(qū)SNP位點進行了篩查并對其影響調(diào)控表達的機理進行了細致的研究,并就一些位點對生產(chǎn)性狀的影響進行了分析討論。
【關(guān)鍵詞】：肉雞 營養(yǎng)轉(zhuǎn)運 生長因子 飼料轉(zhuǎn)化率 轉(zhuǎn)錄因子
【學(xué)位授予單位】：山西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S831
【目錄】：

• 摘要7-8
• 第一章 前言8-17
• 1.1 中國優(yōu)質(zhì)肉雞發(fā)展現(xiàn)狀8
• 1.2 雞對營養(yǎng)物質(zhì)的吸收利用8
• 1.3 營養(yǎng)轉(zhuǎn)運蛋白研究進展8-13
• 1.3.1 單糖轉(zhuǎn)運蛋白9-10
• 1.3.2 氨基酸養(yǎng)轉(zhuǎn)運蛋白10-13
• 1.4 生長因子研究進展13-14
• 1.5 遺傳標記及應(yīng)用14-16
• 1.6 本試驗的研究目的、意義及主要內(nèi)容16-17
• 第二章 材料與方法17-26
• 2.1 試驗材料17-19
• 2.1.1 試驗對象17
• 2.1.2 試驗儀器17-18
• 2.1.3 試驗試劑18
• 2.1.4 常用溶液的配置18-19
• 2.1.5 常用的網(wǎng)址及軟件19
• 2.2 試驗方法19-24
• 2.2.1 SGLT1、B~0 AT1、FGF1等基因調(diào)控區(qū)SNP位點的篩查19-22
• 2.2.2 SNPs的分型22-24
• 2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計方法24-26
• 2.3.1 雙尾檢驗法24
• 2.3.2 基因頻率和基因型頻率計算24-25
• 2.3.3 Hardy-Weinberg平衡檢測25
• 2.3.4 SNPs與經(jīng)濟性狀關(guān)聯(lián)分析25-26
• 第三章 試驗結(jié)果與分析26-34
• 3.1 多基因調(diào)控區(qū)SNP篩查結(jié)果與分析26-30
• 3.1.1 群體的分析及樣本的選擇26-27
• 3.1.2 總DNA提取結(jié)果27
• 3.1.3 多基因調(diào)控區(qū)擴增結(jié)果及測序分析27-29
• 3.1.4 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點分析29-30
• 3.2 SNP分型結(jié)果30-31
• 3.2.1 B~0 AT1基因T-834C位點分型結(jié)果30-31
• 3.2.2 FGF1基因T-899C位點分型結(jié)果31
• 3.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析31-34
• 3.3.1 等位基因頻率及基因型頻率分析31-32
• 3.3.2 SNP位點與生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)分析32-34
• 第四章 討論34-37
• 4.1 目標位點的選擇、SNPs分型及引物設(shè)計34
• 4.2 Hardy-Weinberg群體遺傳平衡分析34-35
• 4.3 基因型與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析討論35-37
• 4.3.1 B~0 AT1基因T-834C基因型與生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)分析討論35-36
• 4.3.2 FGF1基因T-899C基因型與生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)分析討論36-37
• 第五章 結(jié)論37-39
• 參考文獻39-45
• Abstract45-47
• 附錄47-51
• 致謝51

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本文編號：629368