為進一步了解新城疫病毒(NDV)的遺傳進化規(guī)律,從疑似NDV感染的鴿群中通過雞胚接種分離出1株新城疫強毒株,將其命名為Pigeon/China/SHJD13/2017,經噬斑純化后測定其雞胚平均死亡時間(MDT)為57.2 h,1日齡雛雞腦內致病指數(ICPI)為2,毒力指標屬于強毒NDV。參考GenBank公布的NDV全基因組序列,共設計了11對引物,對其進行全基因組測序,序列測定結果顯示:分離株屬于基因Ⅶ型NDV,其基因組全長15 192 bp,登錄號為MK937786,F基因共包含553個aa,裂解位點的氨基酸殘基為¹¹²R-R-Q-K-R-F¹¹⁷,符合NDV強毒株的分子特征。通過序列同源性比對分析,該分離株與雞源強毒株Chicken/China/SDWF07/2011親緣關系較近,表明該鴿源分離毒株可能來自于感染的雞群。

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圖1NDVPigeon/China/SHJD13/2017分離株全基因RT-PCR結果

用瓊脂糖凝膠電泳驗證PCR產物,如圖1所示,結果所設計的11對引物均能擴增出清晰的目的條帶,且條帶大小與預期結果相符。2.4NDVPigeon/China/SHJD13/2017分離株全基因組結果分析

圖240株NDV毒株全基因編碼核苷酸序列的遺傳進化樹

HN基因遺傳進化分析結果顯示,分離株HN共編碼571aa,符合NDV強毒的特征,該分離株含有13個半胱氨酸殘基,6個潛在的糖基化位點,且高度保守。與當前分離出的鴿源Ⅶ毒株相比,其HN基因僅在36、49、102、120等位點上表現出一定的特異性。3討論

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