本文關(guān)鍵詞：基于RNA-seq技術(shù)對(duì)不同品種豬背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因的篩選與注釋

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【摘要】：【目的】篩選皖南花豬和大約克豬背最長(zhǎng)肌組織差異表達(dá)基因�！痉椒ā坎杉钅匣ㄘi和大約克豬背最長(zhǎng)肌(各3頭),測(cè)定其肉質(zhì)性狀指標(biāo),并提取其RNA,采用高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)技術(shù)進(jìn)行測(cè)序,對(duì)所獲序列進(jìn)行GO和Pathway顯著性富集分析�！窘Y(jié)果】測(cè)序后皖南花豬3個(gè)樣本得到的總序列數(shù)分別為65 584 126,64 327 738和59 244 502,其中有效序列達(dá)到94.4%,94.3%和94.2%;大約克豬3個(gè)樣本得到的總序列數(shù)分別為57 969 134,68 254 168和72 298 142,其中有效序列達(dá)到93.8%,93.7%和93.8%。測(cè)序飽和度良好,證明測(cè)序數(shù)據(jù)真實(shí)可靠。差異表達(dá)分析結(jié)果顯示,共篩選到347個(gè)差異表達(dá)基因,其中包含94個(gè)上調(diào)基因,253個(gè)下調(diào)基因。GO功能顯著性富集和Pathway顯著性富集分析發(fā)現(xiàn),差異表達(dá)基因富集在與糖酵解代謝和肌肉發(fā)育相關(guān)的生物學(xué)過程中以及與脂肪酸代謝和生長(zhǎng)性狀、胴體性狀相關(guān)的信號(hào)通路上。【結(jié)論】獲得了豬背最長(zhǎng)肌組織基因表達(dá)譜,篩選出了一些與肉質(zhì)性狀和生長(zhǎng)性狀有關(guān)的候選基因。
【作者單位】： 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】： RNA-seq 皖南花豬 大約克豬 差異表達(dá)基因 背最長(zhǎng)肌
【基金】：安徽省生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(AHCYTX-06-10) 安徽省生豬現(xiàn)代農(nóng)業(yè)項(xiàng)目(13000101) 安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)建設(shè)項(xiàng)目(13C0405)
【分類號(hào)】：S828
【正文快照】： 豬肉是人類動(dòng)物蛋白的主要來源,我國(guó)是世界上生豬生產(chǎn)和豬肉消費(fèi)第一大國(guó)。隨著社會(huì)生產(chǎn)力的提高以及生活水平的改善,人們對(duì)高品質(zhì)和健康優(yōu)質(zhì)豬肉的需求也不斷增加。因此改善肉品質(zhì)已經(jīng)成為豬肉產(chǎn)業(yè)的重要課題。骨骼肌是動(dòng)物體內(nèi)最豐富的組織,約占動(dòng)物體質(zhì)量的40%,豬肌肉生長(zhǎng)

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張賢群,覃矜,SKondracki;品種、性別和飼喂水平對(duì)背最長(zhǎng)肌脂肪酸成分的影響[J];國(guó)外畜牧學(xué)(豬與禽);2001年01期

2 馬文強(qiáng);馮杰;許梓榮;汪以真;劉建新;;豬背最長(zhǎng)肌肌紅蛋白基因片段的克隆及甘氨酸鐵對(duì)其表達(dá)的影響[J];浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版);2009年05期

3 黃金秀;劉作華;楊飛云;葉婷;江山;肖融;;品種、體重和營(yíng)養(yǎng)對(duì)豬背最長(zhǎng)肌肌纖維組織學(xué)特性的影響[J];中國(guó)畜牧雜志;2010年13期

4 虞德兵;熊鍇;張宇霞;葦小菲;文平;王林云;黃瑞華;劉紅林;;豬IGF2 Intron3 G3072A突變及其在背最長(zhǎng)肌中差異表達(dá)[J];南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2010年06期

5 宋凡;閆冬梅;周淑蘭;;豬背最長(zhǎng)肌、皮下脂肪及飼料脂肪酸組成的快速測(cè)定[J];飼料研究;2011年10期

6 孟質(zhì)文;張瑞紅;安s，

本文編號(hào)：560971