本文關(guān)鍵詞：雞TGF-β2基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性分析

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【摘要】：為了研究雞TGF-β2基因啟動(dòng)子區(qū)的SNP及其對(duì)啟動(dòng)子功能元件的影響,采用PCR-SSCP方法對(duì)16個(gè)雞種的TGF-β2啟動(dòng)子區(qū)的554~824 bp(即3號(hào)染色體的19 433 476~19 433 746 bp)進(jìn)行基因分型,經(jīng)測(cè)序,共檢測(cè)到3個(gè)有效的SNPs位點(diǎn),分別是679位點(diǎn)的C/G,699位點(diǎn)的G/A,774位點(diǎn)的T/C。其中大骨雞和太湖雞在3個(gè)位點(diǎn)均檢測(cè)到SNP存在,AA雞在3個(gè)位點(diǎn)都沒(méi)有發(fā)現(xiàn)SNPs。分別利用生物信息學(xué)軟件JASPAR和Meth Primer預(yù)測(cè)TGF-β2基因啟動(dòng)子區(qū)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)和Cp G島,發(fā)現(xiàn)SNP位點(diǎn)可改變轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)且位于Cp G島上,表明TGF-β2啟動(dòng)子區(qū)SNPs可能通過(guò)不同方式影響基因表達(dá)調(diào)控。
【作者單位】： 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 雞 TGF-β 啟動(dòng)子 SNP
【基金】：江蘇省六大人才高峰項(xiàng)目資助(2015-NY-019) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技支撐(BE2013392)
【分類號(hào)】：S831.2
【正文快照】： 轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β(TGF-β)是一類具有多種重要生物活性功能的細(xì)胞因子,主要由淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞所釋放[1],在調(diào)控生物體免疫、創(chuàng)傷愈合、血管生成等生理過(guò)程,組織纖維化和癌癥等疾病的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著重要調(diào)控作用[2-3]。TGF-β信號(hào)通路中包括50多個(gè)與結(jié)構(gòu)相關(guān)的

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本文編號(hào)：529652