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基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的意大利蝗微衛(wèi)星位點(diǎn)分析與分子標(biāo)記開發(fā)

發(fā)布時(shí)間:2023-11-27 20:06
  【目的】意大利蝗Calliptamus italicus (L.)是新疆荒漠半荒漠草原重要害蟲。本研究利用已獲得的意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),鑒定其微衛(wèi)星位點(diǎn)!痉椒ā渴褂肕ISA篩選SSR位點(diǎn),利用Primer Premier 5設(shè)計(jì)引物,通過PCR擴(kuò)增對(duì)引物進(jìn)行驗(yàn)證!窘Y(jié)果】在意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中,共檢測(cè)出156500個(gè)SSR位點(diǎn),分布在126369條unigene中。其中,單核苷酸重復(fù)為60.88%,二核苷酸重復(fù)為23.58%,三核苷酸重復(fù)和四核苷酸重復(fù)分別為12.99%和2.04%。單核苷酸重復(fù)主要為A/T(44.38%),二核苷酸重復(fù)主要為AC/GT(12.99%)和AG/CT(8.05%)。基于篩選的SSR位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物,隨機(jī)挑選24對(duì)引物,對(duì)10個(gè)不同地理種群意大利蝗成蟲DNA樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增,共有6對(duì)引物擴(kuò)增成功!窘Y(jié)論】本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)掘意大利蝗SSR位點(diǎn),為意大利蝗分子標(biāo)記、種群遺傳及功能基因等研究奠定基礎(chǔ)。

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 意大利蝗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來源
    1.2 供試蟲源及DNA提取
    1.3 SSR鑒定
    1.4 SSR引物設(shè)計(jì)及驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
    2.1 意大利蝗轉(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)的分布特征
    2.2 意大利蝗成蟲SSR引物設(shè)計(jì)與PCR擴(kuò)增
3 討論與結(jié)論



本文編號(hào):3868488

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