試驗旨在探究綿羊CARTPT基因所編碼蛋白的結(jié)構(gòu)與功能,利用生物信息學(xué)軟件研究其理化性質(zhì)、親疏水性、信號肽、跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位和蛋白結(jié)構(gòu)域、糖基化和磷酸化位點,并構(gòu)建不同物種的CARTPT基因的系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明:綿羊CARTPT基因CDS區(qū)全序列長為351 bp,編碼116個氨基酸,編碼蛋白的相對分子質(zhì)量12 790.18 Da,理論等電點8.22,脂肪系數(shù)114.48,總平均親水性-0.006,屬于分泌蛋白,沒有跨膜區(qū)域結(jié)構(gòu);二級結(jié)構(gòu)中主要以α-螺旋與無規(guī)則卷曲為主;亞細(xì)胞定位分析預(yù)測該蛋白最可能在細(xì)胞外基質(zhì)發(fā)揮其生物學(xué)作用,有1個跨膜結(jié)構(gòu)域;該蛋白質(zhì)有5個絲氨酸(Ser)、1個蘇氨酸(Thr)、2個酪氨酸(Tyr)磷酸化位點;系統(tǒng)進化樹發(fā)現(xiàn)綿羊與山羊親緣關(guān)系最近。

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 CARTPT基因序列來源
    1.2 試驗方法
2 結(jié)果與分析
    2.1 綿羊CARTPT蛋白基本理化性質(zhì)
    2.2 綿羊CARTPT基因編碼的蛋白質(zhì)疏水性與親水性分析
    2.3 綿羊CARTPT蛋白信號肽和跨膜螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.4 綿羊CARTPT基因編碼蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.5 綿羊CARTPT蛋白亞細(xì)胞定位與結(jié)構(gòu)域的預(yù)測
    2.6 綿羊CARTPT蛋白磷酸化位點與糖基化位點預(yù)測
    2.7 物種間CARTPT基因核苷酸同源性比較
3 討論
4 結(jié)論



本文編號：3806809