基于高通量測(cè)序技術(shù)分析籠養(yǎng)熊猴腸道細(xì)菌菌群多樣性
發(fā)布時(shí)間:2023-08-06 20:15
為了明確熊猴(Macaca assamensis)腸道菌群的組成,試驗(yàn)采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)2只成年(雌雄各1只)和2只少年(雄性)籠養(yǎng)熊猴糞便中的細(xì)菌16S rRNA基因V3和V4區(qū)域擴(kuò)增子進(jìn)行分析。結(jié)果表明:本試驗(yàn)共獲得460種OTUs聚類(lèi)信息,每個(gè)樣品平均(395.00±8.54)個(gè)。共注釋到15個(gè)門(mén),平均相對(duì)豐度高于1%的有4個(gè),分別為厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、變形菌門(mén)和螺旋體門(mén),豐度分別為(61.66±8.47)%、(31.84±7.23)%、(3.16±1.09)%和(1.73±0.50)%。共注釋到115個(gè)屬,平均相對(duì)豐度高于1%的屬有19個(gè),其中占比最高的是乳酸桿菌屬,其次為理研菌科RC9菌屬和普雷沃菌屬9,豐度分別為(14.61±3.17)%、(11.68±3.49)%和(8.69±1.03)%;\養(yǎng)熊猴腸道菌群在少年雄性與成年雄性個(gè)體間差異較小,性別間差異相對(duì)較大。腸道微生物組成在門(mén)水平上與其他獼猴屬基本一致,但在屬水平上有較大差異。
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 糞便樣品的采集
1.2 DNA的提取和PCR擴(kuò)增
1.3 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 OTUs分析
2.2 α多樣性和β多樣性分析
2.3 門(mén)和屬水平上的菌群結(jié)構(gòu)
3 討論與結(jié)論
本文編號(hào):3839982
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1 材料與方法
1.1 糞便樣品的采集
1.2 DNA的提取和PCR擴(kuò)增
1.3 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 OTUs分析
2.2 α多樣性和β多樣性分析
2.3 門(mén)和屬水平上的菌群結(jié)構(gòu)
3 討論與結(jié)論
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