畜禽長鏈非編碼RNA的功能及其研究方法
本文關(guān)鍵詞:畜禽長鏈非編碼RNA的功能及其研究方法,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt的RNA分子,不具有編碼蛋白質(zhì)的能力,主要參與脂肪代謝、肌肉發(fā)育、胚胎發(fā)育、性別決定與分化等多種生物過程和疾病的調(diào)控。在LncRNA研究中,研究方法的建立和應(yīng)用起著至關(guān)重要的作用。作者簡述了LncRNA的生物學(xué)特性和生物學(xué)功能,重點介紹了LncRNA的主要研究方法:基因芯片、RNA-seq、Northern blotting、熒光原位雜交(FISH)、實時熒光定量PCR、RNA結(jié)構(gòu)平行分析(PARS)、快速預(yù)測RNA和蛋白質(zhì)相互作用(CatRAPID)等,同時介紹了LncRNA與DNA、RNA及蛋白質(zhì)的相互作用的方法:RNA-pulldown、RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀(RIP)、光活性增強的核糖核苷交聯(lián)和免疫共沉淀(PAR-CLIP)、RNA反義純化(RAP)、RNA純化的染色質(zhì)分離(CHIRP)及RNA靶標的捕獲雜交分析(CHART)、交聯(lián),連接以及混合測序(CLASH),為畜禽動物中LncRNA的研究提供借鑒。
【作者單位】: 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院國家獸藥殘留基準實驗室(HZAU)農(nóng)業(yè)部畜禽產(chǎn)品質(zhì)量安全風險評估實驗室(武漢)農(nóng)業(yè)部獸藥殘留檢測重點開放實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 長鏈非編碼RNA 畜禽 生物學(xué)功能 研究方法
【基金】:國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃:2011AA10A214)
【分類號】:S852.2
【正文快照】: 基因組計劃研究表明,在組成人類基因組的30億個堿基對中,約有93%的基因序列可以被轉(zhuǎn)錄,但是不具有編碼蛋白質(zhì)能力的非編碼RNA占轉(zhuǎn)錄組的98%[1]。這些序列曾被認為是進化過程中累積的“垃圾序列”,是RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,不具有生物學(xué)功能,因而沒有給予足夠的重視。隨著測
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本文關(guān)鍵詞:畜禽長鏈非編碼RNA的功能及其研究方法,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:508412
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