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豬不同骨骼肌長鏈非編碼RNA的鑒定及其功能分析

發(fā)布時間:2024-12-18 06:21
  豬骨骼肌是一種高度異質(zhì)性的組織類型,其中背最長肌和腰大肌作為豬最具經(jīng)濟價值且生理代謝迥異的兩種骨骼肌,一直是豬分子育種改良的研究重點。長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA, lncRNA),尤其是環(huán)狀RNA (circular RNA, circRNA)作為繼microRNA之后調(diào)控性非編碼RNA的重要新成員,已成為生命科學研究的前沿熱點。然而相對于人和模式動物,豬lncRNA(包括circRNA)的鑒定和功能研究相當滯后。本研究利用RNA-seq技術(shù)對豬背最長肌(LDM)和腰大肌(PMM)進行了轉(zhuǎn)錄組測序,并結(jié)合自行建立的生物信息學鑒定流程,對各測序文庫中的mRNA、lncRNA以及circRNA進行了分選鑒定以及深度分析,主要結(jié)果如下:(1)豬LDM的肌纖維橫截面積(2.82×103μm2)顯著大于PMM肌纖維橫截面積(1.91 × 103μm2)(P<0.05)。(2)豬LDM組織中Ⅱb型肌纖維(MyHC4,快速酵解型)的比例極顯著的高于PMM組織(P<0.001),而PMM組織中I型肌纖維(MyHC7,慢速氧化型)的含量極顯著高于LDM(P<...

【文章頁數(shù)】:183 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1-1?IncRNA介導的染色質(zhì)修飾模式圖[83]??Fig.?1-1?IncRNA-mediated?chromatin?modification??

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H?eteroc?hrom?ati?n??圖1-1?IncRNA介導的染色質(zhì)修飾模式圖[83]??Fig.?1-1?IncRNA-mediated?chromatin?modificatio因印跡現(xiàn)象??參與介導了基因印跡現(xiàn)象。高等動物基


圖1-7各種IncRNA研巧方法的建立時間??Fi.?1-7?The?creation?time?of?different?me化ods?for?化e?identification?of?IncRNA??

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?糖巧質(zhì)數(shù)索抱答元巧??圖1-6?GajJ作為誘巧分子的作用機制tusi??Fig.?1-6?The?mechanism?of?Gas5?functioning?as?a?Decoy?molecule^??DNA?損傷活化?P21?相關(guān)的非編碼?RNA?(P21?associat....


圖4-2不同骨骼肌肌纖維分型結(jié)果??

圖4-2不同骨骼肌肌纖維分型結(jié)果??

注:圖中數(shù)據(jù)為Mew?±犯,檢驗方法為/-檢驗,**表示尸<0.001。??No化:All?values?we化?Mean?±?SD;?Student?Mest,**?indicate?尸?<?0.001.??不同骨骼肌姐織的肌纖維分型結(jié)果顯示(圖4-2),腰大肌(PMM)中I型....


圖4-3不同骨骼肌肌中氧化、酵解酶基因表達水平L:A及線粒體拷貝數(shù)??

圖4-3不同骨骼肌肌中氧化、酵解酶基因表達水平L:A及線粒體拷貝數(shù)??

Note:?All?values?were?Mean?±?SD;?student?Mest,?*indicate?P?<?0.05,**?indicate?P?<?0.001.??不同骨骼肌中氧化代謝關(guān)鍵酶和酵解代謝關(guān)鍵酶化公仕4)基因的??巧光定量結(jié)果顯示(圖4-3A),季L酸....



本文編號:4017064

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