雞IFIT5基因的克
發(fā)布時間:2024-02-02 14:40
IFIT家族是一類主要受干擾素、病毒和脂多糖誘導(dǎo)表達的干擾素誘導(dǎo)基因。其編碼的蛋白可通過抑制翻譯起始,識別、結(jié)合并隱退特定類型的病毒核酸或蛋白以及參與調(diào)節(jié)細胞固有的和非固有的免疫反應(yīng)等方式來抵抗病毒的入侵。然而,目前該家族基因在禽類上的研究甚少。本研究首先通過分子克隆的方法獲取了雞IFIT5基因CDS區(qū)全長序列,并對其相關(guān)分子生物信息進行了分析與預(yù)測。其次,采用qRT-PCR技術(shù)構(gòu)建了雞IFIT5基因的組織表達譜,并在機體和細胞水平上檢測了雞IFIT5基因?qū)Σ煌玖π鲁且卟《径局旰筒煌T導(dǎo)刺激物的免疫應(yīng)答差異。最后,在細胞水平上采用siRNA干擾和外源過表達技術(shù)初步探究了雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3對IFIT5基因的表達調(diào)控作用以及雞IFIT5基因?qū)RF-3和NF-κB信號通路的影響。取得的主要結(jié)果如下:(1)雞IFIT5基因CDS區(qū)全序列長1440bp,由兩個外顯子組成,共可編碼479個氨基酸。其推導(dǎo)氨基酸序列與鳥類對應(yīng)序列的相似度均不超過70%,與哺乳動物對應(yīng)序列的相似度均不超過50%。(2)雞IFIT5基因在脾、心、肺、胸腺、腎和小腸組織中具有相對較高的mRN...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號說明
1 文獻綜述
1.1 IFIT家族簡介
1.2 IFIT家族基因結(jié)構(gòu)與表達研究進展
1.2.1 IFIT家族基因結(jié)構(gòu)特征
1.2.2 IFIT家族基因表達特性
1.2.3 IFIT家族基因表達調(diào)控通路
1.3 IFIT家族蛋白結(jié)構(gòu)與功能研究進展
1.3.1 IFIT家族蛋白結(jié)構(gòu)特征
1.3.2 IFIT家族蛋白功能研究
1.4 IFIT5的研究進展
1.5 研究目的及意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物與病毒來源
2.1.2 主要儀器設(shè)備
2.1.3 主要試劑及耗材
2.1.4 主要分析軟件及網(wǎng)站
2.2 試驗方法
2.2.1 試驗技術(shù)路線
2.2.2 SPF雞的孵化、飼喂、攻毒和采樣
2.2.3 cDNA模板的制備
2.2.4 雞IFIT5基因CDS區(qū)的克隆與測序
2.2.5 真核表達載體的構(gòu)建
2.2.6 細胞試驗
2.2.7 實時熒光定量PCR
2.2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
3 結(jié)果與分析
3.1 雞IFIT5基因CDS區(qū)的克隆與測序
3.2 雞IFIT5基因CDS區(qū)序列分析
3.2.1 雞IFIT5基因CDS區(qū)核苷酸序列分析
3.2.2 雞IFIT5基因推導(dǎo)氨基酸序列分析
3.3 雞IFIT5基因mRNA水平的組織表達譜構(gòu)建
3.4 雞IFIT5基因在機體中對不同毒力新城疫病毒的免疫應(yīng)答差異
3.4.1 兩攻毒組胸腺組織中IFIT5基因的表達差異
3.4.2 兩攻毒組脾臟組織中IFIT5基因的表達差異
3.4.3 兩攻毒組法氏囊組織中IFIT5基因的表達差異
3.5 雞IFIT5基因在雞胚成纖維細胞中對不同刺激物的免疫應(yīng)答差異
3.5.1 Poly I:C對雞IFIT5基因的免疫誘導(dǎo)作用
3.5.2 Poly dA:dT對雞IFIT5基因的免疫誘導(dǎo)作用
3.5.3 新城疫病毒Mukteswar毒株對雞IFIT5基因的免疫誘導(dǎo)作用
3.6 雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3基因?qū)FIT5表達水平的調(diào)控作用
3.6.1 過表達雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3基因?qū)FIT5免疫應(yīng)答水平的影響
3.6.2 干擾雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3基因表達對IFIT5免疫應(yīng)答水平的影響
