在NCBI GenBank數(shù)據(jù)庫中獲取鴨ORAI1基因組序列,采用Primer 3.0程序設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增該基因全部編碼區(qū),PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純化后直接測序,采用DNAStar軟件中的MegaAlign程序結(jié)合測序結(jié)果篩查鑒定單核苷酸突變(SNP)位點(diǎn),并運(yùn)用SPSS 18.0軟件分析SNP位點(diǎn)與蛋殼品質(zhì)的相關(guān)性,旨在探究三穗鴨鈣釋放激活鈣調(diào)節(jié)蛋白1基因的遺傳變異及其與蛋殼品質(zhì)的相關(guān)性,為改善蛋殼品質(zhì)提供新的科學(xué)資料.結(jié)果表明,只在三穗鴨ORAI1基因第3外顯子發(fā)現(xiàn)3個同義突變位點(diǎn),分別是g.16789 C>T、g.16984 C>T和g.17074 A>G.相關(guān)性分析顯示:g.16789 C>T、g.16984 C>T和g.17074 A>G位點(diǎn)對蛋殼強(qiáng)度的影響達(dá)到顯著水平(P<0.05),其中,g.16789 C>T和g.16984 C>T兩個位點(diǎn)CT雜合基因型個體的蛋殼強(qiáng)度顯著高于TT純合基因型,g.17074 A>G位點(diǎn)GG基因型個體的蛋殼強(qiáng)度顯著高于AG基因型(P<0.05),揭示CT和GG是有利基因型;3個SNP位點(diǎn)...

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圖1三穗鴨ORAI1基因序列比對峰圖

將ORAI1基因在NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫中公布的序列與PCR擴(kuò)增后測序得到的序列運(yùn)用MegaAlign程序進(jìn)行比對,查找SNP,結(jié)果如圖1所示.在三穗鴨ORAI1基因第3外顯子發(fā)現(xiàn)3個SNP位點(diǎn),分別是g.16789C>T、g.16984C>T和g.17074A>G....

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