神經(jīng)系統(tǒng)特異性轉(zhuǎn)錄因子NHLH2 (nescient helix-loop-helix 2)不僅調(diào)控脂肪組織中神經(jīng)纖維的數(shù)量,而且對(duì)維持動(dòng)物能量平衡具有重要作用。尋找與生長(zhǎng)性狀相關(guān)的DNA標(biāo)記,可為肉牛(Bos taurus)遺傳資源的保護(hù)、開(kāi)發(fā)與利用提供科學(xué)依據(jù)。本研究利用PCR-單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(PCR-single strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)、DNA序列分析和生物信息學(xué)技術(shù),探究郟縣紅牛(B. taurus)NHLH2基因5’UTR的遺傳變異與其生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性。結(jié)果顯示,郟縣紅牛NHLH2基因5’UTR存在2個(gè)SNPs,即25G>C和179G>A,形成A和B 2個(gè)等位基因,等位基因頻率分別為0.239和0.761;檢測(cè)出AA、BB和AB 3種基因型,BB基因型為優(yōu)勢(shì)基因型。相關(guān)性分析表明,該基因3種不同基因型對(duì)郟縣紅牛的體重、體長(zhǎng)和胸圍有顯著影響(P<0.05),且BB型個(gè)體的體重、體長(zhǎng)和胸圍均顯著大于AA型(P<0.05)。上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí),NHLH2基因5’UTR遺傳突變與郟縣紅牛的生長(zhǎng)性...

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圖1NHLH2基因5"UTR的PCR擴(kuò)增

對(duì)2個(gè)SNPs進(jìn)行連鎖不平衡分析，結(jié)果顯示，連鎖不平衡參數(shù)r2=1，說(shuō)明2個(gè)SNPs呈現(xiàn)完全連鎖狀態(tài)。對(duì)郟縣紅牛NHLH2基因5"UTR的SNP位點(diǎn)進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)分析，結(jié)果如表1所示，B等位基因頻率大于A,B為優(yōu)勢(shì)等位基因，BB基因型為優(yōu)勢(shì)基因型；χ2檢驗(yàn)值為0.904，表明N....

圖2NHLH2基因5"UTR的PCR-SSCP檢測(cè)

利用SPSS19.0軟件，運(yùn)用最小二乘法，對(duì)多態(tài)位點(diǎn)的不同基因型與郟縣紅牛生長(zhǎng)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果顯示，郟縣紅牛胸圍、體長(zhǎng)和體重的生長(zhǎng)性狀指標(biāo)在3種基因型AA、AB、BB間有顯著差異性(P<0.05)，由此推測(cè)基因型與生長(zhǎng)性狀之間具有相關(guān)性；上述3項(xiàng)指標(biāo)在BB型個(gè)體中的數(shù)值....

圖3NHLH2基因5"UTR不同基因型的測(cè)序峰圖

圖2NHLH2基因5"UTR的PCR-SSCP檢測(cè)3討論

圖4不同物種NHLH2氨基酸序列比對(duì)

Good等(2008)對(duì)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)提供的800多人的NHLH2基因序列進(jìn)行分析，在編碼區(qū)均未發(fā)現(xiàn)多態(tài)性。李楓梅(2017)對(duì)肉牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行鑒定、分類與進(jìn)化功能分析的結(jié)果表明，該家族氨基酸序列呈高度保守狀態(tài)。本研究對(duì)NHLH2進(jìn)行同源進(jìn)化分析的結(jié)果顯示，....

本文編號(hào)：3916478