江西不同地方品種雞apoA-Ⅰ、apoB基因多態(tài)性與其脂肪代謝的關聯(lián)性分析
發(fā)布時間:2023-05-13 02:03
本試驗以崇仁麻雞、余干黑雞、海藍褐蛋雞、綠殼蛋雞、寧都三黃雞、安義瓦灰雞和泰和烏骨雞各50羽作為試驗材料,根據(jù)已公布雞的apoA-Ⅰ、apoB基因序列設計引物,利用PCR-DNA直接測序技術檢測apoA-Ⅰ、apoB基因SNPs和基因型分析,探討apoA-Ⅰ、apoB基因的多態(tài)性及其與脂肪代謝的關系。結果如下: 1、在apoA-Ⅰ基因序列起始密碼子ATG上游163bp處存在一個A/T突變,該突變產生AA、AB、BB基因型。基因型分析結果表明,余干黑雞以AB基因型為主導基因型,綠殼蛋雞、安義瓦灰雞和寧都三黃雞以BB基因型為主導基因型;余干黑雞和泰和烏骨雞以A基因為主要等位基因,綠殼蛋雞、安義瓦灰雞和寧都三黃雞以B基因為主要等位基因;不同品種雞apoA-Ⅰ基因的突變位點為中度多態(tài)位點。 2、在apoB基因序列的第26個外顯子123bp處產生T/G突變,并產生TT、TG、GG基因型。其中崇仁麻雞和泰和烏骨雞以TT基因型為主導基因型,余干黑雞、綠殼蛋雞、安義瓦灰雞和寧都三黃雞的TG基因型為主導基因型;不同品種雞均以T基因為主要等位基因;不同品種雞apoA-B基因的突變位點為中度多態(tài)位點。 3、...
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一部分 研究綜述
1 分子標記技術
2 新一代分子標記技術—單核苷酸多態(tài)性(SNPs)
2.1 單核苷酸多態(tài)性(SNPs)
2.2 SNPs 的檢測方法
2.2.1 PCR-RFLP
2.2.2 PCR-SSCP
2.2.3 變性高效液相色譜技術(DHPLC)
2.2.4 DNA 芯片技術(DNA chip)
2.2.5 PCR-DNA 直接測序
3 apoA-Ⅰ基因的研究進展
3.1 apoA-Ⅰ的結構特點
3.2 apoA-Ⅰ的分布特點
3.3 apoA-Ⅰ的功能特點
4 apoB 基因的研究進展
4.1 apoB 的結構特點
4.2 apoB 的功能特點
5 江西地方雞種概述
5.1 崇仁麻雞
5.2 余干黑雞
5.3 海藍褐蛋雞
5.4 綠殼蛋雞
5.5 安義瓦灰雞
5.6 寧都三黃雞
5.7 泰和烏骨雞
6 研究對不同品種雞的選育的原因
7 本研究目的和意義
第二部分 試驗研究
1 試驗材料和方法
1.1 試驗材料
1.1.0 材料來源
1.1.1 試驗方法
1.1.2 飼養(yǎng)管理
1.1.3 試驗儀器
1.1.4 試驗試劑
1.1.5 常用試劑的配制
1.1.6 主要分子生物學軟件
1.2 試驗流程
1.2.1 血液 DNA 的提取
1.2.2 DNA 濃度測定
1.2.3 引物的設計、合成和稀釋
1.2.4 PCR 擴增
1.2.5 PCR 擴增產物鑒定
1.2.6 測序
1.3 遺傳學統(tǒng)計分析
2 結果與分析
2.1 PCR 擴增產物
2.2 apoA-Ⅰ基因測序結果分析
2.2.1 崇仁麻雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.2 余干黑雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.3 海藍褐蛋雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.4 綠殼蛋雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.5 安義瓦灰雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.6 寧都三黃雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.7 泰和烏骨雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.3 apoB 基因測序結果分析
2.3.1 崇仁麻雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.2 余干黑雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.3 海藍褐蛋雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.4 綠殼蛋雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.5 安義瓦灰雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.6 寧都三黃雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.7 泰和烏骨雞 apoB 基因測序圖譜
2.4 apoA-Ⅰ基因的群體遺傳學分析
2.4.1 apoA-Ⅰ的不同基因型在不同品種雞群中的分布
2.4.2 apoA-Ⅰ基因的基因型頻率和等位基因頻率的分析
2.4.3 apoA-Ⅰ基因的多態(tài)性分析
2.4.4 apoA-Ⅰ基因的 Hardy-Weinberg 平衡檢驗
2.5 apoB 基因的群體遺傳學分析
2.5.0 apoB 的 3 種基因型在不同品種雞群中的分布
2.5.1 apoB 基因的基因型頻率和等位基因頻率分析
2.5.2 apoB 基因的多態(tài)性分析
2.5.3 apoB 基因的 Hardy-Weinberg 平衡檢驗
2.6 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的肝重、肝脂率、腹脂重、腹脂比率的關聯(lián)性分析
2.6.1 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的肝重的關聯(lián)性分析
2.6.2 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的肝脂率的關聯(lián)性分析
2.6.3 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的腹脂重的關聯(lián)性分析
2.6.4 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的腹脂比率的關聯(lián)性分析
2.7 apoB 基因不同基因型與四個品種雞的肝重、肝脂率、腹脂重、腹脂率的關聯(lián)性分析
2.7.1 ApoB 不同基因型與四個品種雞的肝重的關聯(lián)性分析
2.7.2 ApoB 不同基因型與四個品種雞的肝脂率的關聯(lián)性分析
2.7.3 ApoB 不同基因型與四個品種雞的腹脂重的關聯(lián)性分析
2.7.4 ApoB 不同基因型與四個品種雞的腹脂比率的關聯(lián)性分析
