試驗旨在研究枯草期放牧東寶黑頭羊瘤胃內(nèi)環(huán)境參數(shù)及瘤胃細(xì)菌多樣性。采集枯草期牧草樣品,測定常規(guī)營養(yǎng)成分含量,選取6只體重為(45.24±1.25)kg的2歲全年放牧的東寶黑頭羊(公母各半),進(jìn)行耳牌標(biāo)記,在枯草期放牧前空腹經(jīng)口腔采集瘤胃液,用于分析瘤胃內(nèi)環(huán)境參數(shù)和瘤胃細(xì)菌多樣性。結(jié)果表明,東寶黑頭羊瘤胃液pH為6.65,氨態(tài)氮(NH3-N)濃度50.30 mg/L,乙酸/丙酸4.43;6個樣本共獲得290 868條高質(zhì)量16S rDNA序列,479.67個分類操作單元(OTU),東寶黑頭羊瘤胃細(xì)菌豐富度指數(shù)Ace指數(shù)、Chao1指數(shù)分別為523.31、533.79,α-多樣性指數(shù)Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)分別為6.39、0.96;經(jīng)物種注釋,共有15個門23個綱29個目34個科87個屬被鑒定。在門水平,擬桿菌門(Bacteroidetes,75.75%)、厚壁菌門(Firmicutes,15.62%)含量最多;在科水平,主要包括理研菌科(Rikenellaceae,45.89%)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae,19.18%);在屬水平,理研菌科RC9腸道群(Ri...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗地點及試驗設(shè)計
    1.2 樣品采集
        1.2.1 牧草采集
        1.2.2 瘤胃液采集
    1.3 樣品測定
        1.3.1 牧草營養(yǎng)成分
        1.3.2 瘤胃內(nèi)環(huán)境參數(shù)
        1.3.3 DNA提取及Mi Seq測序
    1.4 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 瘤胃內(nèi)環(huán)境參數(shù)
    2.2 OTU聚類和α-多樣性分析
    2.3 菌群結(jié)構(gòu)分析
3 小結(jié)與討論



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