豬胚胎骨骼肌的發(fā)育對肌肉的生長速度和肉質(zhì)都具有重要的作用�，F(xiàn)階段對豬的胚胎骨骼肌的研究主要集中在蛋白編碼基因和小非編碼RNA上，而對長非編碼RNA的研究較少。此前的研究表明長非編碼RNA對肌肉的發(fā)育和分化也具有重要作用。本文利用RNA測序技術(shù)首次系統(tǒng)的在豬的胚胎骨骼肌中鑒定了基因間長非編碼RNA并對其分子特征進(jìn)行了分析。此外對一個物種間保守的基因間長非編碼RNA的功能進(jìn)行了分析，主要研究結(jié)果如下： 1RNA測序得到的reads經(jīng)過tophat比對基因組和cufflinks組裝后一共得到54550條轉(zhuǎn)錄本，經(jīng)過我們的過濾流程最終得到570條lincRNA，其對應(yīng)于476個基因座。這些lincRNA的平均長度為1043bp，平均外顯子數(shù)為2.5個，其中只有兩個外顯子的lincRNA的比例達(dá)到了65.7%。lincRNA的平均FPKM值為12，其中低于15的占到了總數(shù)的91.2%。除了Y染色體，lincRNA在不同的染色體上都有分布。經(jīng)過BLASTN比對后，有28條豬lincRNA能在人lincRNA找到orthologs，有6條能在小鼠lincRNA找到orthologs (E value...

【文章頁數(shù)】：97 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1豬骨骼肌發(fā)育的示意圖（(Zhaoetal.,2011),有修改）

例如，仔豬剛出生的時候其骨骼肌纖維大部分類型是氧化型，隨著仔豬的不斷生長，肌纖維開始轉(zhuǎn)變?yōu)榻徒庑�，此外肌纖維的直徑也是迅速變大的。豬的骨骼肌的發(fā)育主要分為以下四個步驟（圖1）：（1）成肌前體細(xì)胞向成肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)變；（2）成肌細(xì)胞的增殖、分化形成肌管，肌管進(jìn)一步融合形成初級肌纖維；（....

圖2lncRNA的種類(Moranetal.,2012)

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文第一章文獻(xiàn)綜述術(shù)的廣泛應(yīng)用以及人類ENCODE計(jì)劃的基本完成，人們發(fā)現(xiàn)了的越來越多的lncRNA(Maedaeta2006;Guttmanetal.,2010;Cabilietal.,2011;Derrienetal.,2....

圖3長鏈非編碼RNA的生物學(xué)功能(Merceretal.,2009)

反義鏈會轉(zhuǎn)錄一條lncRNA，該RNA可與Zeb2mRNA內(nèi)含子的5’剪切位點(diǎn)區(qū)域形成互補(bǔ)雙鏈，從而能夠抑制該內(nèi)含子的剪切。然而該區(qū)域含有一個核糖體結(jié)合位點(diǎn)，這個位點(diǎn)對Zeb2蛋白的表達(dá)不可或缺，該lncRNA通過這種互補(bǔ)雙鏈的方式提高Zeb2蛋白的表達(dá)量(Beltranet....

圖4Paraspeckle形成的模型(Bondetal.,2009)

明一些lncRNA對一些亞細(xì)胞核的形成和功能的行使也發(fā)揮了重要作用。1）參與Paraspeckles形成raspeckles是一個相對較新的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)，該結(jié)構(gòu)只存在于哺乳動物核類以及一些轉(zhuǎn)化細(xì)胞系中(Foxetal.,2002)，其不存在于人胚胎干細(xì)胞，但在細(xì)胞分化時會顯現(xiàn)....

本文編號：3997331