3 討論
3.1 基因多態(tài)性檢測方法的研究
3.2 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因的多態(tài)性研究
3.3 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因不同基因型及遺傳學研究
3.4 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因與脂肪代謝的關聯(lián)性研究
4 小結
4.1 本研究的主要成果
4.2 本研究的創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
附錄
本文編號:3815076
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一部分 研究綜述
1 分子標記技術
2 新一代分子標記技術—單核苷酸多態(tài)性(SNPs)
2.1 單核苷酸多態(tài)性(SNPs)
2.2 SNPs 的檢測方法
2.2.1 PCR-RFLP
2.2.2 PCR-SSCP
2.2.3 變性高效液相色譜技術(DHPLC)
2.2.4 DNA 芯片技術(DNA chip)
2.2.5 PCR-DNA 直接測序
3 apoA-Ⅰ基因的研究進展
3.1 apoA-Ⅰ的結構特點
3.2 apoA-Ⅰ的分布特點
3.3 apoA-Ⅰ的功能特點
4 apoB 基因的研究進展
4.1 apoB 的結構特點
4.2 apoB 的功能特點
5 江西地方雞種概述
5.1 崇仁麻雞
5.2 余干黑雞
5.3 海藍褐蛋雞
5.4 綠殼蛋雞
5.5 安義瓦灰雞
5.6 寧都三黃雞
5.7 泰和烏骨雞
6 研究對不同品種雞的選育的原因
7 本研究目的和意義
第二部分 試驗研究
1 試驗材料和方法
1.1 試驗材料
1.1.0 材料來源
1.1.1 試驗方法
1.1.2 飼養(yǎng)管理
1.1.3 試驗儀器
1.1.4 試驗試劑
1.1.5 常用試劑的配制
1.1.6 主要分子生物學軟件
1.2 試驗流程
1.2.1 血液 DNA 的提取
1.2.2 DNA 濃度測定
1.2.3 引物的設計、合成和稀釋
1.2.4 PCR 擴增
1.2.5 PCR 擴增產物鑒定
1.2.6 測序
1.3 遺傳學統(tǒng)計分析
2 結果與分析
2.1 PCR 擴增產物
2.2 apoA-Ⅰ基因測序結果分析
2.2.1 崇仁麻雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.2 余干黑雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.3 海藍褐蛋雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.4 綠殼蛋雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.5 安義瓦灰雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.6 寧都三黃雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.2.7 泰和烏骨雞 apoA-Ⅰ基因測序圖譜
2.3 apoB 基因測序結果分析
2.3.1 崇仁麻雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.2 余干黑雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.3 海藍褐蛋雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.4 綠殼蛋雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.5 安義瓦灰雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.6 寧都三黃雞 apoB 基因測序圖譜
2.3.7 泰和烏骨雞 apoB 基因測序圖譜
2.4 apoA-Ⅰ基因的群體遺傳學分析
2.4.1 apoA-Ⅰ的不同基因型在不同品種雞群中的分布
2.4.2 apoA-Ⅰ基因的基因型頻率和等位基因頻率的分析
2.4.3 apoA-Ⅰ基因的多態(tài)性分析
2.4.4 apoA-Ⅰ基因的 Hardy-Weinberg 平衡檢驗
2.5 apoB 基因的群體遺傳學分析
2.5.0 apoB 的 3 種基因型在不同品種雞群中的分布
2.5.1 apoB 基因的基因型頻率和等位基因頻率分析
2.5.2 apoB 基因的多態(tài)性分析
2.5.3 apoB 基因的 Hardy-Weinberg 平衡檢驗
2.6 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的肝重、肝脂率、腹脂重、腹脂比率的關聯(lián)性分析
2.6.1 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的肝重的關聯(lián)性分析
2.6.2 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的肝脂率的關聯(lián)性分析
2.6.3 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的腹脂重的關聯(lián)性分析
2.6.4 apoA-Ⅰ基因不同基因型與四個品種雞的腹脂比率的關聯(lián)性分析
2.7 apoB 基因不同基因型與四個品種雞的肝重、肝脂率、腹脂重、腹脂率的關聯(lián)性分析
2.7.1 ApoB 不同基因型與四個品種雞的肝重的關聯(lián)性分析
2.7.2 ApoB 不同基因型與四個品種雞的肝脂率的關聯(lián)性分析
2.7.3 ApoB 不同基因型與四個品種雞的腹脂重的關聯(lián)性分析
2.7.4 ApoB 不同基因型與四個品種雞的腹脂比率的關聯(lián)性分析
3 討論
3.1 基因多態(tài)性檢測方法的研究
3.2 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因的多態(tài)性研究
3.3 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因不同基因型及遺傳學研究
3.4 apoA-Ⅰ基因和 apoB 基因與脂肪代謝的關聯(lián)性研究
4 小結
4.1 本研究的主要成果
4.2 本研究的創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
附錄
本文編號:3815076
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