發(fā)布時間：2017-07-29 04:20

  本文關鍵詞：豬FUT1基因啟動子區(qū)的確定及活性分析

  更多相關文章： 豬 α-( )巖藻糖轉(zhuǎn)移酶基因(FUT) 啟動子區(qū) CpG島

【摘要】：F18大腸桿菌(Escherichia coli F18,E.coli F18)是養(yǎng)豬(Sus scrofa)業(yè)中發(fā)生最普遍、危害最大的病原菌之一,球系列鞘糖脂生物合成通路及通路中α-(1,2)巖藻糖轉(zhuǎn)移酶1基因(alpha(1,2)fucose transferase 1,FUT1)對斷奶仔豬F18抗性具有重要調(diào)控作用。本研究運用生物信息學技術挖掘課題組前期獲得的斷奶仔豬轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,確定FUT1基因的轉(zhuǎn)錄起始位點和啟動子區(qū)。同時對啟動子區(qū)序列進行Cp G島分析;采用雙熒光素酶報告基因以及Ali Baba 2.0軟件,分別分析啟動子區(qū)活性和Cp G島序列潛在的轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點。通過比對人類(Homo sapiens)和豬的基因序列信息數(shù)據(jù)庫,結(jié)果表明,FUT1基因轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域具有5種可變剪接(AS-1,AS-2,AS-3,AS-4和AS-5)和2個啟動子區(qū)域(啟動子1和啟動子2);雙熒光素酶報告基因檢測結(jié)果進一步顯示,FUT1基因啟動子2的轉(zhuǎn)錄活性極顯著高于啟動子1的轉(zhuǎn)錄活性(P0.01),啟動子2的活性是啟動子1的2.75倍,根據(jù)結(jié)果可以推測啟動子2在轉(zhuǎn)錄過程中起主導作用;Cp G島分析顯示,豬FUT1基因啟動子1和啟動子2分別存在一個Cp G島。FUT1啟動子1擴增片轉(zhuǎn)錄因子預測分析表明,FUT1基因啟動子1存在20個潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,并且Sp1出現(xiàn)在多個轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點處。本研究結(jié)果為豬FUT1基因的甲基化檢測和調(diào)控機制分析提供一定的基礎和依據(jù)。
【作者單位】： 揚州大學動物科學與技術學院/江蘇省動物遺傳繁育與分子設計重點實驗室;揚州大學獸醫(yī)學院;
【關鍵詞】： 豬 α-( )巖藻糖轉(zhuǎn)移酶基因(FUT) 啟動子區(qū) CpG島
【基金】：國家自然科學基金(No.31372285和No.31172183) 轉(zhuǎn)基因生物新品種培育科技重大專項(No.2014ZX08006-001B) 江蘇省高校自然科學研究重大項目(No.14KJA230003) 江蘇高校優(yōu)勢學科建設工程資助項目(PAPD)
【分類號】：S828
【正文快照】： 目前斷奶仔豬(Sus scrofa)腹瀉對規(guī)�；i場2013;Christensen et al.,2004)。大量研究表明,啟造成嚴重的危害,而產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(enterotoxi-動子區(qū)Cp G島的甲基化對基因的表達具有重要調(diào)genic Escherichia coli,ETEC)是引起斷奶仔豬腹瀉控作用,主要是通過影響染色質(zhì)結(jié)構、DN

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本文編號：587471