H9N2禽流感病毒分子進化和致病性研究
發(fā)布時間:2023-04-12 02:35
H9N2亞型禽流感(AI)持續(xù)在我國雞群中廣泛流行,不僅可以感染禽類,還可以感染哺乳動物以及人類,為了明確山東及周邊養(yǎng)殖場H9N2亞型禽流感病毒(AIV)的分子進化情況及其致病性,本研究在2016年2019年間從山東及周邊養(yǎng)殖場病雞、病鴨等分離鑒定出37株H9N2 AIV,經病毒純化后,將病毒各基因片段進行RT-PCR擴增和克隆測序,獲得各分離株全基因組序列,并進行遺傳演化和重要的氨基酸位點的變異分析。結果顯示:37株H9N2 AIV 8個基因片段均屬于歐亞譜系,但8個基因片段的分子進化關系呈現出基因多樣性:37株HA和NA基因來自Y280-like;HA基因之間的核苷酸同源性為92.2%99.9%,NA基因之間的核苷酸同源性為90.6%99.9%;M、NS基因來自G1-like;PA、NP、PB1基因來自F98-like;PB2基因來自G9-like。HA蛋白的受體結合位點149、198、234和235位點變異最多,37株分離株HA第234位氨基酸(相當于H3第226位氨基酸)全部由Q突變?yōu)長,235位點全部突變?yōu)镸,...
【文章頁數】:96 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號說明
第一部分 文獻綜述
1 禽流感病毒概述
1.1 流感病毒特點與分類
1.2 流感病毒的流行史
1.3 主要蛋白
2 流感病毒受體
3 H9N2 AIV突變及致病性
4 分子模擬技術在流感病毒突變研究中的應用
5 研究目的和意義
第二部分 試驗研究
第一章 H9N2 亞型AIV的全基因組測序、遺傳進化與抗原變異分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 引物設計
1.3 H9N2 亞型AIV的鑒定
1.4 病毒的純化
1.5 提取病毒RNA
1.6 PCR產物膠回收
1.7 連接與轉化
1.8 菌液PCR鑒定
1.9 序列分析
1.10 H9N2 AIV抗原性分析
2 結果與分析
2.1 病毒的分離與鑒定
2.2 序列測序結果
2.3 抗原性分析結果
3 討論
4 小結
第二章 H9N2 亞型AIV的致病性分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 H9N2 AIV的生物學測定
1.3 H9N2 AIV感染SPF雞的研究
1.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
2 結果與分析
2.1 雞胚半數感染量(EID50)測定結果
2.2 組織半數感染量(TCID50)測定
2.3 H9N2 AIV感染SPF雞的研究
2.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
3 討論
4 小結
第三章 HA關鍵突變位點預測與HA差異互作宿主蛋白篩選
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 受體結合位點關鍵氨基酸突變位點預測
1.3 突變質粒的構建
1.4 突變病毒的拯救及鑒定
1.5 突變毒株TCID50測定
1.6 突變毒株復制動力學
1.7 H9N2 AIV變異HA蛋白差異互作宿主蛋白篩選
2 結果與分析
2.1 HA受體結合位點關鍵氨基酸突變位點預測結果
2.2 突變毒株拯救結果
2.3 突變毒株TCID50測定結果
2.4 突變株CK/SD/903(N218Q)復制動力學
2.5 H9N2 AIV變異HA蛋白互作宿主差異蛋白鑒定結果
3 討論
4 小結
結論
參考文獻
致謝
攻讀學位期間發(fā)表的學術論著
附錄
參與課題情況
本文編號:3790251
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第一部分 文獻綜述
1 禽流感病毒概述
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1.2 流感病毒的流行史
1.3 主要蛋白
2 流感病毒受體
3 H9N2 AIV突變及致病性
4 分子模擬技術在流感病毒突變研究中的應用
5 研究目的和意義
第二部分 試驗研究
第一章 H9N2 亞型AIV的全基因組測序、遺傳進化與抗原變異分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 引物設計
1.3 H9N2 亞型AIV的鑒定
1.4 病毒的純化
1.5 提取病毒RNA
1.6 PCR產物膠回收
1.7 連接與轉化
1.8 菌液PCR鑒定
1.9 序列分析
1.10 H9N2 AIV抗原性分析
2 結果與分析
2.1 病毒的分離與鑒定
2.2 序列測序結果
2.3 抗原性分析結果
3 討論
4 小結
第二章 H9N2 亞型AIV的致病性分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 H9N2 AIV的生物學測定
1.3 H9N2 AIV感染SPF雞的研究
1.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
2 結果與分析
2.1 雞胚半數感染量(EID50)測定結果
2.2 組織半數感染量(TCID50)測定
2.3 H9N2 AIV感染SPF雞的研究
2.4 H9N2 AIV感染BALB/c雌鼠的研究
3 討論
4 小結
第三章 HA關鍵突變位點預測與HA差異互作宿主蛋白篩選
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 受體結合位點關鍵氨基酸突變位點預測
1.3 突變質粒的構建
1.4 突變病毒的拯救及鑒定
1.5 突變毒株TCID50測定
1.6 突變毒株復制動力學
1.7 H9N2 AIV變異HA蛋白差異互作宿主蛋白篩選
2 結果與分析
2.1 HA受體結合位點關鍵氨基酸突變位點預測結果
2.2 突變毒株拯救結果
2.3 突變毒株TCID50測定結果
2.4 突變株CK/SD/903(N218Q)復制動力學
2.5 H9N2 AIV變異HA蛋白互作宿主差異蛋白鑒定結果
3 討論
4 小結
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本文編號:3790251
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