發(fā)布時間：2023-05-07 06:54

　　MicroRNA (miRNA)是非編碼小RNA家族的重要成員,長為22nt左右,它能負調(diào)控靶基因的表達。許多證據(jù)都證明了miRNA在肌肉的增殖,分化和發(fā)育的過程中都起著十分重要的作用。心肌和骨骼肌(如：背最長肌和腰大肌)同屬橫紋肌,但是它們在生物個體內(nèi)所行使的功能差異卻很大。豬在畜牧生產(chǎn)和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域都有非常重要的價值,且心肌與骨骼肌在miRNA表達譜上的研究報道都比較少。本研究利用Illumina高通量測序技術(shù)平臺構(gòu)建了3只210日齡雌性長白豬的心肌,背最長肌和腰大肌三個組織的小RNA文庫,得到的結(jié)果如下：1)心肌,背最長肌和腰大肌三個文庫共檢測得到56 M的原始數(shù)據(jù),其中高質(zhì)量讀段(high-quality reads)在心肌,背最長肌和腰大肌分別為20.31 M,15.87 M和17,93 M,這些測序讀段分別占了原始數(shù)據(jù)的94.12%,95.48%和97.14%；2)三個文庫共檢測得到907個非冗余的miRNA (unique miRNAs),其中有441個為三個庫共同表達,利用IDEG6進行差異顯著性檢驗,發(fā)現(xiàn)123個miRNA為三個文庫差異表達的miRNA (P<1...

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 文獻綜述
    1.1 心肌與骨骼肌
    1.2 豬是典型的的生物學(xué)研究模型
    1.3 MicroRNA研究進展
        1.3.1 MicroRNA的發(fā)現(xiàn)
        1.3.2 MicroRNA的生物合成
        1.3.3 MicroRNA的作用機制
        1.3.4 MicroRNA的典型特點
        1.3.5 MicroRNA的研究方法
    1.4 MicroRNA對肌肉的調(diào)控
        1.4.1 MicroRNA的生成對肌肉的作用
        1.4.2 MicroRNA影響肌肉生長發(fā)育
        1.4.3 MicroRNA與肌肉相關(guān)疾病
    1.5 高通量測序?qū)ωimicroRNA研究的推動
    1.6 本研究的意義和主要研究內(nèi)容
        1.6.1 研究意義
        1.6.2 主要研究內(nèi)容
2 材料與方法
    2.1 試驗材料
        2.1.1 樣品采集
        2.1.2 數(shù)據(jù)庫和生物軟件
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 主要儀器
    2.2 試驗方法
        2.2.1 組織樣品準備
        2.2.2 高通量測序及生物信息學(xué)分析
        2.2.3 熒光定量PCR分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 Total RNA提取結(jié)果
    3.2 測序數(shù)據(jù)概述
    3.3 miRNA表達譜鑒定
    3.4 miRNA在三個文庫的差異表達分析
    3.5 差異表達miRNA的生物學(xué)功能預(yù)測
    3.6 與信號通路相關(guān)的miRNA和mRNA
    3.7 高通量數(shù)據(jù)驗證
4 討論
    4.1 高通量測序結(jié)果可靠性
    4.2 心肌與兩種骨骼肌的差異性
    4.3 高表達的miRNA預(yù)示了重要的生物學(xué)功能
    4.4 胰島素信號通路miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
    4.5 鈣信號通路miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文



本文編號：3810504