雞TGF-β2基因啟動子區(qū)多態(tài)性分析
本文關(guān)鍵詞:雞TGF-β2基因啟動子區(qū)多態(tài)性分析
【摘要】:為了研究雞TGF-β2基因啟動子區(qū)的SNP及其對啟動子功能元件的影響,采用PCR-SSCP方法對16個雞種的TGF-β2啟動子區(qū)的554~824 bp(即3號染色體的19 433 476~19 433 746 bp)進行基因分型,經(jīng)測序,共檢測到3個有效的SNPs位點,分別是679位點的C/G,699位點的G/A,774位點的T/C。其中大骨雞和太湖雞在3個位點均檢測到SNP存在,AA雞在3個位點都沒有發(fā)現(xiàn)SNPs。分別利用生物信息學(xué)軟件JASPAR和Meth Primer預(yù)測TGF-β2基因啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點和Cp G島,發(fā)現(xiàn)SNP位點可改變轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點且位于Cp G島上,表明TGF-β2啟動子區(qū)SNPs可能通過不同方式影響基因表達調(diào)控。
【作者單位】: 揚州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 雞 TGF-β 啟動子 SNP
【基金】:江蘇省六大人才高峰項目資助(2015-NY-019) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技支撐(BE2013392)
【分類號】:S831.2
【正文快照】: 轉(zhuǎn)化生長因子β(TGF-β)是一類具有多種重要生物活性功能的細(xì)胞因子,主要由淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞所釋放[1],在調(diào)控生物體免疫、創(chuàng)傷愈合、血管生成等生理過程,組織纖維化和癌癥等疾病的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著重要調(diào)控作用[2-3]。TGF-β信號通路中包括50多個與結(jié)構(gòu)相關(guān)的
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9 馬超鋒;梁小娟;王明玉;徐永杰;;豬hnRNPK基因啟動子的克隆及序列分析[J];信陽師范學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版);2014年01期
10 孟仁;陳創(chuàng)夫;張輝;王遠(yuǎn)志;郭飛;魯芝子;李瑞芳;;布魯氏菌2308ery基因啟動子缺失株的構(gòu)建及鑒定[J];生物技術(shù);2012年02期
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1 杜愛芳;龐林海;周前進;侯玉慧;高翔;;含肌動蛋白啟動子Act-1的單雙啟動子真核表達載體的構(gòu)建及表達研究比較[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜寄生蟲學(xué)分會第九次學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2006年
2 謝瑩;莫德林;陳瑤生;;豬PNAS-4基因啟動子調(diào)控特征分析[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年
3 趙曉;莫德林;李安寧;陳衛(wèi)權(quán);張宗武;張之晟;肖書奇;覃麗梅;牛玉娜;陳瑤生;;豬TMOD4基因的克隆、組織表達譜、亞細(xì)胞定位以及啟動子分析[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年
4 王林杰;熊遠(yuǎn)著;左波;徐德全;任竹青;雷明剛;;豬AMPD1基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究及其啟動子區(qū)域的SNP的發(fā)掘[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年
5 曹瑞兵;顧金燕;張羽;陳溥言;;PCV2 Rep基因啟動子區(qū)vISRE突變株的生物學(xué)特性研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜傳染病學(xué)分會第七屆全國會員代表大會暨第十三次學(xué)術(shù)研討會論文集(上冊)[C];2009年
6 王春生;余剛;張立新;安鐵洙;;綿羊毛發(fā)角蛋白結(jié)合蛋白啟動子的克隆及其在成纖維細(xì)胞中的活性分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物解剖學(xué)及組織胚胎學(xué)分會第十四次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2006年
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1 馬誠太;不同啟動子和插入位點表達AIV-H9 HA抗原的重組馬立克氏病病毒的構(gòu)建和比較研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
2 韋光輝;徐淮山羊Sox2、c-Myc和Oct4基因啟動子功能的初步研究[D];揚州大學(xué);2014年
3 袁晶;經(jīng)濟性狀基因CRABP2、TOB1和TIM4功能的初步研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
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1 牛婷;表達IBV S1蛋白抗原表位的含雞源啟動子的真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建及其免疫原性檢測[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
2 赫秋亞;西農(nóng)薩能奶山羊超長鏈脂肪酸延伸酶6(ELOVL6)基因啟動子轉(zhuǎn)錄調(diào)控機理研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年
3 田家偉;豬PDK4基因啟動子的克隆及其活性分析[D];西南大學(xué);2012年
4 夏明秀;雞Piwill啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的初步研究[D];揚州大學(xué);2014年
5 唐瀾;兔OCT4基因啟動子驅(qū)動RFP表達載體的構(gòu)建及驗證[D];東北林業(yè)大學(xué);2014年
6 王明明;牛MYOZ1、MYOZ2基因啟動子活性分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
7 李君;西農(nóng)薩能羊脂肪酸合酶(FASN)基因啟動子結(jié)構(gòu)和功能研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2011年
8 周計丹;豬O3FAR1基因啟動子的克隆及轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
,本文編號:529652
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