綿羊CARTPT基因的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-05-03 13:40
試驗(yàn)旨在探究綿羊CARTPT基因所編碼蛋白的結(jié)構(gòu)與功能,利用生物信息學(xué)軟件研究其理化性質(zhì)、親疏水性、信號(hào)肽、跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)與三級(jí)結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位和蛋白結(jié)構(gòu)域、糖基化和磷酸化位點(diǎn),并構(gòu)建不同物種的CARTPT基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果表明:綿羊CARTPT基因CDS區(qū)全序列長(zhǎng)為351 bp,編碼116個(gè)氨基酸,編碼蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量12 790.18 Da,理論等電點(diǎn)8.22,脂肪系數(shù)114.48,總平均親水性-0.006,屬于分泌蛋白,沒(méi)有跨膜區(qū)域結(jié)構(gòu);二級(jí)結(jié)構(gòu)中主要以α-螺旋與無(wú)規(guī)則卷曲為主;亞細(xì)胞定位分析預(yù)測(cè)該蛋白最可能在細(xì)胞外基質(zhì)發(fā)揮其生物學(xué)作用,有1個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域;該蛋白質(zhì)有5個(gè)絲氨酸(Ser)、1個(gè)蘇氨酸(Thr)、2個(gè)酪氨酸(Tyr)磷酸化位點(diǎn);系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)發(fā)現(xiàn)綿羊與山羊親緣關(guān)系最近。
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 CARTPT基因序列來(lái)源
1.2 試驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 綿羊CARTPT蛋白基本理化性質(zhì)
2.2 綿羊CARTPT基因編碼的蛋白質(zhì)疏水性與親水性分析
2.3 綿羊CARTPT蛋白信號(hào)肽和跨膜螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4 綿羊CARTPT基因編碼蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.5 綿羊CARTPT蛋白亞細(xì)胞定位與結(jié)構(gòu)域的預(yù)測(cè)
2.6 綿羊CARTPT蛋白磷酸化位點(diǎn)與糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2.7 物種間CARTPT基因核苷酸同源性比較
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3806809
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 CARTPT基因序列來(lái)源
1.2 試驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 綿羊CARTPT蛋白基本理化性質(zhì)
2.2 綿羊CARTPT基因編碼的蛋白質(zhì)疏水性與親水性分析
2.3 綿羊CARTPT蛋白信號(hào)肽和跨膜螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4 綿羊CARTPT基因編碼蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.5 綿羊CARTPT蛋白亞細(xì)胞定位與結(jié)構(gòu)域的預(yù)測(cè)
2.6 綿羊CARTPT蛋白磷酸化位點(diǎn)與糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2.7 物種間CARTPT基因核苷酸同源性比較
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3806809
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