本文關(guān)鍵詞：谷胱甘肽促進(jìn)牛體外受精胚胎發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組初探，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：旨在探究牛體外受精胚胎的培養(yǎng)液中添加3mmol·L~(-1)谷胱甘肽(Glutathione,GSH)后,8~16-細(xì)胞期和桑椹期的牛體外胚胎在轉(zhuǎn)錄組水平上的變化。收集8~16-細(xì)胞期和桑椹期的體外受精胚胎,構(gòu)建文庫,通過Illumina平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序;篩選差異基因,并進(jìn)行功能注釋和代謝途徑分析;采用定量PCR對(duì)10個(gè)基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè),以驗(yàn)證測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性;在獲得的新轉(zhuǎn)錄本中挑選3組進(jìn)行RNA和蛋白結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)。通過OOSP1、THAP9等10個(gè)基因的定量檢測(cè)、測(cè)序結(jié)果的質(zhì)量評(píng)價(jià)(堿基錯(cuò)誤率、Q20、Q30、GC含量)、reads與�；蚪M的比對(duì)及其在基因組的分布統(tǒng)計(jì)分析,均說明該測(cè)序結(jié)果準(zhǔn)確、可靠。測(cè)序獲得差異表達(dá)基因4 100個(gè)(其中,處理組8~16-細(xì)胞期胚胎和桑椹胚中3 952個(gè),對(duì)照組中884個(gè)),已知基因2 225個(gè),未知基因1 875個(gè)。這些差異基因主要富集到與ATP合成、呼吸鏈、DNA合成、翻譯過程和物質(zhì)代謝相關(guān)的84條GO terms上,參與細(xì)胞黏附、檸檬酸循環(huán)、谷胱甘肽代謝、溶酶體以及氨基酸代謝等27條通路。另外,與已知的轉(zhuǎn)錄本相比,5個(gè)新轉(zhuǎn)錄本中均發(fā)現(xiàn)不同長(zhǎng)度的新外顯子;預(yù)測(cè)的蛋白結(jié)構(gòu)中除包含各自的保守結(jié)構(gòu)域(絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的催化結(jié)構(gòu)域、MAD同源結(jié)構(gòu)域)外,還發(fā)現(xiàn)2個(gè)新的蛋白結(jié)構(gòu)域(低復(fù)雜區(qū)、dwarfins蛋白家族B結(jié)構(gòu)域)。綜上表明,在培養(yǎng)液中添加GSH能導(dǎo)致胚胎轉(zhuǎn)錄譜的變化,顯著提高胚胎的體外發(fā)育能力。
【作者單位】： 河北工程大學(xué);中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 牛體外胚胎 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 定量PCR 新轉(zhuǎn)錄本 功能注釋 代謝通路
【基金】：國(guó)家科技支撐項(xiàng)目(2012BAD12B01-2) 基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)重點(diǎn)項(xiàng)目(2013ywf-zd-2) 家畜胚胎工程與繁殖創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(ASTIP-IAS06-2016)
【分類號(hào)】：S823
【正文快照】： 胚胎發(fā)育是一個(gè)精密且高度協(xié)調(diào)的過程,為確保早期胚胎發(fā)育周期的有序進(jìn)行,維持細(xì)胞內(nèi)氧自由基(Reactive oxygen species,ROS)產(chǎn)生和清除的平衡至關(guān)重要。在正常的細(xì)胞代謝過程中,各個(gè)系統(tǒng)都會(huì)產(chǎn)生ROS并發(fā)揮一定的生物學(xué)作用,包括信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及功能調(diào)控等[1]。但ROS過量積累會(huì)對(duì)細(xì)

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：489038