藏雞是生活在青藏高原的古老雞種,其對高原的低壓低氧環(huán)境有良好的適應(yīng)性。藏雞低氧孵化率高于低地雞。藏雞低氧適應(yīng)是由多個基因控制的復(fù)雜性狀。雖然候選基因法增加了我們對藏雞低氧適應(yīng)的了解,但對藏雞在低氧適應(yīng)過程中,多個基因如何協(xié)同發(fā)揮作用不甚了解。為此,我們利用RNA-Seq技術(shù)篩選13%氧濃度下藏雞和低地雞胚胎心臟、肝臟的差異表達(dá)基因及其所在的相關(guān)信號通路,以期獲得與藏雞低氧適應(yīng)相關(guān)聯(lián)的候選基因。 利用RNA-Seq技術(shù)對13%氧濃度下,藏雞和低地雞胚胎心臟、肝臟進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序分析。雞胚心臟組織送測所有樣品表達(dá)轉(zhuǎn)錄本注釋得到的已知基因有26171個。心臟差異基因篩選的標(biāo)準(zhǔn)為Pvalue<0.05,藏雞和白來航中差異基因652個,藏雞和絲羽烏骨雞的差異基因167個。經(jīng)Real-time qPCR驗(yàn)證,藏雞和低地雞心臟差異基因表達(dá)模式定量結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致。部分差異基因KEGG分析富集到了HIF信號通路、ECM-receptor interaction、脂肪酸代謝、亞油酸代謝等通路上。差異基因GO本體論注釋結(jié)果表明差異基因在藏雞胚胎的低氧信號感受、傳導(dǎo)以及能量代謝過程發(fā)揮重要作用...

【文章頁數(shù)】：142 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 高原環(huán)境適應(yīng)性的基因組水平分析
    1.2 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
    1.3 HIF通路相關(guān)研究
    1.4 藏雞低氧適應(yīng)生理及遺傳基礎(chǔ)研究進(jìn)展
    1.5 研究目的和意義
    1.6 技術(shù)路線
第二章 低氧孵化雞胚心臟RNA-seq分析
    2.1 前言
    2.2 材料與方法
    2.3 試驗(yàn)結(jié)果
    2.4 討論
    2.5 小結(jié)
第三章 低氧孵化雞胚肝臟RNA-seq分析
    3.1 前言
    3.2 材料與方法
    3.3 試驗(yàn)結(jié)果
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
第四章 藏雞和低地雞胚胎谷胱甘肽系統(tǒng)相關(guān)酶的功能差異
    4.1 前言
    4.2 材料與方法
    4.3 試驗(yàn)結(jié)果
    4.4 討論
    4.5 小結(jié)
第五章 EGLN1基因的鑒定及差異表達(dá)分析
    5.1 前言
    5.2 材料與方法
    5.3 試驗(yàn)結(jié)果
    5.4 討論
    5.5 小結(jié)
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
作者簡介



本文編號：3867897