肉牛脂肪沉積MiRNA的篩選及MiR-26a在不同部位中的表達(dá)分析
發(fā)布時間:2023-05-18 04:29
MicroRNA(miRNA)是一類由內(nèi)源基因編碼的長度約為20-24個核苷酸的非編碼單鏈RNA分子,可以通過RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體抑制靶基因的翻譯或降解mRNA來調(diào)控蛋白的表達(dá),越來越多的體內(nèi)以及體外實(shí)驗都證實(shí)了 miRNA在脂肪形成中起到非常重要的作用。本試驗以延邊黃牛為研究對象,采集60頭在相同條件下育肥至30月齡的延邊黃牛閹牛背最長肌組織,分別測定脂肪含量,并經(jīng)數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析,選出差異極顯著的高脂肪延邊黃牛10頭、低脂肪延邊黃牛10頭,并根據(jù)大理石花紋圖譜從中選取高脂肪組、低脂肪組各3頭做miRNA-seq和RNA-seq,從而篩選了與脂肪沉積相關(guān)表達(dá)差異的miRNA并應(yīng)用miRanda生物學(xué)軟件預(yù)測其可能存在的靶基因,并對差異靶基因進(jìn)行GO分析和KEGG分析,然后對測序結(jié)果進(jìn)行了qRT-PCR驗證,最后分析miRNA-26a在延邊黃牛不同部位中表達(dá)的規(guī)律。進(jìn)一步闡明miRNA在動物機(jī)體中肌內(nèi)脂肪生長發(fā)育過程中起到的調(diào)控作用,為今后延邊黃牛肉質(zhì)性狀的遺傳機(jī)理和高檔牛肉生產(chǎn)提供了理論基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)果如下:1、高低脂肪組背最長肌組織miRNA-seq結(jié)果表明:共有327個miRNA...
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1.1 延邊黃牛發(fā)展概況
1.2 肌內(nèi)脂肪
1.3 miRNA簡介
1.3.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)及其形成機(jī)制
1.3.2 miRNA的研究方法
1.3.3 miRNA的研究進(jìn)展
1.4 高通量測序在牛miRNA研究中的應(yīng)用
第二章 高低脂肪組miRNA-seq篩選差異miRNA與靶基因預(yù)測
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物
2.1.2 樣品采集
2.1.3 試驗分組
2.2 試驗方法
2.2.1 肉質(zhì)性狀測定
2.2.2 miRNA-Seq
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 測序數(shù)據(jù)
2.3.2 延邊黃牛高低脂肪組背最長肌差異表達(dá)miRNA的篩選
2.3.3 差異表達(dá)miRNA的聚類分析結(jié)果
2.3.4 差異表達(dá)miRNA的靶基因預(yù)測
2.3.5 差異miRNA靶基因的GO分析和KEGG分析
2.4 討論
2.5 本章小結(jié)
第三章 miRNA-seq結(jié)果的熒光定量PCR驗證
3.1 試驗材料
3.1.1 試驗動物
3.1.2 樣品采集
3.2 試驗方法
3.2.1 引物設(shè)計與合成
3.2.2 miRNA提取與質(zhì)檢
3.2.3 反轉(zhuǎn)錄
3.2.4 qRT-PCR
3.2.5 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 miRNA提取結(jié)果
3.3.2 差異表達(dá)miRNA的qRT-PCR驗證
3.4 討論
3.5 本章小結(jié)
第四章 miR-26a在延邊黃牛不同部位中表達(dá)的規(guī)律分析
4.1 試驗材料
4.1.1 試驗樣品
4.1.2 樣品采集
4.2 試驗方法
4.2.1 miRNA提取與質(zhì)檢
4.2.2 反轉(zhuǎn)錄
4.2.3 qRT-PCR
4.2.4 數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 miRNA提取結(jié)果
4.3.2 miR-26a在高低脂肪組不同部位中的表達(dá)
4.4 討論
4.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號:3818677
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1.1 延邊黃牛發(fā)展概況
1.2 肌內(nèi)脂肪
1.3 miRNA簡介
1.3.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)及其形成機(jī)制
1.3.2 miRNA的研究方法
1.3.3 miRNA的研究進(jìn)展
1.4 高通量測序在牛miRNA研究中的應(yīng)用
第二章 高低脂肪組miRNA-seq篩選差異miRNA與靶基因預(yù)測
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物
2.1.2 樣品采集
2.1.3 試驗分組
2.2 試驗方法
2.2.1 肉質(zhì)性狀測定
2.2.2 miRNA-Seq
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 測序數(shù)據(jù)
2.3.2 延邊黃牛高低脂肪組背最長肌差異表達(dá)miRNA的篩選
2.3.3 差異表達(dá)miRNA的聚類分析結(jié)果
2.3.4 差異表達(dá)miRNA的靶基因預(yù)測
2.3.5 差異miRNA靶基因的GO分析和KEGG分析
2.4 討論
2.5 本章小結(jié)
第三章 miRNA-seq結(jié)果的熒光定量PCR驗證
3.1 試驗材料
3.1.1 試驗動物
3.1.2 樣品采集
3.2 試驗方法
3.2.1 引物設(shè)計與合成
3.2.2 miRNA提取與質(zhì)檢
3.2.3 反轉(zhuǎn)錄
3.2.4 qRT-PCR
3.2.5 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 miRNA提取結(jié)果
3.3.2 差異表達(dá)miRNA的qRT-PCR驗證
3.4 討論
3.5 本章小結(jié)
第四章 miR-26a在延邊黃牛不同部位中表達(dá)的規(guī)律分析
4.1 試驗材料
4.1.1 試驗樣品
4.1.2 樣品采集
4.2 試驗方法
4.2.1 miRNA提取與質(zhì)檢
4.2.2 反轉(zhuǎn)錄
4.2.3 qRT-PCR
4.2.4 數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 miRNA提取結(jié)果
4.3.2 miR-26a在高低脂肪組不同部位中的表達(dá)
4.4 討論
4.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號:3818677
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