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黑須污蠅蛹形態(tài)學研究與其各發(fā)育階段轉錄組研究

發(fā)布時間:2024-04-08 19:07
  黑須污蠅是引起阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病的病原,侵害阿拉善雙峰駝母駝陰道,已成為阻礙雙峰駝健康發(fā)展的主要疾病之一。本實驗利用電鏡及光鏡觀察研究了黑須污蠅蛹形態(tài)結構特征,在此基礎上對黑須污蠅生活史進行了探究,以不同發(fā)育階段的黑須污蠅為研究對象,采用高通量測序(Illumina Hiseq4000)進行轉錄組測序和生物信息學分析,并且通過熒光定量技術對目的基因進行驗證。結果顯示:黑須污蠅幼蟲、蛹、成蟲發(fā)育時間為1-12或18天,其蛹生長發(fā)育分為三個階段。測序結果25個樣本的有效數(shù)據(jù)量在4.90 G以上,G+C含量在35.35%以上,Q20 含量在 97%以上,共獲得 73303 條 unigenes。與 NCBInr、GO、KEGG、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG數(shù)據(jù)庫進行對比,其中eggNOG數(shù)據(jù)庫注釋的unigenes最多,為35066條,分布在23個蛋白功能中,其中的翻譯修飾、蛋白質周轉的unigenes所占比例較大;GO功能富集分析中(包括分子功能、細胞組分、生物學過程三大類50個分支)參與生物過程和氧化還原過程的unigenes比例較大;KEGG富...

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1阿拉善雙峰駝陰道患病處

圖1阿拉善雙峰駝陰道患病處

2?黑須污蠅蛹形態(tài)學觀察與其幼蟲、蛹、成蠅的轉錄組研究???感染的發(fā)病率在20%?30%,死亡率在2%左右[8?9](圖1)。該病是由黑須污蠅在??胳駝陰道附近排卵,在陰道內寄生并逐漸發(fā)育成1齡幼蟲、2齡幼蟲、3齡幼蟲??(從1齡幼蟲到3齡幼蟲需7?9?d),在幼蟲時期以母駝陰道....


圖14黑須污蠅幼蟲、蛹、成蟲Uni朗nes的功能注釋

圖14黑須污蠅幼蟲、蛹、成蟲Uni朗nes的功能注釋

?內蒙古農業(yè)大學碩士學位論文?23^??GO富集分析??通過GO功能富集分析有3個本體(ontology),分別描述基因的分子功能(molecular??function)、細胞組分(cellular?component)和生物學過程(biological?process),以這....


圖15黑須污蝶幼蟲、蛹、成蟲Unigenes?KEGG信號通路分類???

圖15黑須污蝶幼蟲、蛹、成蟲Unigenes?KEGG信號通路分類???

24?黑須污蠅蛹形態(tài)學觀察與其幼蟲、蛹、成蠅的轉錄組研究???相比,在顯著性差異表達基因中顯f性富集的Pathway。KEGG富集分析表明,黑須??污蠅幼蟲、蛹和成蟲的unigenes富集在了?6個大類和40個亞類中(亞類是指可以在??KEGG數(shù)據(jù)庫中注釋到的具體的信號通路)(圖....


圖20引物GAPDH梯度PCR產(chǎn)物2%瓊脂糖檢測結果??Fi.20?Detection?results?of?2%?aarose?ofrimer?GAPDHradient?PCRroducts??

圖20引物GAPDH梯度PCR產(chǎn)物2%瓊脂糖檢測結果??Fi.20?Detection?results?of?2%?aarose?ofrimer?GAPDHradient?PCRroducts??

為了確定設計合成的引物具有特異性,使用ABI梯度PCR進行反應體系及條件的??優(yōu)化。溫度梯度PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖電泳檢測目的條帶大小以及是否存在非特異性擴??增,結果如圖20、21、22、23所示。結果表明三個內參基因GADPH的最適退火溫度??為53°C、54°C、55°C,....



本文編號:3948671

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