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RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序分析不同季節(jié)對檳榔江水牛精液品質(zhì)的影響

發(fā)布時間:2017-07-01 21:16

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【摘要】:本研究旨在利用RNA-seq技術(shù)對不同季節(jié)檳榔江水牛全血mRNA進行分析,找出不同季節(jié)精液品質(zhì)候選基因。選取5頭生長狀況相近的3~5歲檳榔江水牛,進行春、夏、秋、冬4個季節(jié)的精液品質(zhì)(鮮精活力、精子畸形率、射精量、精子密度)檢測。根據(jù)精液品質(zhì),選取差異極顯著的春(BL)、夏(SBL)兩個季節(jié)的水牛樣品進行RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序分析。頸靜脈采集全血,抽提mRNA并組內(nèi)混合制樣,利用RNA-seq技術(shù)分析不同季節(jié)檳榔江水牛全血mRNA差異表達。根據(jù)差異倍數(shù)1.5,P0.05的標準進行篩選,得到差異基因,再利用DAVID6.7軟件對差異基因進行GO和KEGG分析,通過RT-PCR驗證基因芯片結(jié)果的準確性。結(jié)果表明:差異表達基因84個,其中上調(diào)基因56個,下調(diào)基因28個;GO分析發(fā)現(xiàn),這些差異基因與應激反應、免疫反應有關(guān);KEGG分析表明,差異基因顯著富集到腫瘤壞死因子(TNF)和T細胞受體信號通路。其中,神經(jīng)營養(yǎng)因子受體類似物死亡結(jié)構(gòu)域(NRADD,又叫熱休克蛋白因子1(HSF1))、原癌基因FOS和JUN,與精液品質(zhì)相關(guān)性強,可作為進一步研究的靶基因。
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學動物科技學院;
【關(guān)鍵詞】RNA-seq 檳榔江水牛 差異表達基因 精液品質(zhì)
【基金】:國家自然科學基金項目(31372290) “十二五”國家科技計劃項目(2012BAD12B10)
【分類號】:S823.83
【正文快照】: 檳榔江水牛(Betelnut-jiang buffalo)是中國發(fā)現(xiàn)唯一的河流型水牛,主產(chǎn)于騰沖檳榔江上游,檳榔江水牛體型較小,飼料消耗較低,而且產(chǎn)奶量相對較高,牛奶營養(yǎng)豐富,是比較好的乳用品種。當前,人工授精技術(shù)及冷凍精液的日益普及,具有優(yōu)良性狀的種公牛越來越受到重視。檳榔江水牛作為

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本文編號:507512

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