為分析廣西豬瘟病毒(CSFV)遺傳變異情況及其與疫苗株的差異,通過RT-PCR方法在豬瘟常規(guī)免疫豬場發(fā)病材料中檢測到1份豬瘟病毒陽性的病料。將病料研磨、過濾后接種PK-15細(xì)胞,并在細(xì)胞上連續(xù)傳代進(jìn)行病毒的分離,通過RT-PCR和間接免疫熒光(IFA)方法鑒定,成功分離到了1株豬瘟病毒,命名為CSFV GXNN1896株。對GXNN1896株E2基因進(jìn)行擴(kuò)增、克隆測序和序列比對,結(jié)果表明該毒株E2基因與HCLV株、Shimen株等參考毒株E2基因的核苷酸序列同源性為81.9%～97.5%,氨基酸相似度為87.7%～96.8%,E2基因結(jié)構(gòu)域的B、C亞區(qū)分別在12個和19個氨基酸的變異,與我國2.1 d亞型哈爾濱分離株NK150425株(GenBank;MF150643.1)同源性最高(96.8%),與德國疫苗毒株Reims(GenBank;AY259122.1)同源性最低(87.7%),與中國豬瘟兔化弱毒疫苗株C株(GenBank;Z46258.1)相比有46個氨基酸的突變。遺傳進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)GXNN1896株的E2基因與參考疫苗毒株遺傳距離較遠(yuǎn),且位于2.1 d亞群,屬于野毒株。說明...

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 細(xì)胞
        1.1.2 主要試劑
        1.1.3 主要儀器設(shè)備
    1.2 方法
        1.2.1 豬場送檢樣品檢測和CSFV E2基因的擴(kuò)增
        1.2.2 病毒分離
        1.2.3 間接免疫熒光試驗
        1.2.4 豬瘟病毒RNA的提取及RT-PCR鑒定
        1.2.5 豬瘟病毒E2基因比較和遺傳進(jìn)化分析
2 結(jié)果
    2.1 豬瘟病料的檢測
    2.2 CSFV陽性樣品的檢測
    2.3 豬瘟病毒的分離和鑒定
    2.4 序列比對結(jié)果及結(jié)構(gòu)域分析
    2.5 遺傳進(jìn)化樹分析
3 討論



本文編號：3874652