本文關(guān)鍵詞：豬FUT1基因啟動(dòng)子區(qū)的確定及活性分析

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【摘要】：F18大腸桿菌(Escherichia coli F18,E.coli F18)是養(yǎng)豬(Sus scrofa)業(yè)中發(fā)生最普遍、危害最大的病原菌之一,球系列鞘糖脂生物合成通路及通路中α-(1,2)巖藻糖轉(zhuǎn)移酶1基因(alpha(1,2)fucose transferase 1,FUT1)對(duì)斷奶仔豬F18抗性具有重要調(diào)控作用。本研究運(yùn)用生物信息學(xué)技術(shù)挖掘課題組前期獲得的斷奶仔豬轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,確定FUT1基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)和啟動(dòng)子區(qū)。同時(shí)對(duì)啟動(dòng)子區(qū)序列進(jìn)行Cp G島分析;采用雙熒光素酶報(bào)告基因以及Ali Baba 2.0軟件,分別分析啟動(dòng)子區(qū)活性和Cp G島序列潛在的轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)。通過(guò)比對(duì)人類(lèi)(Homo sapiens)和豬的基因序列信息數(shù)據(jù)庫(kù),結(jié)果表明,FUT1基因轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域具有5種可變剪接(AS-1,AS-2,AS-3,AS-4和AS-5)和2個(gè)啟動(dòng)子區(qū)域(啟動(dòng)子1和啟動(dòng)子2);雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)結(jié)果進(jìn)一步顯示,FUT1基因啟動(dòng)子2的轉(zhuǎn)錄活性極顯著高于啟動(dòng)子1的轉(zhuǎn)錄活性(P0.01),啟動(dòng)子2的活性是啟動(dòng)子1的2.75倍,根據(jù)結(jié)果可以推測(cè)啟動(dòng)子2在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中起主導(dǎo)作用;Cp G島分析顯示,豬FUT1基因啟動(dòng)子1和啟動(dòng)子2分別存在一個(gè)Cp G島。FUT1啟動(dòng)子1擴(kuò)增片轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)分析表明,FUT1基因啟動(dòng)子1存在20個(gè)潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),并且Sp1出現(xiàn)在多個(gè)轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)處。本研究結(jié)果為豬FUT1基因的甲基化檢測(cè)和調(diào)控機(jī)制分析提供一定的基礎(chǔ)和依據(jù)。
【作者單位】： 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院/江蘇省動(dòng)物遺傳繁育與分子設(shè)計(jì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;揚(yáng)州大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 豬 α-( )巖藻糖轉(zhuǎn)移酶基因(FUT) 啟動(dòng)子區(qū) CpG島
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31372285和No.31172183) 轉(zhuǎn)基因生物新品種培育科技重大專(zhuān)項(xiàng)(No.2014ZX08006-001B) 江蘇省高校自然科學(xué)研究重大項(xiàng)目(No.14KJA230003) 江蘇高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)工程資助項(xiàng)目(PAPD)
【分類(lèi)號(hào)】：S828
【正文快照】： 目前斷奶仔豬(Sus scrofa)腹瀉對(duì)規(guī)�；i場(chǎng)2013;Christensen et al.,2004)。大量研究表明,啟造成嚴(yán)重的危害,而產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(enterotoxi-動(dòng)子區(qū)Cp G島的甲基化對(duì)基因的表達(dá)具有重要調(diào)genic Escherichia coli,ETEC)是引起斷奶仔豬腹瀉控作用,主要是通過(guò)影響染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DN

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：587471