3.7 雞IFIT5蛋白的亞細胞定位
3.8 過表達雞IFIT5基因?qū)RF-3和NF-κB應(yīng)答基因表達水平的影響
4 討論
4.1 雞IFIT5基因CDS區(qū)序列分析
4.2 雞IFIT5基因的組織表達分布特點
4.3 兩攻毒組中IFIT5基因的免疫應(yīng)答差異
4.4 雞胚成纖維細胞對不同刺激物的免疫應(yīng)答差異
4.5 雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3對IFIT5基因的表達調(diào)控
4.6 雞IFIT5對IRF-3和NF-κB信號通路的影響
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號:3892829
【文章頁數(shù)】:72 頁
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主要符號說明
1 文獻綜述
1.1 IFIT家族簡介
1.2 IFIT家族基因結(jié)構(gòu)與表達研究進展
1.2.1 IFIT家族基因結(jié)構(gòu)特征
1.2.2 IFIT家族基因表達特性
1.2.3 IFIT家族基因表達調(diào)控通路
1.3 IFIT家族蛋白結(jié)構(gòu)與功能研究進展
1.3.1 IFIT家族蛋白結(jié)構(gòu)特征
1.3.2 IFIT家族蛋白功能研究
1.4 IFIT5的研究進展
1.5 研究目的及意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物與病毒來源
2.1.2 主要儀器設(shè)備
2.1.3 主要試劑及耗材
2.1.4 主要分析軟件及網(wǎng)站
2.2 試驗方法
2.2.1 試驗技術(shù)路線
2.2.2 SPF雞的孵化、飼喂、攻毒和采樣
2.2.3 cDNA模板的制備
2.2.4 雞IFIT5基因CDS區(qū)的克隆與測序
2.2.5 真核表達載體的構(gòu)建
2.2.6 細胞試驗
2.2.7 實時熒光定量PCR
2.2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
3 結(jié)果與分析
3.1 雞IFIT5基因CDS區(qū)的克隆與測序
3.2 雞IFIT5基因CDS區(qū)序列分析
3.2.1 雞IFIT5基因CDS區(qū)核苷酸序列分析
3.2.2 雞IFIT5基因推導(dǎo)氨基酸序列分析
3.3 雞IFIT5基因mRNA水平的組織表達譜構(gòu)建
3.4 雞IFIT5基因在機體中對不同毒力新城疫病毒的免疫應(yīng)答差異
3.4.1 兩攻毒組胸腺組織中IFIT5基因的表達差異
3.4.2 兩攻毒組脾臟組織中IFIT5基因的表達差異
3.4.3 兩攻毒組法氏囊組織中IFIT5基因的表達差異
3.5 雞IFIT5基因在雞胚成纖維細胞中對不同刺激物的免疫應(yīng)答差異
3.5.1 Poly I:C對雞IFIT5基因的免疫誘導(dǎo)作用
3.5.2 Poly dA:dT對雞IFIT5基因的免疫誘導(dǎo)作用
3.5.3 新城疫病毒Mukteswar毒株對雞IFIT5基因的免疫誘導(dǎo)作用
3.6 雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3基因?qū)FIT5表達水平的調(diào)控作用
3.6.1 過表達雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3基因?qū)FIT5免疫應(yīng)答水平的影響
3.6.2 干擾雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3基因表達對IFIT5免疫應(yīng)答水平的影響
3.7 雞IFIT5蛋白的亞細胞定位
3.8 過表達雞IFIT5基因?qū)RF-3和NF-κB應(yīng)答基因表達水平的影響
4 討論
4.1 雞IFIT5基因CDS區(qū)序列分析
4.2 雞IFIT5基因的組織表達分布特點
4.3 兩攻毒組中IFIT5基因的免疫應(yīng)答差異
4.4 雞胚成纖維細胞對不同刺激物的免疫應(yīng)答差異
4.5 雞MDA-5、LGP-2、MAVS和IRF-3對IFIT5基因的表達調(diào)控
4.6 雞IFIT5對IRF-3和NF-κB信號通路的影響
5 結(jié)論
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