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廣西外觀正常豬群中博卡病毒檢測(cè)及全基因遺傳演化分析

發(fā)布時(shí)間:2023-06-04 01:23
  為掌握廣西外觀正常豬群中博卡病毒(PBoV)的感染情況,本研究采用PCR方法對(duì)采自廣西境內(nèi)的274份1~2月齡保育豬血清、咽拭子和肛拭子樣品進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示:3種樣品的陽(yáng)性率分別為1.9%(2/106)、83.3%(75/90)和82.1%(64/78),不同PBoV基因群的檢出率分別為G3(47.4%,130/274)>G2(32.8%,90/274)>G1(20.1%,55/274),說(shuō)明PBoVG3是廣西PBoV流行的主要基因群;不同基因群的混合感染情況普遍存在,G2+G3二重感染率最高,為17.9%(49/274);從PBoV陽(yáng)性樣品中擴(kuò)增獲得8條PBoV全基因序列;8個(gè)毒株分別處于PBoVG1、PBoVG2和PBoVG3三個(gè)進(jìn)化分支,PBoVG2和PBoVG3的6個(gè)毒株均包括與磷酸酯酶A2(PLA2)活性相關(guān)的保守氨基酸序列HDXXY和YXGXF。本研究結(jié)果為PBoV的進(jìn)一步防控提供了數(shù)據(jù)信息和科學(xué)依據(jù)。

【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 主要試劑
    1.3 引物設(shè)計(jì)和合成
    1.4 病毒DNA提取
    1.5 PCR擴(kuò)增
    1.6 測(cè)序和序列分析
    1.7 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
    2.1 不同規(guī)模豬場(chǎng)PBoV檢測(cè)
    2.2 PBoV全基因組擴(kuò)增與分析
    2.3 遺傳進(jìn)化分析
    2.4 同源性分析
    2.5 PLA2關(guān)鍵氨基酸序列分析
3 討論



本文編號(hào):3830411

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