基于轉(zhuǎn)錄組測序分析西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積相關(guān)基因的差異表達
發(fā)布時間:2023-05-07 03:47
肌內(nèi)脂肪(intramuscular fat, IMF)的含量和分布是形成牛大理石花紋肉的物質(zhì)基礎(chǔ)。西門塔爾牛(Bos taurus)和安格斯牛(B. taurus)的脂肪沉積能力不同,安格斯牛IMF含量顯著高于西門塔爾牛。本研究采用高通量測序技術(shù)篩選背膘脂肪沉積相關(guān)基因,旨在為西門塔爾牛和安格斯牛脂肪沉積機制研究提供參考依據(jù)。以西門塔爾牛和安格斯牛15月齡公牛各3頭進行育肥屠宰實驗,對屠宰后的胴體進行肉質(zhì)性狀測定。取兩個品種牛背膘脂肪組織進行轉(zhuǎn)錄組測序和生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,2個品種牛在粗脂肪、滴水損失、眼肌面積和pH方面差異不顯著,西門塔爾牛剪切力顯著高于安格斯牛(P<0.01)。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明,2個品種的牛在背膘脂肪組織存在1 296個差異表達基因,主要富集在代謝、生長、發(fā)育等55個功能條目和脂質(zhì)代謝、碳水化合物代謝、能量代謝等44條代謝通路;根據(jù)通路和功能分析,選擇丙酮酸脫氫酶激酶4 (pyruvate dehydrogenase kinase 4, PDK4)、核受體第4亞族A組成員1 (nuclear receptor subfamily 4 group ...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 屠宰實驗性狀測定
1.2 轉(zhuǎn)錄組測序
1.3 測序數(shù)據(jù)處理與注釋
1.4 脂肪沉積差異表達基因篩選及分析
1.5 實時熒光定量PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 肉質(zhì)性狀比較
2.2 測序數(shù)據(jù)分析
2.3 脂肪沉積相關(guān)的差異表達基因篩選及分析
2.4 差異表達基因的實時熒光定量PCR驗證
3 討論
4 結(jié)論
本文編號:3810216
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 屠宰實驗性狀測定
1.2 轉(zhuǎn)錄組測序
1.3 測序數(shù)據(jù)處理與注釋
1.4 脂肪沉積差異表達基因篩選及分析
1.5 實時熒光定量PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 肉質(zhì)性狀比較
2.2 測序數(shù)據(jù)分析
2.3 脂肪沉積相關(guān)的差異表達基因篩選及分析
2.4 差異表達基因的實時熒光定量PCR驗證
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