本文關(guān)鍵詞：RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析不同季節(jié)對(duì)檳榔江水牛精液品質(zhì)的影響，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：本研究旨在利用RNA-seq技術(shù)對(duì)不同季節(jié)檳榔江水牛全血mRNA進(jìn)行分析,找出不同季節(jié)精液品質(zhì)候選基因。選取5頭生長(zhǎng)狀況相近的3~5歲檳榔江水牛,進(jìn)行春、夏、秋、冬4個(gè)季節(jié)的精液品質(zhì)(鮮精活力、精子畸形率、射精量、精子密度)檢測(cè)。根據(jù)精液品質(zhì),選取差異極顯著的春(BL)、夏(SBL)兩個(gè)季節(jié)的水牛樣品進(jìn)行RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。頸靜脈采集全血,抽提mRNA并組內(nèi)混合制樣,利用RNA-seq技術(shù)分析不同季節(jié)檳榔江水牛全血mRNA差異表達(dá)。根據(jù)差異倍數(shù)1.5,P0.05的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選,得到差異基因,再利用DAVID6.7軟件對(duì)差異基因進(jìn)行GO和KEGG分析,通過(guò)RT-PCR驗(yàn)證基因芯片結(jié)果的準(zhǔn)確性。結(jié)果表明:差異表達(dá)基因84個(gè),其中上調(diào)基因56個(gè),下調(diào)基因28個(gè);GO分析發(fā)現(xiàn),這些差異基因與應(yīng)激反應(yīng)、免疫反應(yīng)有關(guān);KEGG分析表明,差異基因顯著富集到腫瘤壞死因子(TNF)和T細(xì)胞受體信號(hào)通路。其中,神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子受體類(lèi)似物死亡結(jié)構(gòu)域(NRADD,又叫熱休克蛋白因子1(HSF1))、原癌基因FOS和JUN,與精液品質(zhì)相關(guān)性強(qiáng),可作為進(jìn)一步研究的靶基因。
【作者單位】： 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： RNA-seq 檳榔江水牛 差異表達(dá)基因 精液品質(zhì)
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372290) “十二五”國(guó)家科技計(jì)劃項(xiàng)目(2012BAD12B10)
【分類(lèi)號(hào)】：S823.83
【正文快照】： 檳榔江水牛(Betelnut-jiang buffalo)是中國(guó)發(fā)現(xiàn)唯一的河流型水牛,主產(chǎn)于騰沖檳榔江上游,檳榔江水牛體型較小,飼料消耗較低,而且產(chǎn)奶量相對(duì)較高,牛奶營(yíng)養(yǎng)豐富,是比較好的乳用品種。當(dāng)前,人工授精技術(shù)及冷凍精液的日益普及,具有優(yōu)良性狀的種公牛越來(lái)越受到重視。檳榔江水牛作為

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：507512