基于GC/MS技術(shù)的產(chǎn)后卵巢靜止奶牛血漿代謝譜分析
發(fā)布時間:2024-05-19 14:12
【目的】運用代謝組學(xué)中氣相色譜/質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(GC/MS)篩選卵巢靜止奶牛和正常發(fā)情奶牛的血漿差異代謝物,探究奶牛發(fā)生卵巢靜止時其體內(nèi)代謝的變化。【方法】在黑龍江省某集約化牛場選取產(chǎn)后60—90 d,年齡、胎次、體況相近的經(jīng)產(chǎn)高產(chǎn)奶牛為實驗動物。根據(jù)奶牛的發(fā)情表現(xiàn)、直腸檢查、B超檢查及激素檢測的結(jié)果,將奶牛分為發(fā)情組(A)22頭和卵巢靜止組(B)20頭。應(yīng)用GC/MS對兩組奶牛的血漿樣品進(jìn)行檢測得到其代謝組圖譜,利用Chroma TOF軟件對得到的峰圖進(jìn)行分析,得到原始數(shù)據(jù)。將標(biāo)準(zhǔn)化的GC/MS數(shù)據(jù)矩陣導(dǎo)入SIMCA-P+14.0軟件包中,進(jìn)行多元統(tǒng)計分析,先進(jìn)行無監(jiān)督的主成分分析PCA來觀察各樣本之間的總體分布和整個分析過程的穩(wěn)定性,然后用有監(jiān)督的(正交)偏最小二乘法分析(O)PLS-DA來區(qū)分各組間代謝輪廓的總體差異,找到組間的差異代謝物。為防止模型過擬合,采用七次循環(huán)交互驗證和200次響應(yīng)排序檢驗的方法來考察模型的質(zhì)量。采用多維分析(O)PLS-DA和單維分析(t-test)相結(jié)合的辦法,來篩選組間差異代謝物。在(O)PLS-DA分析中,變量權(quán)重值VIP>1的變量為差異變量...
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
本文編號:3978151
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【部分圖文】:
圖3A、B兩組奶牛血漿圖譜偏最小二乘法-判別分析
oup):box();t[1]andt[2]representfirsttwoprincipalcomponent;R2XandQ2representtheexplicablevariablesandthepredictabledegreeofModel,respectively....
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