目的為了分析鴨源H7N9亞型禽流感病毒感染SPF雞后宿主基因表達(dá)水平的變化。方法以鴨源H7N9亞型禽流感病毒感染SPF雞,收集肺臟進(jìn)行高通量測序。結(jié)果與對照組相比,感染組得到差異表達(dá)基因740個,其中上調(diào)基因有602個,下調(diào)基因有138個。GO條目分析發(fā)現(xiàn),差異基因主要涉及免疫應(yīng)答反應(yīng)和炎癥反應(yīng)等。經(jīng)KEGG數(shù)據(jù)庫比對注釋及富集分析顯示有7個通路富集顯著,其中Toll-like信號通路有11個基因表達(dá)上調(diào),分別為IL-6、TLR4、PIK3、IRF7、MD-2、IRF5、MYD88、CD86、STAT1、TLR2和CCL4,NOD-like受體信號通路有7個基因表達(dá)上調(diào),分別為IRF7、CTSB、P2RX7、CYBB、PSTPIP1、HSP90AA1和NAMPT。結(jié)論鴨源H7N9亞型病毒感染SPF雞后,免疫相關(guān)基因表達(dá)明顯增強。在Toll-like信號通路中, TLR4在MD-2的協(xié)助下被激活,隨后依賴MYD88途徑激活下游的IRF5,繼而引起CCL4、IL-6顯著表達(dá)。同時NLRP3炎癥體在H7N9亞型病毒感染過程中也發(fā)揮著重要作用。

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 毒株和實驗動物
    1.2 動物致病性試驗
    1.3 高通量測序用SPF雞肺臟的采集
    1.4 RNA的抽提與純化
    1.5 高通量測序
    1.6 測序結(jié)果的分析
        1.6.1 差異表達(dá)基因的篩選
        1.6.2 差異表達(dá)基因的GO和KEGG分析
    1.7 細(xì)胞因子的qPCR驗證
2 結(jié) 果
    2.1 鴨源H7N9病毒對SPF雞的致病性
    2.2 高通量測序數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測
    2.3 轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)
    2.4 轉(zhuǎn)錄組GO數(shù)據(jù)庫注釋及顯著性富集分析
    2.5 轉(zhuǎn)錄組KEGG數(shù)據(jù)庫注釋及顯著性富集分析
    2.6 差異表達(dá)基因的qRT-PCR驗證
3 討 論



本文編號：3982441