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雞腺病毒HZBL-S1株Hexon蛋白基因序列測定與遺傳進(jìn)化分析

發(fā)布時間:2024-04-19 02:18
  為了解廣東省禽腺病毒(Fowl adenovirus,FAdV) HZBL-S1株遺傳進(jìn)化情況,試驗對HZBL-S1株六鄰體(Hexon)蛋白全基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆和序列測定,并對其進(jìn)行蛋白全基因序列及其氨基酸推導(dǎo)序列的遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明:HZBL-S1株與來自國內(nèi)外的FAdV基因C型、血清型為4型的參考株的相似性較高,核苷酸(推導(dǎo)的氨基酸)序列的相似性為98.2%~99.9%(98.5%~99.9%)。對Hexon蛋白全基因核苷酸序列及其氨基酸推導(dǎo)序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,HZBL-S1株與基因型為A、B、D、E型的參考株均處于進(jìn)化樹的不同分支,遺傳距離相對較遠(yuǎn);而與基因型為C型、血清型為4型的參考株均處于進(jìn)化樹的同一分支,遺傳距離相對較近。說明HZBL-S1株與基因型為C型的參考株來自同一祖先,推測該病原有可能由國外經(jīng)某種途徑傳入我國。

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【部分圖文】:

圖3HZBL-S1毒株Hexon蛋白全基因

圖3HZBL-S1毒株Hexon蛋白全基因

由圖3可知:HZBL-S1毒株與A、B、D、E基因型參考毒株均分布在不同分支上,遺傳距離相對較遠(yuǎn);而與C基因型的參考毒株均分布在同一分支上,遺傳距離相對較近。與HZBL-S1毒株遺傳距離最近的為China-C毒株,其次為Russia-C、Korea-C毒株。且從血清型上看,Ch....


圖4HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸推導(dǎo)序列與參考毒株相似性比較結(jié)果

圖4HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸推導(dǎo)序列與參考毒株相似性比較結(jié)果

3.4基于Hexon蛋白全基因推導(dǎo)的氨基酸序列相似性比較及進(jìn)化關(guān)系研究HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸推導(dǎo)序列與參考毒株相似性比較結(jié)果見圖4。由圖4可知:HZBL-S1毒株與A、B、D、E基因型參考毒株的同源性都比較低;而與C基因型的參考毒株的同源性很高,為98.5%~....


圖5HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸

圖5HZBL-S1毒株Hexon蛋白氨基酸

HZBL-S1毒株與參考毒株Hexon蛋白氨基酸推導(dǎo)序列的遺傳進(jìn)化分析結(jié)果見圖5。由圖5可知:HZBL-S1毒株與A、B、D、E基因型參考毒株均分布在不同分支上,遺傳距離相對較遠(yuǎn);而與基因型為C型的China-C、Russia-C和Korea-C毒株均分布在同一小分支上,遺傳距....


圖1Hexon蛋白全基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果

圖1Hexon蛋白全基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果

PCR擴(kuò)增結(jié)果表明,擴(kuò)增的Hexon蛋白基因條帶大小與預(yù)期結(jié)果一致,約為2811bp,見圖1。3.2基因克隆菌液的鑒定



本文編號:3958083

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