豬傳染性胃腸炎病毒分離株JS2012全基因組序列分析
發(fā)布時間:2017-06-20 15:02
本文關(guān)鍵詞:豬傳染性胃腸炎病毒分離株JS2012全基因組序列分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:設(shè)計32對PCR引物分片段擴增豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)江蘇分離株JS2012全基因組,擴增產(chǎn)物克隆到p MD19-T載體并測序。用DNAstar軟件將JS2012全基因組序列與Gen Bank中其他13株TGEV株和豬呼吸道冠狀病毒(PRCV-ISU-1)序列進行比對以及同源性分析,并繪制基因進化樹。JS2012基因組序列全長28 542 bp,不包括poly A;蚪M的排列為TGEV典型的基因排列序:5'-ORF1a-ORF1b-S-3a-3b-E-M-N-7-3'。TGEV JS2012株的ORF3基因和Miller組病毒一樣有2個大片段的缺失。JS2012的S基因和Miller M6以及Virulent Purdue 2個強毒株有同樣的序列特征。除Virulent Purdue外,其余Purdue株在1 123~1 128 bp處均有6 bp的缺失,JS2012與所有Miller株及Virulent Purdue一樣,此處沒有缺失。JS2012與其他TGEV毒株之間的堿基序列同源性為98.6%~99.9%,與Miller M6的堿基序列同源性最高,親緣關(guān)系最近,同屬于Miller組,與Purdue組相對較遠。
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院獸醫(yī)研究所/農(nóng)業(yè)部獸用生物制品工程技術(shù)重點實驗室/國家獸用生物制品工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV) 全基因組 序列分析
【基金】:江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新基金項目(CX(15)1056)
【分類號】:S858.28
【正文快照】: 豬傳染性胃腸炎病毒(Transmissible gastroenter-itis virus,TGEV)屬于冠狀病毒科(Coronaviridae)冠狀病毒屬(Coronavirus),引起豬急性、高度接觸性傳染性胃腸炎(Transmissible gastroenteritis,TGE),不同品種和年齡的豬均易感染,2周齡以下仔豬主要癥狀為嘔吐、嚴(yán)重腹瀉、脫水
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本文編號:465959
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