豬脂肪合成過程分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平的表達(dá)分析
發(fā)布時間:2025-05-11 05:05
對豬脂肪沉積性狀候選基因的研究多集中于基因多態(tài)性的研究,但由于脂肪沉積性狀是數(shù)量性狀,受控于多基因,各基因在不同時空狀態(tài)下又受到多級上游基因的調(diào)控。因此,研究單個基因并不能全面解釋脂肪沉積性狀的遺傳機理,挖掘影響脂肪沉積的基因,研究諸基因的表達(dá)關(guān)系成為研究脂肪沉積的關(guān)鍵。本研究基于文獻(xiàn)挖掘的方法,以脂肪合成的生物化學(xué)過程為基礎(chǔ),確定脂肪酸合成、脂肪酸鏈的延長和去飽和、三酰甘油的合成三個階段的催化反應(yīng)酶及其編碼基因,以及已見報道的對上述基因有調(diào)控作用的基因,以此構(gòu)建脂肪合成的分子表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。 本文構(gòu)建出了以PPARγ、LXRα、SREBP-1、ChREBP基因為主干的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)中有多條通路可調(diào)控FASN、ACC、DGAT、GPAT、ACSL等脂肪合成催化酶的編碼基因。包括PPARγ→LXRα→SREBP-1→FASN(ACC、Thrsp、S14R)通路,PPARγ→LXRα→ChREBP→FASN(ME、SCD1、Thrsp、ACC、FASN、S14R)通路及其他調(diào)控通路。FASN、ACC、DGAT、GPAT、ACSL等催化酶基因處于通路的最下游位置。 研究過程中發(fā)現(xiàn),豬脂肪...
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 豬育種技術(shù)及其發(fā)展趨勢
1.2 豬脂肪細(xì)胞的分化增殖和肥大
1.3 脂肪沉積性狀
1.4 脂肪合成相關(guān)基因
1.4.1 ACC 基因
1.4.2 THRSP 基因
1.4.3 ACSL 基因
1.5 本研究內(nèi)容及意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物
2.1.2 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建材料
2.1.3 生物信息分析材料
2.1.4 樣本采集
2.1.5 試驗設(shè)備和儀器
2.1.6 主要試劑
2.1.7 需配制試劑
2.2 試驗方法和步驟
2.2.1 豬脂肪合成基因網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法
2.2.2 主要生物信息分析軟件
2.2.3 豬樣品的采集
2.2.4 總 RNA 的提取、純化與反轉(zhuǎn)錄
2.2.5 不同組織的表達(dá)量檢測
2.2.6 數(shù)據(jù)分析方法
3 結(jié)果與分析
3.1 脂肪合成過程基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
3.1.1 甘油三酯生化合成催化酶的確定
3.1.2 脂肪合成過程基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
3.2 主要基因生物信息學(xué)分析
3.2.1 脂肪合成過程基因染色體位置
3.2.2 基因編碼蛋白的一級結(jié)構(gòu)分析
3.2.3 基因編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)分析
3.2.4 基因編碼蛋白的功能預(yù)測
3.2.5 蛋白亞細(xì)胞定位
3.2.6 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測
3.3 基因 mRNA 相對表達(dá)量分析結(jié)果
3.3.1 總 RNA 的提取
3.3.2 基因擴增曲線
3.3.3 基因溶解曲線
3.3.4 不同體重階段 3 個基因的表達(dá)趨勢及相關(guān)性分析
4 討論
4.1 脂肪合成的生化過程
4.2 脂肪合成表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
4.3 關(guān)鍵基因轉(zhuǎn)錄蛋白的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)
4.4 關(guān)鍵基因的表達(dá)與調(diào)控
4.5 有待進一步解決的問題
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略詞表
在讀期間已發(fā)表論文
作者簡歷
致謝
本文編號:4044889
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1 引言
1.1 豬育種技術(shù)及其發(fā)展趨勢
1.2 豬脂肪細(xì)胞的分化增殖和肥大
1.3 脂肪沉積性狀
1.4 脂肪合成相關(guān)基因
1.4.1 ACC 基因
1.4.2 THRSP 基因
1.4.3 ACSL 基因
1.5 本研究內(nèi)容及意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物
2.1.2 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建材料
2.1.3 生物信息分析材料
2.1.4 樣本采集
2.1.5 試驗設(shè)備和儀器
2.1.6 主要試劑
2.1.7 需配制試劑
2.2 試驗方法和步驟
2.2.1 豬脂肪合成基因網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法
2.2.2 主要生物信息分析軟件
2.2.3 豬樣品的采集
2.2.4 總 RNA 的提取、純化與反轉(zhuǎn)錄
2.2.5 不同組織的表達(dá)量檢測
2.2.6 數(shù)據(jù)分析方法
3 結(jié)果與分析
3.1 脂肪合成過程基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
3.1.1 甘油三酯生化合成催化酶的確定
3.1.2 脂肪合成過程基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
3.2 主要基因生物信息學(xué)分析
3.2.1 脂肪合成過程基因染色體位置
3.2.2 基因編碼蛋白的一級結(jié)構(gòu)分析
3.2.3 基因編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)分析
3.2.4 基因編碼蛋白的功能預(yù)測
3.2.5 蛋白亞細(xì)胞定位
3.2.6 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測
3.3 基因 mRNA 相對表達(dá)量分析結(jié)果
3.3.1 總 RNA 的提取
3.3.2 基因擴增曲線
3.3.3 基因溶解曲線
3.3.4 不同體重階段 3 個基因的表達(dá)趨勢及相關(guān)性分析
4 討論
4.1 脂肪合成的生化過程
4.2 脂肪合成表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
4.3 關(guān)鍵基因轉(zhuǎn)錄蛋白的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)
4.4 關(guān)鍵基因的表達(dá)與調(diào)控
4.5 有待進一步解決的問題
5 結(jié)論
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本文編號:4044889
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