本研究以細(xì)毛羊754個(gè)個(gè)體為材料,采用DNA池和第二代重測序技術(shù)相結(jié)合,測序篩選候選基因FZD3、SFRP4、Notch1和PTPN13的SNPs,同時(shí)篩選出可能與毛性狀顯著相關(guān)的SNPs,運(yùn)用MassArray技術(shù)對顯著的2個(gè)SNPs以及候選基因的9個(gè)SNPs進(jìn)行基因型分型,采用SAS 9.1最小二乘方法分析11個(gè)SNPs與毛性狀關(guān)聯(lián)性,以期篩選與細(xì)毛羊經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,為今后培育細(xì)毛羊新品種提供試驗(yàn)依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.利用DNA池檢測與細(xì)毛羊毛性狀相關(guān)SNPs利用重測序技術(shù)對兩個(gè)極細(xì)和極粗的DNA池中篩選出與毛性狀相關(guān)的SNPs:T19381438G和G19381838T,這兩個(gè)位點(diǎn)距離ACAN基因120kb處;FZD3基因篩選出32個(gè)非同義突變位點(diǎn),4個(gè)同義突變位點(diǎn),1個(gè)密碼終止子;Notch1基因篩選出3個(gè)非同義突變位點(diǎn),9個(gè)同義突變位點(diǎn);PTPN13基因篩選出9個(gè)非同義突變位點(diǎn),19個(gè)同義突變位點(diǎn);而SFRP4在編碼區(qū)只發(fā)現(xiàn)1個(gè)同義突變位點(diǎn)。2.連鎖不平衡分析以及單倍型分析ACAN基因的兩個(gè)突變位點(diǎn):T19381438G和G19381838T處于強(qiáng)連鎖不平衡狀態(tài)...

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 綿羊羊毛資源概況
        1.1.1 世界羊毛現(xiàn)狀
        1.1.2 國內(nèi)羊毛供求現(xiàn)狀分析
        1.1.3 羊毛生產(chǎn)趨勢
    1.2 細(xì)羊毛主要經(jīng)濟(jì)性狀
        1.2.1 羊毛纖維直徑
        1.2.2 羊毛纖維直徑變異
        1.2.3 羊毛纖維直徑離散
        1.2.4 羊毛纖維彎曲數(shù)
        1.2.5 羊毛纖維自然長度
        1.2.6 剪毛量
    1.3 細(xì)毛羊育種歷程
    1.4 綿羊毛性狀研究進(jìn)展
        1.4.1 羊遺傳連鎖圖譜進(jìn)展
        1.4.2 綿羊毛性狀QTL定位研究進(jìn)展
        1.4.3 綿羊候選基因法的研究進(jìn)展
        1.4.4 調(diào)控毛囊發(fā)育相關(guān)通路研究進(jìn)展
    1.5 SNPs研究進(jìn)展
        1.5.1 單核苷酸多態(tài)性概念及特點(diǎn)
        1.5.2 SNPs檢測技術(shù)
    1.6 本研究的目的和意義
        1.6.1 本研究的目的
        1.6.2 本研究的意義
    1.7 技術(shù)路線
第2章 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
        2.1.2 表型數(shù)據(jù)的整理
        2.1.3 主要儀器設(shè)備
        2.1.4 試劑盒及普通試劑
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 毛性狀的測定
        2.2.2 基因組DNA的分離與質(zhì)量檢測
        2.2.3 樣品DNA池的構(gòu)建
        2.2.4 重測序篩選SNPs
        2.2.5 Sequenom MassARRAY^@SNP檢測
    2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
        2.3.1 遺傳多態(tài)性分析
        2.3.2 基因頻率和基因型頻率分布的卡方獨(dú)立性檢驗(yàn)
        2.3.3 連鎖不平衡與單倍型分析
        2.3.4 不同基因型對羊毛性狀影響的效應(yīng)分析
第3章 結(jié)果與分析
    3.1 基因組DNA的提取
    3.2 細(xì)毛羊毛性狀SNP檢測
        3.2.1 DNA池的重測序數(shù)據(jù)篩選
        3.2.2 毛性狀相關(guān)基因SNP篩選結(jié)果
    3.3 細(xì)毛羊群體飛行時(shí)間質(zhì)譜分型分析
        3.3.1 飛行時(shí)間質(zhì)譜的SNP分型
        3.3.2 基因多態(tài)性分析
        3.3.3 基因和基因型頻率以及Hard-Weinberg平衡檢驗(yàn)
        3.3.4 SNP的連鎖不平衡分析
        3.3.5 SNP與毛性狀的關(guān)聯(lián)分析
第4章 討論與結(jié)論
    4.1 討論
        4.1.1 編碼區(qū)突變的生物學(xué)意義
        4.1.2 細(xì)毛羊候選基因遺傳效應(yīng)分析
        4.1.3 連鎖不平衡和單倍型效應(yīng)分析
        4.1.4 SNP基因型的分子檢測平臺(tái)
    4.2 結(jié)論
    4.3 論文創(chuàng)新點(diǎn)
    4.4 下一步工作設(shè)想
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介



本文編號：3839202