為了解牛冠狀病毒(Bovine coronavirus,BCoV)陜西流行株的N和HE基因的遺傳變異情況及分子結(jié)構(gòu)特征,便于以后制備檢測(cè)抗原。利用GenBank收錄的BCoV參考株的N和HE基因序列,設(shè)計(jì)合成特異性PCR引物,以陜西省某牛場(chǎng)BCoV陽性樣本基因組為模板,分別對(duì)N和HE基因進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序、序列分析及預(yù)測(cè)編碼蛋白分子特征。結(jié)果表明,成功克隆了BCoV陜西流行株的N和HE全基因序列;核苷酸序列分析表明,陜西流行株N基因與國(guó)內(nèi)外已報(bào)道的BCoV核苷酸同源性在98.38%～99.54%之間,HE基因核苷酸同源性在97.01%～98.09%之間。研究結(jié)果為BCoV陜西流行株分子生物學(xué)特性研究提供基礎(chǔ)資料,為進(jìn)一步研制BCoV抗體ELISA檢測(cè)方法奠定基礎(chǔ)。

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圖1N和HE基因的PCR擴(kuò)增

使用NCBIBLAST后發(fā)現(xiàn),N基因測(cè)序結(jié)果與GenBank已收錄的BCoV毒株(MK095166.1、MK095170.1、MK095173.1、MK095165.1、MK095162.1等)N基因相似性在98.38%～99.54%之間,證明BCoVN基因保守程度非常高。使....

圖2N基因核苷酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹

HE基因測(cè)序結(jié)果與GenBank已收錄的BCoV毒株(MK688459.1、MK903507.1、MH043953.1、AF230524.1、MK095147.1等)HE基因相似性在97.01%～98.09%之間,證明BCoVHE基因較保守。用DNAStar-MegAlign軟....

圖3HE基因核苷酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹

圖2N基因核苷酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹2.3N、HE蛋白分子特征預(yù)測(cè)

本文編號(hào)：3907255