發(fā)布時(shí)間：2024-04-08 04:30

　　旨在探討肝調(diào)節(jié)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)吸收轉(zhuǎn)化影響鵝平均日增重的分子機(jī)制。本研究依據(jù)平均日增重將70日齡的四川白鵝進(jìn)行分組(高:H;中:M;低:L),然后采用RNA-Seq技術(shù)分析各組肝RNA表達(dá),篩選出差異表達(dá)基因,并對(duì)其進(jìn)行功能富集及聚類關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示,H、M和L組的平均日增重差異顯著(P<0.05),分別為(52.24±0.41)、(44.44±0.42)和(37.80±0.47) g·d^-1。從測(cè)序數(shù)據(jù)分別鑒定出14 632、14 651和14 819個(gè)表達(dá)基因,其中有13 776個(gè)基因共表達(dá)。Top 100的基因表達(dá)量占所有基因表達(dá)量的65.38%～70.37%,其中,有85個(gè)共表達(dá)基因,17個(gè)特異性表達(dá)基因。鑒定出435個(gè)差異表達(dá)基因,主要富集于細(xì)胞凋亡、蛋白重折疊、胰島素分泌、營(yíng)養(yǎng)反應(yīng)、細(xì)胞增長(zhǎng)、氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)、cAMP信號(hào)通路等生物學(xué)過程。聚類構(gòu)建的5個(gè)差異表達(dá)基因模塊與平均日增重和脂質(zhì)代謝指標(biāo)顯著相關(guān)(|r|≥0.75,P<0.05)。總體而言,本研究鑒定了體重相關(guān)的潛在候選基因和代謝通路,初步探討了肝調(diào)節(jié)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)吸收轉(zhuǎn)化影響鵝體重的分子機(jī)制,以使人...

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

圖1基因表達(dá)分析

不同組之間表達(dá)的基因數(shù)量基本一致(H組為13390～13690個(gè);M組為13445～13776個(gè);L組為13321～14184個(gè))。剔除平均FPKM值為零的基因后,H、M和L組分別有14632、14651和14819個(gè)表達(dá)基因,其中有13776個(gè)共表達(dá)基因。關(guān)....

圖2差異表達(dá)基因分析

為了準(zhǔn)確反映組間基因表達(dá)的差異,需剔除掉13776個(gè)共表達(dá)基因中FPKM值為零的基因,得到11920個(gè)基因用于差異分析,分別鑒定出了199(HvsM)、175(HvsL)和187(MvsL)個(gè)差異表達(dá)基因(圖2A)。層級(jí)聚類分析顯示,差異基因可以根據(jù)不同體重組分為....

圖3差異表達(dá)基因模塊分析

由于分析單個(gè)基因表達(dá)量提取的生物學(xué)信息有限,故為了從全基因組表達(dá)數(shù)據(jù)中提取出更多的生物學(xué)信息,在此構(gòu)建了差異表達(dá)基因模塊,并與表型性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。如圖3A所示,由435個(gè)差異表達(dá)基因構(gòu)建出5個(gè)基因模塊,并且單個(gè)基因模塊內(nèi)部的基因之間具有較強(qiáng)相關(guān)性,而不同模塊之間顯示較低的相關(guān)....

本文編號(hào)：3948492